More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0798 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  100 
 
 		 202 aa  411  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  94.54 
 
 		 190 aa  349  2e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  77.95 
 
 		 195 aa  314  5e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000432272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4471  translation initiation factor IF-3  77.95 
 
 		 195 aa  314  5e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4306  translation initiation factor IF-3  77.95 
 
 		 195 aa  314  5e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000145665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4317  translation initiation factor IF-3  77.95 
 
 		 195 aa  314  5e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000117232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  82.58 
 
 		 186 aa  311  3.9999999999999997e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000690292  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3261  translation initiation factor IF-3  80.34 
 
 		 195 aa  302  3.0000000000000004e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000125648  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  83.64 
 
 		 166 aa  288  3e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000101645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  83.64 
 
 		 166 aa  288  3e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000012216  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4690  translation initiation factor IF-3  83.03 
 
 		 166 aa  288  4e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.37112e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4699  translation initiation factor IF-3  83.03 
 
 		 166 aa  288  4e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000260309  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4406  translation initiation factor IF-3  83.03 
 
 		 166 aa  288  6e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000111711  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1244  translation initiation factor IF-3  74.39 
 
 		 175 aa  234  5.0000000000000005e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000317297  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1772  translation initiation factor IF-3  74.53 
 
 		 200 aa  233  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000139127  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1738  translation initiation factor IF-3  74.53 
 
 		 200 aa  233  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000196833  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1241  translation initiation factor 3  66.27 
 
 		 170 aa  232  3e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000256408  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1409  translation initiation factor IF-3  65.64 
 
 		 172 aa  224  5.0000000000000005e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.37178e-16  unclonable  1.3418400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1225  translation initiation factor 3  64.42 
 
 		 164 aa  222  3e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000314962  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  58.72 
 
 		 198 aa  219  3e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  59.88 
 
 		 179 aa  214  5e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1204  translation initiation factor IF-3  61.68 
 
 		 171 aa  206  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000244125  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1384  translation initiation factor IF-3  64.37 
 
 		 176 aa  206  2e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000113221  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  54.34 
 
 		 187 aa  206  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  56.1 
 
 		 164 aa  205  4e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  58.64 
 
 		 172 aa  202  4e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1089  translation initiation factor IF-3  62.64 
 
 		 176 aa  201  5e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000188384  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  59.63 
 
 		 238 aa  199  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1311  translation initiation factor IF-3  54.6 
 
 		 164 aa  198  5e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000644552  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2172  translation initiation factor IF-3  58.67 
 
 		 154 aa  197  7e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000864988  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  59.01 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  52.91 
 
 		 219 aa  196  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  58.17 
 
 		 165 aa  194  7e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2054  translation initiation factor IF-3  56.95 
 
 		 152 aa  192  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000423398  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  52.35 
 
 		 171 aa  191  7e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000964088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3163  translation initiation factor IF-3  55.21 
 
 		 252 aa  190  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  52.17 
 
 		 202 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  56.17 
 
 		 190 aa  189  2.9999999999999997e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  55.19 
 
 		 154 aa  188  5e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  56.79 
 
 		 178 aa  188  5.999999999999999e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  56.17 
 
 		 178 aa  187  8e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1249  translation initiation factor IF-3  54.55 
 
 		 174 aa  187  8e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.246001 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0766  translation initiation factor IF-3  55.19 
 
 		 181 aa  187  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0641  translation initiation factor IF-3  53.09 
 
 		 175 aa  187  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2146  translation initiation factor IF-3  58.33 
 
 		 173 aa  186  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000692224  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1858  translation initiation factor IF-3  58.33 
 
 		 173 aa  186  3e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000644129  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2033  translation initiation factor IF-3  56.7 
 
 		 216 aa  185  4e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000152468  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  49.38 
 
 		 174 aa  183  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3052  translation initiation factor IF-3  54.04 
 
 		 182 aa  183  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2666  translation initiation factor IF-3  50.31 
 
 		 176 aa  182  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1301  translation initiation factor 3  53.55 
 
 		 175 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.444006  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1823  translation initiation factor 3 (bIF-3)  62.09 
 
 		 153 aa  181  6e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000272282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0441  translation initiation factor IF-3  52.47 
 
 		 179 aa  181  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.077533  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2109  translation initiation factor IF-3  50.31 
 
 		 219 aa  181  8.000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000273336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1613  translation initiation factor IF-3  56.64 
 
 		 145 aa  181  9.000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000306668  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2996  translation initiation factor IF-3  51.57 
 
 		 173 aa  180  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2038  translation initiation factor IF-3  51.23 
 
 		 177 aa  180  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.369536 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4675  translation initiation factor IF-3  51.23 
 
 		 177 aa  180  1e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.361003  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  50 
 
 		 207 aa  180  1e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  49.39 
 
 		 194 aa  180  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0447  translation initiation factor IF-3  56.44 
 
 		 164 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000472838  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  51.23 
 
 		 178 aa  178  4.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2538  translation initiation factor IF-3  50.93 
 
 		 173 aa  178  4.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.838605  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0428  translation initiation factor IF-3  52.94 
 
 		 156 aa  178  5.999999999999999e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0065  translation initiation factor IF-3  51.23 
 
 		 184 aa  177  7e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  48.78 
 
 		 194 aa  177  8e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  48.78 
 
 		 194 aa  177  8e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1678  translation initiation factor IF-3  52.8 
 
 		 170 aa  177  1e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0127847  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0660  translation initiation factor IF-3  48.48 
 
 		 176 aa  177  1e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000367528  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3158  translation initiation factor IF-3  49.38 
 
 		 173 aa  177  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1875  translation initiation factor IF-3  46.7 
 
 		 239 aa  176  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.384688 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3488  translation initiation factor 3  55.28 
 
 		 173 aa  176  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  49.41 
 
 		 173 aa  176  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0930  translation initiation factor 3  50 
 
 		 178 aa  176  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2307  translation initiation factor IF-3  50.99 
 
 		 154 aa  176  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00282878  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4742  translation initiation factor IF-3  46.91 
 
 		 176 aa  175  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.676759  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3622  translation initiation factor IF-3  51.55 
 
 		 357 aa  175  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0913675  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  52.17 
 
 		 192 aa  175  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14590  translation initiation factor 3  46.39 
 
 		 401 aa  175  3e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1218  translation initiation factor IF-3  51.95 
 
 		 173 aa  175  4e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0326522  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1314  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 185 aa  175  5e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241721  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  50.62 
 
 		 173 aa  175  5e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  51.5 
 
 		 225 aa  175  5e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0803  translation initiation factor IF-3  46.33 
 
 		 178 aa  174  7e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  50.9 
 
 		 227 aa  174  8e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4232  translation initiation factor IF-3  46.91 
 
 		 173 aa  174  8e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738998 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2619  translation initiation factor IF-3  55.9 
 
 		 176 aa  174  9e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0221  translation initiation factor IF-3  50.31 
 
 		 186 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00015702  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  48.75 
 
 		 173 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 205 aa  173  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1882  translation initiation factor IF-3  51.55 
 
 		 204 aa  173  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0284235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3328  translation initiation factor IF-3  47.67 
 
 		 243 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.825238  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11658  translation initiation factor IF-3  49.42 
 
 		 201 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1612  translation initiation factor IF-3  48.15 
 
 		 173 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1906  translation initiation factor IF-3  48.77 
 
 		 173 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2150  translation initiation factor IF-3  49.38 
 
 		 173 aa  173  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2103  translation initiation factor 3  51.61 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  0.133955 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1800  translation initiation factor 3  51.23 
 
 		 163 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00939294  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1624  translation initiation factor IF-3  48.77 
 
 		 176 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101313 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  49.38 
 
 		 173 aa  173  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>