More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_2054 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_2054  translation initiation factor IF-3  100 
 
 
152 aa  309  9e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000423398  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  60.26 
 
 
165 aa  206  8e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1225  translation initiation factor 3  59.21 
 
 
164 aa  204  5e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000314962  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  57.89 
 
 
187 aa  200  5e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  55.26 
 
 
164 aa  199  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1204  translation initiation factor IF-3  60.53 
 
 
171 aa  194  4.0000000000000005e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000244125  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  56.29 
 
 
154 aa  193  6e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1311  translation initiation factor IF-3  55.26 
 
 
164 aa  193  9e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000644552  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2172  translation initiation factor IF-3  52.32 
 
 
154 aa  192  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000864988  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  56.95 
 
 
202 aa  192  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  55.63 
 
 
179 aa  188  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  55.63 
 
 
190 aa  185  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  54.67 
 
 
202 aa  185  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1613  translation initiation factor IF-3  57.14 
 
 
145 aa  180  6e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000306668  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  54.61 
 
 
198 aa  179  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2038  translation initiation factor IF-3  50.66 
 
 
177 aa  178  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.369536 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2666  translation initiation factor IF-3  52.63 
 
 
176 aa  176  7e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1823  translation initiation factor 3 (bIF-3)  58.55 
 
 
153 aa  176  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000272282  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4675  translation initiation factor IF-3  50 
 
 
177 aa  176  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.361003  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1419  translation initiation factor IF-3  53.47 
 
 
146 aa  174  4e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000288109  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1713  translation initiation factor IF-3  51.32 
 
 
156 aa  173  8e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225755  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1095  translation initiation factor IF-3  51.32 
 
 
156 aa  173  8e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.171775  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1891  translation initiation factor IF-3  51.32 
 
 
156 aa  173  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2594  translation initiation factor IF-3  51.32 
 
 
156 aa  173  8e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1538  translation initiation factor IF-3  51.32 
 
 
156 aa  173  8e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0201  translation initiation factor IF-3  51.32 
 
 
156 aa  173  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00116998  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1736  translation initiation factor IF-3  51.32 
 
 
156 aa  173  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0964  translation initiation factor IF-3  51.32 
 
 
156 aa  173  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.698743  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  52 
 
 
238 aa  173  8e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0065  translation initiation factor IF-3  51.32 
 
 
184 aa  172  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  50.33 
 
 
195 aa  171  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000432272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4471  translation initiation factor IF-3  50.33 
 
 
195 aa  171  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4306  translation initiation factor IF-3  50.33 
 
 
195 aa  171  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000145665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4317  translation initiation factor IF-3  50.33 
 
 
195 aa  171  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000117232  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3261  translation initiation factor IF-3  50.33 
 
 
195 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000125648  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0766  translation initiation factor IF-3  49.34 
 
 
181 aa  171  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  49.35 
 
 
219 aa  172  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4690  translation initiation factor IF-3  50.33 
 
 
166 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.37112e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  50.33 
 
 
186 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000690292  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  51.97 
 
 
190 aa  171  2.9999999999999996e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4699  translation initiation factor IF-3  50.33 
 
 
166 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000260309  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  49.67 
 
 
166 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000101645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  49.67 
 
 
166 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000012216  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0441  translation initiation factor IF-3  51.32 
 
 
179 aa  171  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.077533  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  51.63 
 
 
194 aa  170  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1557  translation initiation factor IF-3  48.68 
 
 
156 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1763  translation initiation factor 3  57.58 
 
 
137 aa  170  6.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4406  translation initiation factor IF-3  49.67 
 
 
166 aa  169  7.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000111711  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1968  translation initiation factor IF-3  52.63 
 
 
183 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00361564  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3224  translation initiation factor IF-3  52.63 
 
 
183 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.51494 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3480  translation initiation factor IF-3  52.63 
 
 
183 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0422454  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1241  translation initiation factor 3  48.67 
 
 
170 aa  169  2e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000256408  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2466  translation initiation factor IF-3  52.63 
 
 
177 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00240261  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  51.32 
 
 
178 aa  168  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2002  translation initiation factor 3  52.03 
 
 
153 aa  168  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112753  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  50.99 
 
 
171 aa  169  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000964088  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  49.67 
 
 
173 aa  167  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  51.32 
 
 
178 aa  168  3e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  50 
 
 
173 aa  168  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  50.33 
 
 
194 aa  167  4e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  50.33 
 
 
194 aa  167  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0488  translation initiation factor IF-3  50.66 
 
 
184 aa  167  5e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.270402  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  49.33 
 
 
225 aa  167  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0447  translation initiation factor IF-3  55.26 
 
 
164 aa  166  7e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000472838  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0830  translation initiation factor IF-3  51.33 
 
 
169 aa  166  9e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.124767  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4616  translation initiation factor 3  51.39 
 
 
156 aa  166  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00507113  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1778  translation initiation factor IF-3  50.69 
 
 
156 aa  166  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.843423 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  48.34 
 
 
174 aa  166  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1372  translation initiation factor 3  49.31 
 
 
156 aa  166  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0696405  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1400  translation initiation factor IF-3  48.68 
 
 
156 aa  166  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0821028  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0994  translation initiation factor IF-3  51.39 
 
 
156 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1301  translation initiation factor 3  52.63 
 
 
175 aa  166  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.444006  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  50.99 
 
 
192 aa  166  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1360  translation initiation factor IF-3  48.68 
 
 
156 aa  166  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.485624  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1453  translation initiation factor IF-3  51.39 
 
 
156 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0525841  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1476  translation initiation factor IF-3  51.39 
 
 
156 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348442  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2755  translation initiation factor IF-3  49.31 
 
 
156 aa  165  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22658  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1161  translation initiation factor 3  48.68 
 
 
154 aa  164  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.930143 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1314  translation initiation factor IF-3  50.33 
 
 
185 aa  164  2.9999999999999998e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241721  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2619  translation initiation factor IF-3  55.26 
 
 
176 aa  164  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0803  translation initiation factor IF-3  50.33 
 
 
178 aa  164  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1924  translation initiation factor IF-3  53.29 
 
 
177 aa  164  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2538  translation initiation factor IF-3  47.68 
 
 
173 aa  164  5e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.838605  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0265  translation initiation factor IF-3  50.33 
 
 
173 aa  164  5e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.910814  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0930  translation initiation factor 3  49.01 
 
 
178 aa  164  5e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4232  translation initiation factor IF-3  48.34 
 
 
173 aa  163  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00738998 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  48.65 
 
 
178 aa  163  5.9999999999999996e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0428  translation initiation factor IF-3  48.68 
 
 
156 aa  163  6.9999999999999995e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4742  translation initiation factor IF-3  47.68 
 
 
176 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.676759  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  47.37 
 
 
173 aa  160  7e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2150  translation initiation factor IF-3  48.34 
 
 
173 aa  160  7e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235978  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0412  translation initiation factor IF-3  51.75 
 
 
144 aa  160  7e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.601649  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1768  translation initiation factor IF-3  49.33 
 
 
221 aa  160  8.000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.40976 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3163  translation initiation factor IF-3  49.33 
 
 
252 aa  159  9e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170352  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2613  translation initiation factor IF-3  48.03 
 
 
172 aa  159  9e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0154974  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1008  translation initiation factor 3  48.03 
 
 
155 aa  159  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0442083  hitchhiker  0.00912814 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1932  translation initiation factor IF-3  52.63 
 
 
177 aa  159  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00133999  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2747  translation initiation factor IF-3  47.02 
 
 
169 aa  159  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.128829 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2242  translation initiation factor IF-3  48.03 
 
 
166 aa  159  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000466118  hitchhiker  0.00531509 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0200  translation initiation factor IF-3  47.68 
 
 
151 aa  159  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>