More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2666 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2666  translation initiation factor IF-3  100 
 
 		 176 aa  350  4e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2619  translation initiation factor IF-3  86.93 
 
 		 176 aa  286  1e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1311  translation initiation factor IF-3  69.57 
 
 		 164 aa  241  3e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000644552  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1225  translation initiation factor 3  67.7 
 
 		 164 aa  234  5.0000000000000005e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000314962  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3261  translation initiation factor IF-3  53.05 
 
 		 195 aa  187  8e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000125648  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  52.17 
 
 		 164 aa  186  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  51.22 
 
 		 195 aa  184  7e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000432272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4471  translation initiation factor IF-3  51.22 
 
 		 195 aa  184  7e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4306  translation initiation factor IF-3  51.22 
 
 		 195 aa  184  7e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000145665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4317  translation initiation factor IF-3  51.22 
 
 		 195 aa  184  7e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000117232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  51.22 
 
 		 186 aa  184  7e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000690292  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  52.17 
 
 		 166 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000101645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  52.17 
 
 		 166 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000012216  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  50.31 
 
 		 202 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4690  translation initiation factor IF-3  52.17 
 
 		 166 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.37112e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4699  translation initiation factor IF-3  52.17 
 
 		 166 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000260309  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4406  translation initiation factor IF-3  52.17 
 
 		 166 aa  182  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000111711  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  51.55 
 
 		 190 aa  181  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1204  translation initiation factor IF-3  56.71 
 
 		 171 aa  181  6e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000244125  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  48.26 
 
 		 198 aa  177  4.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  46.75 
 
 		 225 aa  177  5.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2054  translation initiation factor IF-3  52.63 
 
 		 152 aa  176  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000423398  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  44.97 
 
 		 238 aa  175  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  45.51 
 
 		 219 aa  174  7e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  48.47 
 
 		 179 aa  173  9e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  48.17 
 
 		 187 aa  173  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  51.32 
 
 		 165 aa  171  5e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  46.3 
 
 		 202 aa  170  7.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2172  translation initiation factor IF-3  49.66 
 
 		 154 aa  170  9e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000864988  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2038  translation initiation factor IF-3  46.95 
 
 		 177 aa  166  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.369536 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4675  translation initiation factor IF-3  46.95 
 
 		 177 aa  165  2.9999999999999998e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.361003  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  45.56 
 
 		 194 aa  164  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  46.95 
 
 		 171 aa  164  6.9999999999999995e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000964088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  44.38 
 
 		 194 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  44.38 
 
 		 194 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0065  translation initiation factor IF-3  46.43 
 
 		 184 aa  161  4.0000000000000004e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  45.39 
 
 		 154 aa  160  8.000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2146  translation initiation factor IF-3  53.53 
 
 		 173 aa  160  8.000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000692224  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1858  translation initiation factor IF-3  53.53 
 
 		 173 aa  160  9e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000644129  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2150  translation initiation factor IF-3  46.91 
 
 		 173 aa  159  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1409  translation initiation factor IF-3  49.07 
 
 		 172 aa  159  2e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.37178e-16  unclonable  1.3418400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2109  translation initiation factor IF-3  45.24 
 
 		 219 aa  159  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000273336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1613  translation initiation factor IF-3  51.8 
 
 		 145 aa  158  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000306668  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0218  translation initiation factor IF-3  44.58 
 
 		 200 aa  158  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  45.18 
 
 		 174 aa  157  5e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0766  translation initiation factor IF-3  45.75 
 
 		 181 aa  157  5e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3163  translation initiation factor IF-3  40.24 
 
 		 252 aa  157  6e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0069  translation initiation factor IF-3  42.26 
 
 		 171 aa  157  6e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.097761 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2218  translation initiation factor IF-3  41.92 
 
 		 182 aa  157  9e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000264089  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1768  translation initiation factor IF-3  46.3 
 
 		 221 aa  156  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.40976 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0930  translation initiation factor 3  42.26 
 
 		 178 aa  157  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2459  translation initiation factor 3  42.26 
 
 		 243 aa  155  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1244  translation initiation factor IF-3  52.38 
 
 		 175 aa  155  3e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000317297  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1738  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 200 aa  155  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000196833  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1772  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 200 aa  155  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000139127  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0077  translation initiation factor IF-3  41.07 
 
 		 171 aa  155  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0441  translation initiation factor IF-3  43.56 
 
 		 179 aa  155  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.077533  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0041  translation initiation factor IF-3  42.26 
 
 		 192 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1241  translation initiation factor 3  43.48 
 
 		 170 aa  154  7e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000256408  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0641  translation initiation factor IF-3  43.71 
 
 		 175 aa  154  9e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  41.92 
 
 		 227 aa  153  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0660  translation initiation factor IF-3  40.62 
 
 		 176 aa  153  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000367528  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  40.7 
 
 		 207 aa  153  1e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2466  translation initiation factor IF-3  42.07 
 
 		 177 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00240261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3224  translation initiation factor IF-3  42.07 
 
 		 183 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51494 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  41.46 
 
 		 178 aa  152  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3480  translation initiation factor IF-3  42.07 
 
 		 183 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0422454  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1968  translation initiation factor IF-3  42.07 
 
 		 183 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00361564  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  40.85 
 
 		 178 aa  152  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2137  translation initiation factor IF-3  45.78 
 
 		 167 aa  152  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194801  hitchhiker  0.00234339 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  42.5 
 
 		 173 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  41.32 
 
 		 205 aa  151  4e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4232  translation initiation factor IF-3  45.34 
 
 		 173 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738998 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1314  translation initiation factor IF-3  43.37 
 
 		 185 aa  150  8e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241721  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4742  translation initiation factor IF-3  45.34 
 
 		 176 aa  150  8.999999999999999e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.676759  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0221  translation initiation factor IF-3  45.4 
 
 		 186 aa  150  1e-35  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00015702  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2613  translation initiation factor IF-3  39.52 
 
 		 172 aa  150  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0154974  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3052  translation initiation factor IF-3  42.33 
 
 		 182 aa  150  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0713  translation initiation factor 3  40.59 
 
 		 249 aa  149  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0265  translation initiation factor IF-3  42.17 
 
 		 173 aa  149  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.910814  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1103  translation initiation factor IF-3  42.86 
 
 		 233 aa  149  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0433779  normal  0.928932 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  42.44 
 
 		 197 aa  149  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0447  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 164 aa  149  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000472838  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1612  translation initiation factor IF-3  45.96 
 
 		 173 aa  148  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252676 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1480  translation initiation factor IF-3  41.32 
 
 		 356 aa  149  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000187235 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2242  translation initiation factor IF-3  39.16 
 
 		 166 aa  148  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000466118  hitchhiker  0.00531509 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  41.82 
 
 		 173 aa  148  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3158  translation initiation factor IF-3  44.72 
 
 		 173 aa  148  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1477  translation initiation factor 3  41.21 
 
 		 396 aa  149  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0613769  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  40.12 
 
 		 190 aa  148  4e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3622  translation initiation factor IF-3  38.69 
 
 		 357 aa  148  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0913675  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  43.21 
 
 		 173 aa  148  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3488  translation initiation factor 3  46.99 
 
 		 173 aa  148  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  41.82 
 
 		 173 aa  148  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3039  translation initiation factor IF-3  40.12 
 
 		 212 aa  147  5e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271102  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0475  translation initiation factor IF-3  44.05 
 
 		 253 aa  147  6e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0803  translation initiation factor IF-3  42.86 
 
 		 178 aa  147  7e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  40.24 
 
 		 172 aa  147  8e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5483  translation initiation factor IF-3  42.26 
 
 		 250 aa  147  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1624  translation initiation factor IF-3  44.72 
 
 		 176 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101313 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>