More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0215 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  100 
 
 		 198 aa  406  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  71.43 
 
 		 187 aa  243  9.999999999999999e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  68.94 
 
 		 164 aa  233  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  63.8 
 
 		 179 aa  232  3e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  58.72 
 
 		 202 aa  219  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  68.42 
 
 		 165 aa  216  2e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  59.3 
 
 		 190 aa  216  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  67.11 
 
 		 154 aa  215  4e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3261  translation initiation factor IF-3  58.14 
 
 		 195 aa  214  7e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000125648  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  56.98 
 
 		 195 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000432272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4471  translation initiation factor IF-3  56.98 
 
 		 195 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4306  translation initiation factor IF-3  56.98 
 
 		 195 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000145665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4317  translation initiation factor IF-3  56.98 
 
 		 195 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000117232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  56.98 
 
 		 186 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000690292  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  60.95 
 
 		 225 aa  203  1e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5473  translation initiation factor IF-3  57.8 
 
 		 204 aa  199  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5483  translation initiation factor IF-3  59.76 
 
 		 250 aa  199  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  49.48 
 
 		 238 aa  198  5e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  59.41 
 
 		 227 aa  197  7e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1875  translation initiation factor IF-3  58.48 
 
 		 239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.384688 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  54.97 
 
 		 207 aa  196  1.0000000000000001e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  56.21 
 
 		 198 aa  197  1.0000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000135112  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1613  translation initiation factor IF-3  68.38 
 
 		 145 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000306668  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  57.06 
 
 		 202 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  51.15 
 
 		 219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2042  translation initiation factor IF-3  57.99 
 
 		 199 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0708817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6087  Translation initiation factor 3 (IF-3)-like protein  59.28 
 
 		 222 aa  195  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  58.58 
 
 		 205 aa  195  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  55.62 
 
 		 197 aa  194  6e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3052  translation initiation factor IF-3  59.63 
 
 		 182 aa  194  6e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4690  translation initiation factor IF-3  56.52 
 
 		 166 aa  194  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.37112e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4699  translation initiation factor IF-3  56.52 
 
 		 166 aa  194  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000260309  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  55.9 
 
 		 166 aa  193  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000012216  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  55.9 
 
 		 166 aa  193  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000101645  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11658  translation initiation factor IF-3  56.89 
 
 		 201 aa  193  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3071  translation initiation factor IF-3  60 
 
 		 182 aa  193  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427548  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  52.66 
 
 		 171 aa  193  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000964088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4406  translation initiation factor IF-3  56.52 
 
 		 166 aa  193  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000111711  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  54.55 
 
 		 178 aa  193  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1225  translation initiation factor 3  57.14 
 
 		 164 aa  192  4e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000314962  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1882  translation initiation factor IF-3  59.63 
 
 		 204 aa  191  5e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0284235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2459  translation initiation factor 3  58.58 
 
 		 243 aa  191  5e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2418  translation initiation factor IF-3  57.4 
 
 		 196 aa  191  6e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  54.94 
 
 		 174 aa  191  7e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1311  translation initiation factor IF-3  55.9 
 
 		 164 aa  191  8e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000644552  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3328  translation initiation factor IF-3  57.49 
 
 		 243 aa  191  8e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.825238  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2996  translation initiation factor 3  56.89 
 
 		 238 aa  190  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171641  normal  0.0309942 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2981  translation initiation factor 3  56.89 
 
 		 238 aa  190  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1678  translation initiation factor IF-3  56.52 
 
 		 170 aa  190  1e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0127847  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3025  translation initiation factor 3  56.89 
 
 		 238 aa  190  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3039  translation initiation factor IF-3  55.56 
 
 		 212 aa  189  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271102  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2066  translation initiation factor 3  60 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.383221  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  54.97 
 
 		 173 aa  189  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  57.32 
 
 		 190 aa  189  2.9999999999999997e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14590  translation initiation factor 3  53.41 
 
 		 401 aa  187  5.999999999999999e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2109  translation initiation factor IF-3  55.56 
 
 		 219 aa  187  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000273336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3622  translation initiation factor IF-3  56.1 
 
 		 357 aa  187  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0913675  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1480  translation initiation factor IF-3  54.02 
 
 		 356 aa  187  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000187235 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1301  translation initiation factor 3  59.09 
 
 		 175 aa  187  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.444006  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  53.99 
 
 		 172 aa  186  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  51.46 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0522  translation initiation factor IF-3  56.71 
 
 		 193 aa  185  3e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000692532  hitchhiker  0.000000579185 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3169  translation initiation factor IF-3  54.94 
 
 		 277 aa  185  4e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1477  translation initiation factor 3  54.55 
 
 		 396 aa  184  7e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0613769  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1204  translation initiation factor IF-3  56.63 
 
 		 171 aa  184  8e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000244125  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  56.1 
 
 		 194 aa  184  9e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  56.73 
 
 		 173 aa  184  9e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2172  translation initiation factor IF-3  56.85 
 
 		 154 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000864988  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0475  translation initiation factor IF-3  50.27 
 
 		 253 aa  182  2.0000000000000003e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3163  translation initiation factor IF-3  53.99 
 
 		 252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  56.1 
 
 		 194 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1103  translation initiation factor IF-3  54.88 
 
 		 233 aa  182  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0433779  normal  0.928932 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1823  translation initiation factor 3 (bIF-3)  62 
 
 		 153 aa  182  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000272282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  56.1 
 
 		 194 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1624  translation initiation factor IF-3  56.71 
 
 		 415 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.640548 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  51.53 
 
 		 173 aa  182  3e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12250  translation initiation factor 3  58.17 
 
 		 195 aa  182  3e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.109497  normal  0.154931 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  54.94 
 
 		 173 aa  182  4.0000000000000006e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0218  translation initiation factor IF-3  53.09 
 
 		 200 aa  181  7e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  54.27 
 
 		 178 aa  179  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0830  translation initiation factor IF-3  53.66 
 
 		 169 aa  179  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.124767  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  53.57 
 
 		 192 aa  179  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2466  translation initiation factor IF-3  52.76 
 
 		 177 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00240261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0441  translation initiation factor IF-3  53.99 
 
 		 179 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.077533  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0766  translation initiation factor IF-3  54.61 
 
 		 181 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3480  translation initiation factor IF-3  52.76 
 
 		 183 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0422454  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  54.27 
 
 		 178 aa  179  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3224  translation initiation factor IF-3  52.76 
 
 		 183 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51494 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0641  translation initiation factor IF-3  53.09 
 
 		 175 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1768  translation initiation factor IF-3  48.76 
 
 		 221 aa  179  2.9999999999999997e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.40976 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2054  translation initiation factor IF-3  54.61 
 
 		 152 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000423398  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1409  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 172 aa  179  2.9999999999999997e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.37178e-16  unclonable  1.3418400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1968  translation initiation factor IF-3  52.76 
 
 		 183 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00361564  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0065  translation initiation factor IF-3  53.66 
 
 		 184 aa  178  4e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1249  translation initiation factor IF-3  50.3 
 
 		 174 aa  177  5.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.246001 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2666  translation initiation factor IF-3  48.26 
 
 		 176 aa  177  5.999999999999999e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25690  translation initiation factor 3  57.24 
 
 		 168 aa  177  7e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0069  translation initiation factor IF-3  51.23 
 
 		 171 aa  177  8e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.097761 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4232  translation initiation factor IF-3  53.89 
 
 		 173 aa  177  8e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738998 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0803  translation initiation factor IF-3  53.18 
 
 		 178 aa  177  8e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>