More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2150 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2150  translation initiation factor IF-3  100 
 
 		 173 aa  346  1e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0412  translation initiation factor IF-3  84.03 
 
 		 144 aa  248  3e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.601649  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3488  translation initiation factor 3  71.1 
 
 		 173 aa  232  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  64.53 
 
 		 174 aa  231  3e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  64.74 
 
 		 173 aa  229  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4267  translation initiation factor IF-3  64.5 
 
 		 178 aa  225  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  63.22 
 
 		 194 aa  224  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  63.22 
 
 		 194 aa  224  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4532  translation initiation factor IF-3  63.31 
 
 		 204 aa  223  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  61.49 
 
 		 194 aa  221  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1341  translation initiation factor IF-3  60.23 
 
 		 173 aa  221  3e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  63.74 
 
 		 202 aa  221  4.9999999999999996e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2538  translation initiation factor IF-3  60.69 
 
 		 173 aa  219  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.838605  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2109  translation initiation factor IF-3  61.63 
 
 		 219 aa  219  9.999999999999999e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000273336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2747  translation initiation factor IF-3  63.03 
 
 		 169 aa  218  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.128829 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1624  translation initiation factor IF-3  60.92 
 
 		 176 aa  216  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101313 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1906  translation initiation factor IF-3  60.92 
 
 		 173 aa  216  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0803  translation initiation factor IF-3  62.57 
 
 		 178 aa  216  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0641  translation initiation factor IF-3  60.47 
 
 		 175 aa  215  2.9999999999999998e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1612  translation initiation factor IF-3  60.92 
 
 		 173 aa  215  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252676 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4742  translation initiation factor IF-3  60.34 
 
 		 176 aa  214  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.676759  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3158  translation initiation factor IF-3  59.77 
 
 		 173 aa  212  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  61.99 
 
 		 192 aa  212  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4232  translation initiation factor IF-3  59.77 
 
 		 173 aa  211  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738998 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0218  translation initiation factor IF-3  58.72 
 
 		 200 aa  209  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0077  translation initiation factor IF-3  56.47 
 
 		 171 aa  208  4e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  57.67 
 
 		 173 aa  206  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  57.14 
 
 		 178 aa  205  2e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  57.14 
 
 		 178 aa  205  2e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0265  translation initiation factor IF-3  59.3 
 
 		 173 aa  204  4e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.910814  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0069  translation initiation factor IF-3  55.29 
 
 		 171 aa  204  5e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.097761 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0041  translation initiation factor IF-3  56.98 
 
 		 192 aa  204  6e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1196  translation initiation factor IF-3  63.01 
 
 		 173 aa  202  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.501518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  58.62 
 
 		 190 aa  201  5e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  54.6 
 
 		 178 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  56.44 
 
 		 173 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2804  translation initiation factor IF-3  55.49 
 
 		 180 aa  198  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0200  translation initiation factor IF-3  63.58 
 
 		 151 aa  198  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0123  translation initiation factor 3  62.94 
 
 		 201 aa  196  1.0000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.228507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1800  translation initiation factor 3  58.64 
 
 		 163 aa  195  3e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00939294  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0488  translation initiation factor IF-3  57.52 
 
 		 184 aa  191  3e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.270402  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0471  translation initiation factor IF-3  55.36 
 
 		 171 aa  191  3e-48  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.973019  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0364  translation initiation factor 3  53.85 
 
 		 182 aa  189  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000297976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1538  translation initiation factor IF-3  55.56 
 
 		 156 aa  186  9e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1095  translation initiation factor IF-3  55.56 
 
 		 156 aa  186  9e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.171775  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1891  translation initiation factor IF-3  55.56 
 
 		 156 aa  186  9e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1736  translation initiation factor IF-3  55.56 
 
 		 156 aa  186  9e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2594  translation initiation factor IF-3  55.56 
 
 		 156 aa  186  9e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1713  translation initiation factor IF-3  55.56 
 
 		 156 aa  186  9e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225755  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01384  translation initiation factor IF-3  55.77 
 
 		 159 aa  186  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0964  translation initiation factor IF-3  55.56 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.698743  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1008  translation initiation factor 3  55.56 
 
 		 155 aa  186  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0442083  hitchhiker  0.00912814 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0428  translation initiation factor IF-3  56.86 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1161  translation initiation factor 3  56.95 
 
 		 154 aa  186  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.930143 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  51.85 
 
 		 173 aa  186  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0201  translation initiation factor IF-3  55.56 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00116998  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0830  translation initiation factor IF-3  54.32 
 
 		 169 aa  186  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.124767  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  55.56 
 
 		 171 aa  186  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000964088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1778  translation initiation factor IF-3  55.56 
 
 		 156 aa  186  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.843423 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1400  translation initiation factor IF-3  55.56 
 
 		 156 aa  185  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0821028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1453  translation initiation factor IF-3  55.56 
 
 		 156 aa  185  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0525841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4616  translation initiation factor 3  55.56 
 
 		 156 aa  185  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00507113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0994  translation initiation factor IF-3  55.56 
 
 		 156 aa  185  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1360  translation initiation factor IF-3  55.56 
 
 		 156 aa  185  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.485624  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1476  translation initiation factor IF-3  55.56 
 
 		 156 aa  185  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348442  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  54.6 
 
 		 187 aa  184  6e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2117  translation initiation factor IF-3  67.94 
 
 		 134 aa  182  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.998323  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2032  translation initiation factor IF-3  67.94 
 
 		 134 aa  182  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1924  translation initiation factor IF-3  57.93 
 
 		 180 aa  181  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000676935  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01676  hypothetical protein  57.93 
 
 		 180 aa  181  3e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0101258  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1914  translation initiation factor IF-3  57.93 
 
 		 180 aa  181  3e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.119522  normal  0.223345 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0065  translation initiation factor IF-3  60.56 
 
 		 145 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1557  translation initiation factor IF-3  54.9 
 
 		 156 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2218  translation initiation factor IF-3  53.99 
 
 		 182 aa  181  4.0000000000000006e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000264089  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1009  translation initiation factor IF-3  54.32 
 
 		 169 aa  181  5.0000000000000004e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  54.25 
 
 		 154 aa  181  5.0000000000000004e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2103  translation initiation factor 3  55.48 
 
 		 177 aa  181  5.0000000000000004e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  0.133955 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0341  initiation factor 3  63.36 
 
 		 132 aa  181  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2755  translation initiation factor IF-3  53.59 
 
 		 156 aa  180  8.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2853  translation initiation factor IF-3  54.84 
 
 		 174 aa  180  9.000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0116753 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1768  translation initiation factor IF-3  55.56 
 
 		 221 aa  180  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.40976 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1372  translation initiation factor 3  53.59 
 
 		 156 aa  180  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0696405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0168  translation initiation factor IF-3  63.36 
 
 		 132 aa  180  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1763  translation initiation factor 3  66.15 
 
 		 137 aa  179  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3483  translation initiation factor IF-3  65.65 
 
 		 132 aa  179  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.113137  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2466  translation initiation factor IF-3  51.23 
 
 		 177 aa  177  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00240261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  51.23 
 
 		 164 aa  177  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1968  translation initiation factor IF-3  50.3 
 
 		 183 aa  177  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00361564  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3480  translation initiation factor IF-3  51.23 
 
 		 183 aa  177  7e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0422454  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3224  translation initiation factor IF-3  51.23 
 
 		 183 aa  177  7e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51494 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2676  translation initiation factor 3  60.77 
 
 		 137 aa  177  8e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.233816 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2181  translation initiation factor IF-3  56.07 
 
 		 180 aa  176  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0268784  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  53.09 
 
 		 198 aa  176  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2185  translation initiation factor IF-3  57.93 
 
 		 180 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000180897  normal  0.0386823 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2221  translation initiation factor IF-3  57.93 
 
 		 180 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000103984  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0930  translation initiation factor 3  50 
 
 		 178 aa  176  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1889  translation initiation factor IF-3  56.07 
 
 		 180 aa  176  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3090  translation initiation factor IF-3  54.55 
 
 		 179 aa  176  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.639467  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2172  translation initiation factor IF-3  53.33 
 
 		 154 aa  175  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000864988  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  49.08 
 
 		 179 aa  176  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>