More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3052 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3052  translation initiation factor IF-3  100 
 
 		 182 aa  367  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1882  translation initiation factor IF-3  88.27 
 
 		 204 aa  295  3e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0284235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1875  translation initiation factor IF-3  87.65 
 
 		 239 aa  293  1e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.384688 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11658  translation initiation factor IF-3  77.3 
 
 		 201 aa  271  5.000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5483  translation initiation factor IF-3  76.16 
 
 		 250 aa  267  5e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  76.65 
 
 		 227 aa  267  7e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6087  Translation initiation factor 3 (IF-3)-like protein  77.78 
 
 		 222 aa  265  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2981  translation initiation factor 3  71.67 
 
 		 238 aa  265  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3025  translation initiation factor 3  71.67 
 
 		 238 aa  265  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2996  translation initiation factor 3  71.67 
 
 		 238 aa  264  5e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171641  normal  0.0309942 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  74.85 
 
 		 205 aa  263  7e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2459  translation initiation factor 3  75.76 
 
 		 243 aa  263  7e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3328  translation initiation factor IF-3  75.46 
 
 		 243 aa  263  8.999999999999999e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.825238  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2042  translation initiation factor IF-3  75.76 
 
 		 199 aa  262  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0708817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  76.51 
 
 		 225 aa  262  3e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3039  translation initiation factor IF-3  70.56 
 
 		 212 aa  260  6e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271102  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5473  translation initiation factor IF-3  75.61 
 
 		 204 aa  257  5.0000000000000005e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2418  translation initiation factor IF-3  74.69 
 
 		 196 aa  257  7e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2139  translation initiation factor IF-3  78.34 
 
 		 177 aa  256  9e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0045601  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3071  translation initiation factor IF-3  71.68 
 
 		 182 aa  256  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427548  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1103  translation initiation factor IF-3  65.41 
 
 		 233 aa  250  6e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0433779  normal  0.928932 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1316  translation initiation factor IF-3  70.91 
 
 		 351 aa  249  2e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25690  translation initiation factor 3  73.46 
 
 		 168 aa  248  5e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3169  translation initiation factor IF-3  70.37 
 
 		 277 aa  246  9e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1624  translation initiation factor IF-3  70.3 
 
 		 415 aa  245  2e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.640548 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22440  translation initiation factor 3  70.91 
 
 		 329 aa  246  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2066  translation initiation factor 3  75.16 
 
 		 179 aa  246  2e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.383221  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14590  translation initiation factor 3  66.67 
 
 		 401 aa  238  2.9999999999999997e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1477  translation initiation factor 3  67.08 
 
 		 396 aa  238  4e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0613769  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1480  translation initiation factor IF-3  67.08 
 
 		 356 aa  236  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000187235 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12250  translation initiation factor 3  72.73 
 
 		 195 aa  234  5.0000000000000005e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.109497  normal  0.154931 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2385  translation initiation factor IF-3  70.7 
 
 		 192 aa  234  5.0000000000000005e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157849  normal  0.289584 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3542  initiation factor 3  77.7 
 
 		 175 aa  233  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.407448  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1728  initiation factor 3  77.46 
 
 		 149 aa  230  7.000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00351932  hitchhiker  0.00163995 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0475  translation initiation factor IF-3  58.24 
 
 		 253 aa  219  1.9999999999999999e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21910  translation initiation factor 3  59.43 
 
 		 208 aa  213  9.999999999999999e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.559617  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  60.87 
 
 		 207 aa  209  2e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3622  translation initiation factor IF-3  58.54 
 
 		 357 aa  201  5e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0913675  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  58.39 
 
 		 198 aa  199  1.9999999999999998e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000135112  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  56.52 
 
 		 197 aa  196  2.0000000000000003e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  59.63 
 
 		 198 aa  194  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  61.18 
 
 		 165 aa  194  8.000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  56.02 
 
 		 187 aa  192  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1301  translation initiation factor 3  59.74 
 
 		 175 aa  192  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.444006  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0232  translation initiation factor 3  55.83 
 
 		 211 aa  188  4e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.627991  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  52.17 
 
 		 179 aa  188  4e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  53.94 
 
 		 190 aa  187  9e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  53.42 
 
 		 164 aa  185  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1678  translation initiation factor IF-3  55.69 
 
 		 170 aa  184  5e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0127847  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  52.12 
 
 		 166 aa  184  6e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000012216  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  52.12 
 
 		 166 aa  184  6e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000101645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4690  translation initiation factor IF-3  51.52 
 
 		 166 aa  184  8e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.37112e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  51.52 
 
 		 186 aa  184  8e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000690292  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4699  translation initiation factor IF-3  51.52 
 
 		 166 aa  184  8e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000260309  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  51.52 
 
 		 195 aa  183  9e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000432272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4471  translation initiation factor IF-3  51.52 
 
 		 195 aa  183  9e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4306  translation initiation factor IF-3  51.52 
 
 		 195 aa  183  9e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000145665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4317  translation initiation factor IF-3  51.52 
 
 		 195 aa  183  9e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000117232  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3224  translation initiation factor IF-3  52.12 
 
 		 183 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51494 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3480  translation initiation factor IF-3  52.12 
 
 		 183 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0422454  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1968  translation initiation factor IF-3  52.12 
 
 		 183 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00361564  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  54.04 
 
 		 202 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2466  translation initiation factor IF-3  52.12 
 
 		 177 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00240261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0522  translation initiation factor IF-3  54.66 
 
 		 193 aa  182  2.0000000000000003e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000692532  hitchhiker  0.000000579185 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3261  translation initiation factor IF-3  50.3 
 
 		 195 aa  182  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000125648  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4406  translation initiation factor IF-3  50.91 
 
 		 166 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000111711  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  53.42 
 
 		 172 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3163  translation initiation factor IF-3  53.09 
 
 		 252 aa  181  7e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  52.47 
 
 		 238 aa  179  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  52.17 
 
 		 171 aa  178  4e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000964088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  53.37 
 
 		 173 aa  178  4.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  49.44 
 
 		 219 aa  177  5.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  52.15 
 
 		 194 aa  177  9e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  52.15 
 
 		 194 aa  177  9e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  51.53 
 
 		 194 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1409  translation initiation factor IF-3  50.93 
 
 		 172 aa  175  3e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.37178e-16  unclonable  1.3418400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  52.17 
 
 		 173 aa  175  4e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  52.44 
 
 		 190 aa  175  4e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2538  translation initiation factor IF-3  52.5 
 
 		 173 aa  174  5e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.838605  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1249  translation initiation factor IF-3  54.27 
 
 		 174 aa  174  5e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.246001 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  53.29 
 
 		 154 aa  174  6e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0713  translation initiation factor 3  48.78 
 
 		 249 aa  174  8e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  51.52 
 
 		 178 aa  174  9e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  50.3 
 
 		 178 aa  173  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0221  translation initiation factor IF-3  48.45 
 
 		 186 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00015702  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  49.7 
 
 		 178 aa  172  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  50.93 
 
 		 174 aa  172  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2103  translation initiation factor 3  53.8 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  0.133955 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2156  translation initiation factor IF-3  48.82 
 
 		 175 aa  172  2.9999999999999996e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000187486  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0364  translation initiation factor 3  54.32 
 
 		 182 aa  172  2.9999999999999996e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000297976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2613  translation initiation factor IF-3  47.24 
 
 		 172 aa  171  3.9999999999999995e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0154974  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20430  translation initiation factor IF-3  48.48 
 
 		 177 aa  171  5e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2853  translation initiation factor IF-3  52.63 
 
 		 174 aa  171  5e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0116753 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2242  translation initiation factor IF-3  47.24 
 
 		 166 aa  171  5.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000466118  hitchhiker  0.00531509 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  51.23 
 
 		 225 aa  171  6.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  54.37 
 
 		 192 aa  171  6.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2218  translation initiation factor IF-3  47.24 
 
 		 182 aa  170  9e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000264089  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2229  translation initiation factor IF-3  53.42 
 
 		 173 aa  169  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00231449 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1977  translation initiation factor IF-3  48.48 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.269445  normal  0.0568676 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1204  translation initiation factor IF-3  51.55 
 
 		 171 aa  169  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000244125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>