More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0993 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0993  translation initiation factor IF-3  100 
 
 		 156 aa  312  9e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00820  translation initiation factor IF-3  83.44 
 
 		 155 aa  261  3e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.218786  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0025  initiation factor 3  79.07 
 
 		 129 aa  217  6e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0991  translation initiation factor IF-3  69.54 
 
 		 201 aa  213  5.9999999999999996e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1907  translation initiation factor IF-3  67.31 
 
 		 189 aa  203  8e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0560  translation initiation factor IF-3  58.94 
 
 		 186 aa  193  7e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00554989 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2218  translation initiation factor IF-3  67.55 
 
 		 185 aa  190  5e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0420504 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644  translation initiation factor IF-3  67.55 
 
 		 186 aa  183  6e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00296657  normal  0.0579282 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3743  translation initiation factor IF-3  63.46 
 
 		 239 aa  180  7e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0674596  hitchhiker  0.00196724 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1222  translation initiation factor IF-3  63.23 
 
 		 176 aa  171  5e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000572155  hitchhiker  0.00763284 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  50.99 
 
 		 173 aa  164  4e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  50.33 
 
 		 197 aa  158  3e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 202 aa  152  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2172  translation initiation factor IF-3  49.66 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000864988  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2996  translation initiation factor IF-3  46.15 
 
 		 173 aa  151  4e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1763  translation initiation factor 3  51.09 
 
 		 137 aa  150  5e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  47.13 
 
 		 238 aa  150  8.999999999999999e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1613  translation initiation factor IF-3  51.82 
 
 		 145 aa  150  8.999999999999999e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000306668  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  45.51 
 
 		 219 aa  149  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  46.81 
 
 		 164 aa  148  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0724  translation initiation factor IF-3  47.62 
 
 		 194 aa  147  6e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000346718  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  50.65 
 
 		 194 aa  147  7e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  50.65 
 
 		 194 aa  147  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2307  translation initiation factor IF-3  46 
 
 		 154 aa  147  7e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00282878  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  50.97 
 
 		 194 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  45.22 
 
 		 225 aa  146  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  46.05 
 
 		 171 aa  146  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000964088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  47.37 
 
 		 190 aa  145  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  44.74 
 
 		 179 aa  144  6e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  46.2 
 
 		 178 aa  142  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  44.08 
 
 		 154 aa  142  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  46.41 
 
 		 207 aa  142  1e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1301  translation initiation factor 3  44.08 
 
 		 175 aa  143  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.444006  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  45.45 
 
 		 165 aa  142  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1778  translation initiation factor IF-3  46.79 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.843423 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4616  translation initiation factor 3  46.79 
 
 		 156 aa  141  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00507113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1400  translation initiation factor IF-3  46.79 
 
 		 156 aa  141  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0821028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1161  translation initiation factor 3  47.4 
 
 		 154 aa  141  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.930143 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1453  translation initiation factor IF-3  46.79 
 
 		 156 aa  141  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0525841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0994  translation initiation factor IF-3  46.79 
 
 		 156 aa  141  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1360  translation initiation factor IF-3  46.79 
 
 		 156 aa  141  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.485624  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1476  translation initiation factor IF-3  46.79 
 
 		 156 aa  141  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348442  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  46.41 
 
 		 198 aa  141  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2459  translation initiation factor 3  47.44 
 
 		 243 aa  141  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0522  translation initiation factor IF-3  46.48 
 
 		 193 aa  140  9e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000692532  hitchhiker  0.000000579185 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  45.75 
 
 		 198 aa  140  9e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000135112  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2858  translation initiation factor 3  48.03 
 
 		 173 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.357759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1412  translation initiation factor IF-3  45.77 
 
 		 143 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000852308  normal  0.493061 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1311  translation initiation factor IF-3  47.52 
 
 		 164 aa  138  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000644552  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1968  translation initiation factor IF-3  46.15 
 
 		 183 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00361564  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3480  translation initiation factor IF-3  46.15 
 
 		 183 aa  138  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0422454  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2466  translation initiation factor IF-3  46.15 
 
 		 177 aa  138  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00240261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0983  translation initiation factor IF-3  45.51 
 
 		 176 aa  138  3e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.104 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3224  translation initiation factor IF-3  46.15 
 
 		 183 aa  138  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51494 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3622  translation initiation factor IF-3  42.76 
 
 		 357 aa  138  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0913675  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3261  translation initiation factor IF-3  44.08 
 
 		 195 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000125648  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2066  translation initiation factor 3  46.05 
 
 		 179 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.383221  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0766  translation initiation factor IF-3  46.1 
 
 		 181 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1372  translation initiation factor 3  45.51 
 
 		 156 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0696405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  43.67 
 
 		 173 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1557  translation initiation factor IF-3  44.23 
 
 		 156 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2755  translation initiation factor IF-3  45.51 
 
 		 156 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22658  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2418  translation initiation factor IF-3  46.71 
 
 		 196 aa  137  4.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  47.44 
 
 		 225 aa  137  4.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3071  translation initiation factor IF-3  45.39 
 
 		 182 aa  137  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427548  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2139  translation initiation factor IF-3  48.08 
 
 		 177 aa  137  7.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0045601  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11658  translation initiation factor IF-3  44.74 
 
 		 201 aa  136  7.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4675  translation initiation factor IF-3  45.39 
 
 		 177 aa  137  7.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.361003  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  43.42 
 
 		 202 aa  136  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1713  translation initiation factor IF-3  44.87 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225755  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  43.42 
 
 		 166 aa  136  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000012216  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1095  translation initiation factor IF-3  44.87 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.171775  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1316  translation initiation factor IF-3  46.15 
 
 		 351 aa  135  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1891  translation initiation factor IF-3  44.87 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1538  translation initiation factor IF-3  44.87 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  42.76 
 
 		 186 aa  135  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000690292  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3090  translation initiation factor IF-3  46.79 
 
 		 179 aa  136  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.639467  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3488  translation initiation factor 3  48.68 
 
 		 173 aa  136  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2594  translation initiation factor IF-3  44.87 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  44.74 
 
 		 205 aa  136  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2103  translation initiation factor 3  46.15 
 
 		 177 aa  136  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  0.133955 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  46.05 
 
 		 227 aa  136  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  44.68 
 
 		 190 aa  136  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0201  translation initiation factor IF-3  44.87 
 
 		 156 aa  135  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00116998  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  44.08 
 
 		 173 aa  136  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0964  translation initiation factor IF-3  44.87 
 
 		 156 aa  135  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.698743  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1736  translation initiation factor IF-3  44.87 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  43.42 
 
 		 166 aa  136  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000101645  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  43.59 
 
 		 172 aa  135  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4699  translation initiation factor IF-3  42.76 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000260309  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  42.76 
 
 		 195 aa  135  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000432272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4471  translation initiation factor IF-3  42.76 
 
 		 195 aa  135  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4306  translation initiation factor IF-3  42.76 
 
 		 195 aa  135  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000145665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4317  translation initiation factor IF-3  42.76 
 
 		 195 aa  135  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000117232  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2638  translation initiation factor IF-3  46.21 
 
 		 169 aa  135  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.294805  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0065  translation initiation factor IF-3  45.39 
 
 		 184 aa  135  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2042  translation initiation factor IF-3  44.87 
 
 		 199 aa  135  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0708817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0930  translation initiation factor 3  44.68 
 
 		 178 aa  135  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4690  translation initiation factor IF-3  42.76 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.37112e-62 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2038  translation initiation factor IF-3  45.39 
 
 		 177 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.369536 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>