More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_25690 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_25690  translation initiation factor 3  100 
 
 		 168 aa  342  2e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5473  translation initiation factor IF-3  90.38 
 
 		 204 aa  294  3e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3328  translation initiation factor IF-3  80 
 
 		 243 aa  281  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.825238  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2981  translation initiation factor 3  80.49 
 
 		 238 aa  279  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3025  translation initiation factor 3  80.49 
 
 		 238 aa  279  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2996  translation initiation factor 3  80.49 
 
 		 238 aa  279  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171641  normal  0.0309942 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2418  translation initiation factor IF-3  80.75 
 
 		 196 aa  275  2e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11658  translation initiation factor IF-3  81.13 
 
 		 201 aa  275  3e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2042  translation initiation factor IF-3  81.6 
 
 		 199 aa  271  2.0000000000000002e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0708817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  83.33 
 
 		 227 aa  268  4e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3071  translation initiation factor IF-3  78.79 
 
 		 182 aa  265  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427548  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3039  translation initiation factor IF-3  73.41 
 
 		 212 aa  265  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271102  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6087  Translation initiation factor 3 (IF-3)-like protein  84 
 
 		 222 aa  265  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2139  translation initiation factor IF-3  84.77 
 
 		 177 aa  265  2.9999999999999995e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0045601  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5483  translation initiation factor IF-3  83.44 
 
 		 250 aa  263  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2459  translation initiation factor 3  77.44 
 
 		 243 aa  261  3e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2066  translation initiation factor 3  79.27 
 
 		 179 aa  260  8e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.383221  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12250  translation initiation factor 3  78.88 
 
 		 195 aa  257  6e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.109497  normal  0.154931 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  80.79 
 
 		 225 aa  254  3e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2385  translation initiation factor IF-3  77.5 
 
 		 192 aa  254  4e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157849  normal  0.289584 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3542  initiation factor 3  81.51 
 
 		 175 aa  253  6e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.407448  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  77.27 
 
 		 205 aa  253  7e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1882  translation initiation factor IF-3  79.33 
 
 		 204 aa  251  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0284235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1875  translation initiation factor IF-3  79.33 
 
 		 239 aa  251  3e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.384688 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3169  translation initiation factor IF-3  78 
 
 		 277 aa  250  6e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1624  translation initiation factor IF-3  78.15 
 
 		 415 aa  249  9.000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.640548 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3052  translation initiation factor IF-3  73.46 
 
 		 182 aa  248  4e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22440  translation initiation factor 3  75.93 
 
 		 329 aa  246  1e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1103  translation initiation factor IF-3  76.1 
 
 		 233 aa  245  2e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0433779  normal  0.928932 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1728  initiation factor 3  81.16 
 
 		 149 aa  238  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00351932  hitchhiker  0.00163995 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1316  translation initiation factor IF-3  72.73 
 
 		 351 aa  236  1e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14590  translation initiation factor 3  69.05 
 
 		 401 aa  235  2e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1477  translation initiation factor 3  73.68 
 
 		 396 aa  234  3e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0613769  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1480  translation initiation factor IF-3  73.68 
 
 		 356 aa  233  8e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000187235 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21910  translation initiation factor 3  69.75 
 
 		 208 aa  225  2e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.559617  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0475  translation initiation factor IF-3  64.43 
 
 		 253 aa  198  1.9999999999999998e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1301  translation initiation factor 3  57.65 
 
 		 175 aa  197  5e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.444006  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0232  translation initiation factor 3  65.49 
 
 		 211 aa  192  1e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.627991  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3622  translation initiation factor IF-3  60.26 
 
 		 357 aa  192  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0913675  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  58.86 
 
 		 165 aa  190  7e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  56.96 
 
 		 207 aa  188  4e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  57.05 
 
 		 198 aa  181  3e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000135112  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  57.24 
 
 		 198 aa  177  4.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1218  translation initiation factor IF-3  51.83 
 
 		 173 aa  177  9e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0326522  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  51.85 
 
 		 197 aa  176  1e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  55.7 
 
 		 187 aa  175  3e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  54.36 
 
 		 154 aa  174  4e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1249  translation initiation factor IF-3  55.56 
 
 		 174 aa  174  7e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.246001 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  54.11 
 
 		 164 aa  173  9e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1161  translation initiation factor 3  54.97 
 
 		 154 aa  171  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.930143 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0522  translation initiation factor IF-3  55.33 
 
 		 193 aa  170  6.999999999999999e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000692532  hitchhiker  0.000000579185 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  53.42 
 
 		 174 aa  169  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  53.33 
 
 		 178 aa  168  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1678  translation initiation factor IF-3  54.97 
 
 		 170 aa  168  3e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0127847  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0221  translation initiation factor IF-3  51.01 
 
 		 186 aa  167  6e-41  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00015702  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  49.66 
 
 		 179 aa  167  8e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1613  translation initiation factor IF-3  56.43 
 
 		 145 aa  166  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000306668  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1008  translation initiation factor 3  52.63 
 
 		 155 aa  164  4e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0442083  hitchhiker  0.00912814 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  52.67 
 
 		 173 aa  164  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0766  translation initiation factor IF-3  50.31 
 
 		 181 aa  164  5.9999999999999996e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  52.32 
 
 		 173 aa  163  8e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  51.01 
 
 		 172 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1419  translation initiation factor IF-3  52.08 
 
 		 146 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000288109  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4267  translation initiation factor IF-3  51.01 
 
 		 178 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0964  translation initiation factor IF-3  50.99 
 
 		 156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.698743  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0200  translation initiation factor IF-3  53.1 
 
 		 151 aa  162  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0201  translation initiation factor IF-3  50.99 
 
 		 156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00116998  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2307  translation initiation factor IF-3  48.99 
 
 		 154 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00282878  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2109  translation initiation factor IF-3  54.48 
 
 		 219 aa  161  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000273336  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1095  translation initiation factor IF-3  50.33 
 
 		 156 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.171775  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1557  translation initiation factor IF-3  50.33 
 
 		 156 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1891  translation initiation factor IF-3  50.33 
 
 		 156 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  51.37 
 
 		 202 aa  161  4.0000000000000004e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4532  translation initiation factor IF-3  51.01 
 
 		 204 aa  161  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2594  translation initiation factor IF-3  50.33 
 
 		 156 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1713  translation initiation factor IF-3  50.33 
 
 		 156 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225755  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1372  translation initiation factor 3  50.33 
 
 		 156 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0696405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1538  translation initiation factor IF-3  50.33 
 
 		 156 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1736  translation initiation factor IF-3  50.33 
 
 		 156 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  47.2 
 
 		 219 aa  161  5.0000000000000005e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  55.48 
 
 		 192 aa  160  5.0000000000000005e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1778  translation initiation factor IF-3  50.33 
 
 		 156 aa  160  6e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.843423 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0803  translation initiation factor IF-3  54.48 
 
 		 178 aa  160  8.000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2755  translation initiation factor IF-3  49.67 
 
 		 156 aa  160  9e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  52.41 
 
 		 173 aa  160  9e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  44.64 
 
 		 238 aa  160  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2103  translation initiation factor 3  48.5 
 
 		 177 aa  159  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  0.133955 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1453  translation initiation factor IF-3  49.67 
 
 		 156 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0525841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4616  translation initiation factor 3  49.67 
 
 		 156 aa  159  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00507113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1400  translation initiation factor IF-3  49.67 
 
 		 156 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0821028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0660  translation initiation factor IF-3  51.03 
 
 		 176 aa  159  2e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000367528  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0994  translation initiation factor IF-3  49.67 
 
 		 156 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1360  translation initiation factor IF-3  49.67 
 
 		 156 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.485624  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1476  translation initiation factor IF-3  49.67 
 
 		 156 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348442  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2172  translation initiation factor IF-3  49.66 
 
 		 154 aa  158  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000864988  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2853  translation initiation factor IF-3  47.9 
 
 		 174 aa  158  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0116753 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 195 aa  158  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000432272  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 186 aa  158  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000690292  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  50.65 
 
 		 166 aa  158  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000012216  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2218  translation initiation factor IF-3  50.34 
 
 		 182 aa  158  4e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000264089  normal  0.129164 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>