More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1384 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG1384  translation initiation factor IF-3  100 
 
 		 176 aa  349  1e-95  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000113221  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1089  translation initiation factor IF-3  97.73 
 
 		 176 aa  320  7e-87  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000188384  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  64.37 
 
 		 202 aa  225  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  64.16 
 
 		 190 aa  225  3e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  63.31 
 
 		 195 aa  223  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000432272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4471  translation initiation factor IF-3  63.31 
 
 		 195 aa  223  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4306  translation initiation factor IF-3  63.31 
 
 		 195 aa  223  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000145665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4317  translation initiation factor IF-3  63.31 
 
 		 195 aa  223  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000117232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  63.31 
 
 		 186 aa  223  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000690292  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3261  translation initiation factor IF-3  63.31 
 
 		 195 aa  219  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000125648  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4690  translation initiation factor IF-3  63.25 
 
 		 166 aa  218  5e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.37112e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4699  translation initiation factor IF-3  63.25 
 
 		 166 aa  218  5e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000260309  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  62.65 
 
 		 166 aa  217  6e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000012216  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  62.65 
 
 		 166 aa  217  6e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000101645  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4406  translation initiation factor IF-3  63.25 
 
 		 166 aa  216  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000111711  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2033  translation initiation factor IF-3  68.02 
 
 		 216 aa  208  3e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000152468  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1241  translation initiation factor 3  58.08 
 
 		 170 aa  207  9e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000256408  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1244  translation initiation factor IF-3  60 
 
 		 175 aa  200  9.999999999999999e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000317297  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1738  translation initiation factor IF-3  60.47 
 
 		 200 aa  200  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000196833  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1772  translation initiation factor IF-3  60.47 
 
 		 200 aa  200  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000139127  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1409  translation initiation factor IF-3  55.69 
 
 		 172 aa  198  3e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.37178e-16  unclonable  1.3418400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  55.29 
 
 		 198 aa  182  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1443  translation initiation factor 3  65.93 
 
 		 143 aa  183  1.0000000000000001e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000186833  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1225  translation initiation factor 3  53.09 
 
 		 164 aa  179  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000314962  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  52.38 
 
 		 172 aa  176  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1311  translation initiation factor IF-3  50.93 
 
 		 164 aa  174  4e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000644552  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  49.41 
 
 		 198 aa  173  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000135112  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  49.11 
 
 		 178 aa  169  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1678  translation initiation factor IF-3  52.8 
 
 		 170 aa  169  2e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0127847  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  49.69 
 
 		 164 aa  169  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  49.11 
 
 		 207 aa  168  3e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2229  translation initiation factor IF-3  52.38 
 
 		 173 aa  168  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00231449 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2109  translation initiation factor IF-3  49.69 
 
 		 219 aa  167  8e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000273336  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  49.69 
 
 		 178 aa  166  1e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  49.07 
 
 		 178 aa  166  2e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  48.45 
 
 		 179 aa  166  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  47.95 
 
 		 187 aa  165  2.9999999999999998e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  46.71 
 
 		 219 aa  165  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  46.47 
 
 		 197 aa  164  6.9999999999999995e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2146  translation initiation factor IF-3  51.52 
 
 		 173 aa  164  6.9999999999999995e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000692224  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2804  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 180 aa  164  8e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1858  translation initiation factor IF-3  51.52 
 
 		 173 aa  164  8e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000644129  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2172  translation initiation factor IF-3  52.05 
 
 		 154 aa  163  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000864988  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  47.53 
 
 		 202 aa  161  4.0000000000000004e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  50.31 
 
 		 173 aa  161  4.0000000000000004e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  47.24 
 
 		 238 aa  161  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0447  translation initiation factor IF-3  52.8 
 
 		 164 aa  161  5.0000000000000005e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000472838  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  46.63 
 
 		 225 aa  161  6e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01384  translation initiation factor IF-3  51.32 
 
 		 159 aa  160  9e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2103  translation initiation factor 3  49.02 
 
 		 177 aa  160  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  0.133955 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  47.2 
 
 		 174 aa  160  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1161  translation initiation factor 3  50.67 
 
 		 154 aa  160  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.930143 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3163  translation initiation factor IF-3  48.8 
 
 		 252 aa  160  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1280  translation initiation factor 3  48.48 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.453323  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1204  translation initiation factor IF-3  49.09 
 
 		 171 aa  159  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000244125  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2853  translation initiation factor IF-3  49.02 
 
 		 174 aa  159  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0116753 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  49.07 
 
 		 173 aa  159  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2307  translation initiation factor IF-3  50.67 
 
 		 154 aa  159  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00282878  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 165 aa  159  3e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1008  translation initiation factor 3  51.97 
 
 		 155 aa  158  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0442083  hitchhiker  0.00912814 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0830  translation initiation factor IF-3  48.77 
 
 		 169 aa  157  9e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.124767  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  46.06 
 
 		 194 aa  156  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  48.45 
 
 		 227 aa  156  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  45.34 
 
 		 173 aa  157  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0428  translation initiation factor IF-3  48.68 
 
 		 156 aa  156  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1624  translation initiation factor IF-3  47.2 
 
 		 176 aa  155  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101313 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1906  translation initiation factor IF-3  47.2 
 
 		 173 aa  155  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3039  translation initiation factor IF-3  46.58 
 
 		 212 aa  155  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271102  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1975  translation initiation factor IF-3  47.93 
 
 		 233 aa  155  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0641  translation initiation factor IF-3  47.83 
 
 		 175 aa  155  4e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1400  translation initiation factor IF-3  49.34 
 
 		 156 aa  155  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0821028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1360  translation initiation factor IF-3  49.34 
 
 		 156 aa  155  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.485624  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2150  translation initiation factor IF-3  47.2 
 
 		 173 aa  155  4e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1988  translation initiation factor IF-3  47.93 
 
 		 230 aa  154  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.61417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1903  translation initiation factor IF-3  47.93 
 
 		 232 aa  154  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.982503  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1778  translation initiation factor IF-3  48.68 
 
 		 156 aa  154  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.843423 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1924  translation initiation factor IF-3  53.09 
 
 		 180 aa  154  7e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000676935  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  45.45 
 
 		 194 aa  154  7e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1914  translation initiation factor IF-3  53.09 
 
 		 180 aa  154  7e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.119522  normal  0.223345 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  45.45 
 
 		 194 aa  154  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01676  hypothetical protein  53.09 
 
 		 180 aa  154  7e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0101258  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1453  translation initiation factor IF-3  48.68 
 
 		 156 aa  154  8e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0525841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4616  translation initiation factor 3  48.68 
 
 		 156 aa  154  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00507113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0994  translation initiation factor IF-3  48.68 
 
 		 156 aa  154  8e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1476  translation initiation factor IF-3  48.68 
 
 		 156 aa  154  8e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348442  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1612  translation initiation factor IF-3  45.96 
 
 		 173 aa  154  8e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252676 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1557  translation initiation factor IF-3  49.34 
 
 		 156 aa  154  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0221  translation initiation factor IF-3  45.12 
 
 		 186 aa  153  1e-36  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00015702  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2066  translation initiation factor 3  49.67 
 
 		 179 aa  153  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.383221  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1372  translation initiation factor 3  49.34 
 
 		 156 aa  153  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0696405  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2466  translation initiation factor IF-3  45.34 
 
 		 177 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00240261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1891  translation initiation factor IF-3  48.68 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3480  translation initiation factor IF-3  45.34 
 
 		 183 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0422454  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2594  translation initiation factor IF-3  48.68 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  47.2 
 
 		 205 aa  152  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3224  translation initiation factor IF-3  45.34 
 
 		 183 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51494 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3158  translation initiation factor IF-3  45.96 
 
 		 173 aa  152  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  47.2 
 
 		 173 aa  152  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1968  translation initiation factor IF-3  45.34 
 
 		 183 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00361564  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1713  translation initiation factor IF-3  48.68 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>