More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4639 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  100 
 
 
219 aa  451  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  62.87 
 
 
238 aa  264  7e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  67.58 
 
 
225 aa  253  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3163  translation initiation factor IF-3  68.45 
 
 
252 aa  248  6e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170352  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0766  translation initiation factor IF-3  52.46 
 
 
181 aa  203  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  54.6 
 
 
179 aa  203  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3261  translation initiation factor IF-3  53.98 
 
 
195 aa  202  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000125648  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1249  translation initiation factor IF-3  56.21 
 
 
174 aa  200  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.246001 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  52.27 
 
 
195 aa  199  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000432272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4471  translation initiation factor IF-3  52.27 
 
 
195 aa  199  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4306  translation initiation factor IF-3  52.27 
 
 
195 aa  199  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000145665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4317  translation initiation factor IF-3  52.27 
 
 
195 aa  199  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000117232  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  54.76 
 
 
190 aa  199  3e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  52.27 
 
 
186 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000690292  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  52.91 
 
 
202 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  51.15 
 
 
198 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  52.17 
 
 
164 aa  196  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3622  translation initiation factor IF-3  52.87 
 
 
357 aa  196  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0913675  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  52.35 
 
 
202 aa  196  3e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4699  translation initiation factor IF-3  54.55 
 
 
166 aa  194  6e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000260309  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4690  translation initiation factor IF-3  54.55 
 
 
166 aa  194  6e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.37112e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  54.55 
 
 
166 aa  194  7e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000101645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  54.55 
 
 
166 aa  194  7e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000012216  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4406  translation initiation factor IF-3  54.55 
 
 
166 aa  194  9e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000111711  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1241  translation initiation factor 3  53.89 
 
 
170 aa  193  2e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000256408  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1218  translation initiation factor IF-3  52.76 
 
 
173 aa  192  3e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0326522  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2172  translation initiation factor IF-3  58.39 
 
 
154 aa  190  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000864988  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  51.7 
 
 
190 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  50.9 
 
 
172 aa  189  4e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1204  translation initiation factor IF-3  53.99 
 
 
171 aa  185  6e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000244125  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  51.23 
 
 
187 aa  184  8e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  47.43 
 
 
197 aa  184  1.0000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2156  translation initiation factor IF-3  52.07 
 
 
175 aa  183  2.0000000000000003e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000187486  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1225  translation initiation factor 3  50.93 
 
 
164 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000314962  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  48.81 
 
 
174 aa  182  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3328  translation initiation factor IF-3  46.77 
 
 
243 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.825238  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1311  translation initiation factor IF-3  49.69 
 
 
164 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000644552  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  52.63 
 
 
178 aa  182  3e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0364  translation initiation factor 3  51.18 
 
 
182 aa  182  3e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000297976  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  50.57 
 
 
225 aa  182  3e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  50.61 
 
 
198 aa  182  4.0000000000000006e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000135112  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  52.05 
 
 
178 aa  181  5.0000000000000004e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2218  translation initiation factor IF-3  50.29 
 
 
182 aa  181  6e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000264089  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5473  translation initiation factor IF-3  48.62 
 
 
204 aa  181  7e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2981  translation initiation factor 3  45.95 
 
 
238 aa  181  7e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3025  translation initiation factor 3  45.95 
 
 
238 aa  181  7e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  52.26 
 
 
165 aa  181  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  48.54 
 
 
207 aa  181  1e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2996  translation initiation factor 3  45.95 
 
 
238 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171641  normal  0.0309942 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0428  translation initiation factor IF-3  51.28 
 
 
156 aa  180  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0221  translation initiation factor IF-3  47.93 
 
 
186 aa  180  2e-44  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00015702  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11658  translation initiation factor IF-3  51.23 
 
 
201 aa  179  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6087  Translation initiation factor 3 (IF-3)-like protein  50.6 
 
 
222 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897729  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14590  translation initiation factor 3  50.29 
 
 
401 aa  179  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2229  translation initiation factor IF-3  53.37 
 
 
173 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00231449 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5483  translation initiation factor IF-3  50 
 
 
250 aa  178  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195942  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2042  translation initiation factor IF-3  50.28 
 
 
199 aa  179  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0708817  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  50.61 
 
 
173 aa  179  4e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  50 
 
 
173 aa  178  4.999999999999999e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3488  translation initiation factor 3  52.33 
 
 
173 aa  178  7e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3052  translation initiation factor IF-3  49.44 
 
 
182 aa  177  9e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  50 
 
 
194 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  49.7 
 
 
205 aa  177  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  50 
 
 
194 aa  176  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  50 
 
 
194 aa  176  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1477  translation initiation factor 3  53.09 
 
 
396 aa  176  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0613769  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2418  translation initiation factor IF-3  46.59 
 
 
196 aa  177  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  48.02 
 
 
227 aa  176  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  46.34 
 
 
171 aa  176  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000964088  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2459  translation initiation factor 3  48.26 
 
 
243 aa  176  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2466  translation initiation factor IF-3  49.09 
 
 
177 aa  175  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00240261  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2996  translation initiation factor IF-3  48.81 
 
 
173 aa  175  4e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3480  translation initiation factor IF-3  49.09 
 
 
183 aa  175  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0422454  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1968  translation initiation factor IF-3  49.09 
 
 
183 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00361564  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3224  translation initiation factor IF-3  49.09 
 
 
183 aa  175  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.51494 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0522  translation initiation factor IF-3  47.27 
 
 
193 aa  175  5e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000692532  hitchhiker  0.000000579185 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1480  translation initiation factor IF-3  53.09 
 
 
356 aa  175  5e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000187235 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1409  translation initiation factor IF-3  48.24 
 
 
172 aa  175  6e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.37178e-16  unclonable  1.3418400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0713  translation initiation factor 3  47.49 
 
 
249 aa  174  9e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2666  translation initiation factor IF-3  45.51 
 
 
176 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2804  translation initiation factor IF-3  50 
 
 
180 aa  173  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  48.19 
 
 
178 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1316  translation initiation factor IF-3  51.85 
 
 
351 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0724  translation initiation factor IF-3  48.57 
 
 
194 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000346718  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4742  translation initiation factor IF-3  50.3 
 
 
176 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.676759  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0065  translation initiation factor IF-3  46.51 
 
 
184 aa  173  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  47.98 
 
 
192 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  48.8 
 
 
173 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1800  translation initiation factor 3  50.31 
 
 
163 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00939294  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3039  translation initiation factor IF-3  48.02 
 
 
212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271102  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  50.3 
 
 
173 aa  172  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2054  translation initiation factor IF-3  49.35 
 
 
152 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000423398  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4532  translation initiation factor IF-3  46.82 
 
 
204 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3169  translation initiation factor IF-3  51.85 
 
 
277 aa  172  5e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22440  translation initiation factor 3  49.4 
 
 
329 aa  172  5e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2538  translation initiation factor IF-3  46.75 
 
 
173 aa  171  5e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.838605  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0077  translation initiation factor IF-3  46.75 
 
 
171 aa  172  5e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1509  translation initiation factor IF-3  49.43 
 
 
204 aa  172  5e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00441613  normal  0.913408 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1624  translation initiation factor IF-3  49.4 
 
 
415 aa  172  5e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.640548 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0041  translation initiation factor IF-3  48.24 
 
 
192 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>