More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_12250 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_12250  translation initiation factor 3  100 
 
 		 195 aa  392  1e-108  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.109497  normal  0.154931 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2042  translation initiation factor IF-3  72.63 
 
 		 199 aa  264  7e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0708817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3039  translation initiation factor IF-3  70.06 
 
 		 212 aa  262  3e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271102  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14590  translation initiation factor 3  70.69 
 
 		 401 aa  260  1e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2066  translation initiation factor 3  79.27 
 
 		 179 aa  259  2e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.383221  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3071  translation initiation factor IF-3  78.05 
 
 		 182 aa  259  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427548  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25690  translation initiation factor 3  78.88 
 
 		 168 aa  258  4e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1103  translation initiation factor IF-3  65.46 
 
 		 233 aa  257  7e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0433779  normal  0.928932 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2459  translation initiation factor 3  74.1 
 
 		 243 aa  255  4e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6087  Translation initiation factor 3 (IF-3)-like protein  81.21 
 
 		 222 aa  253  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5483  translation initiation factor IF-3  67.38 
 
 		 250 aa  252  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  76.28 
 
 		 225 aa  252  3e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22440  translation initiation factor 3  66.67 
 
 		 329 aa  251  4.0000000000000004e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2139  translation initiation factor IF-3  79.22 
 
 		 177 aa  251  6e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0045601  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2385  translation initiation factor IF-3  76.58 
 
 		 192 aa  250  8.000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157849  normal  0.289584 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1624  translation initiation factor IF-3  66.85 
 
 		 415 aa  249  2e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.640548 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3169  translation initiation factor IF-3  78.52 
 
 		 277 aa  248  3e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2996  translation initiation factor 3  70.95 
 
 		 238 aa  246  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171641  normal  0.0309942 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2981  translation initiation factor 3  70.95 
 
 		 238 aa  246  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3025  translation initiation factor 3  70.95 
 
 		 238 aa  246  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5473  translation initiation factor IF-3  78.52 
 
 		 204 aa  244  8e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3328  translation initiation factor IF-3  74.53 
 
 		 243 aa  243  9e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.825238  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1316  translation initiation factor IF-3  70.06 
 
 		 351 aa  242  3e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  79.05 
 
 		 227 aa  240  7.999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2418  translation initiation factor IF-3  75.16 
 
 		 196 aa  240  9e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1477  translation initiation factor 3  71.9 
 
 		 396 aa  238  4e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0613769  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11658  translation initiation factor IF-3  71.25 
 
 		 201 aa  237  1e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  74.5 
 
 		 205 aa  236  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1875  translation initiation factor IF-3  75 
 
 		 239 aa  235  3e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.384688 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3052  translation initiation factor IF-3  72.73 
 
 		 182 aa  235  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1882  translation initiation factor IF-3  75 
 
 		 204 aa  235  3e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0284235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1480  translation initiation factor IF-3  71.9 
 
 		 356 aa  235  3e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000187235 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21910  translation initiation factor 3  69.33 
 
 		 208 aa  227  1e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.559617  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3542  initiation factor 3  75.35 
 
 		 175 aa  220  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.407448  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1728  initiation factor 3  78.03 
 
 		 149 aa  218  5e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00351932  hitchhiker  0.00163995 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1301  translation initiation factor 3  57.99 
 
 		 175 aa  200  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.444006  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0475  translation initiation factor IF-3  55.31 
 
 		 253 aa  195  3e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3622  translation initiation factor IF-3  51.3 
 
 		 357 aa  192  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0913675  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0232  translation initiation factor 3  57.31 
 
 		 211 aa  189  2e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.627991  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  58.17 
 
 		 198 aa  182  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  58.39 
 
 		 165 aa  181  5.0000000000000004e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  51.52 
 
 		 197 aa  179  2e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  55.03 
 
 		 207 aa  177  1e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  55.03 
 
 		 198 aa  175  5e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000135112  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1678  translation initiation factor IF-3  55.35 
 
 		 170 aa  171  7.999999999999999e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0127847  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1249  translation initiation factor IF-3  54.14 
 
 		 174 aa  171  7.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.246001 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  53.02 
 
 		 154 aa  170  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  53.25 
 
 		 187 aa  169  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1218  translation initiation factor IF-3  53.02 
 
 		 173 aa  169  3e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0326522  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  53.02 
 
 		 164 aa  168  5e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0766  translation initiation factor IF-3  48.85 
 
 		 181 aa  167  8e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  45.16 
 
 		 238 aa  166  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0522  translation initiation factor IF-3  55.1 
 
 		 193 aa  165  2.9999999999999998e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000692532  hitchhiker  0.000000579185 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  48.65 
 
 		 179 aa  165  4e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  52.35 
 
 		 174 aa  165  5e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1613  translation initiation factor IF-3  57.78 
 
 		 145 aa  164  6.9999999999999995e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000306668  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2307  translation initiation factor IF-3  50.34 
 
 		 154 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00282878  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1161  translation initiation factor 3  53.25 
 
 		 154 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.930143 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  51.68 
 
 		 202 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  53.02 
 
 		 173 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1008  translation initiation factor 3  52.35 
 
 		 155 aa  161  5.0000000000000005e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0442083  hitchhiker  0.00912814 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  51.68 
 
 		 172 aa  161  7e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  53.69 
 
 		 190 aa  160  7e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  50.34 
 
 		 171 aa  161  7e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000964088  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  50.65 
 
 		 178 aa  159  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  46.79 
 
 		 219 aa  159  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0065  translation initiation factor IF-3  52.35 
 
 		 184 aa  159  3e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1509  translation initiation factor IF-3  53.28 
 
 		 204 aa  157  7e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00441613  normal  0.913408 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4267  translation initiation factor IF-3  52.35 
 
 		 178 aa  157  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0221  translation initiation factor IF-3  43.79 
 
 		 186 aa  157  1e-37  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00015702  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  52.32 
 
 		 194 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  52.32 
 
 		 194 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0803  translation initiation factor IF-3  52.35 
 
 		 178 aa  155  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1823  translation initiation factor 3 (bIF-3)  52.35 
 
 		 153 aa  156  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000272282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3261  translation initiation factor IF-3  48.7 
 
 		 195 aa  156  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000125648  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  48.05 
 
 		 190 aa  156  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2103  translation initiation factor 3  50.32 
 
 		 177 aa  156  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  0.133955 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  52.67 
 
 		 194 aa  156  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0964  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 156 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.698743  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0201  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 156 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00116998  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4532  translation initiation factor IF-3  51.68 
 
 		 204 aa  155  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  48.32 
 
 		 225 aa  155  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1880  translation initiation factor IF-3  49.38 
 
 		 229 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.10659 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1538  translation initiation factor IF-3  49.35 
 
 		 156 aa  154  6e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1095  translation initiation factor IF-3  49.35 
 
 		 156 aa  154  6e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.171775  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1891  translation initiation factor IF-3  49.35 
 
 		 156 aa  154  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2594  translation initiation factor IF-3  49.35 
 
 		 156 aa  154  6e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1713  translation initiation factor IF-3  49.35 
 
 		 156 aa  154  6e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225755  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  49.35 
 
 		 166 aa  154  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000101645  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1736  translation initiation factor IF-3  49.35 
 
 		 156 aa  154  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  49.35 
 
 		 166 aa  154  6e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000012216  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4690  translation initiation factor IF-3  48.7 
 
 		 166 aa  154  7e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.37112e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4699  translation initiation factor IF-3  48.7 
 
 		 166 aa  154  7e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000260309  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0200  translation initiation factor IF-3  51.68 
 
 		 151 aa  154  7e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2853  translation initiation factor IF-3  47.8 
 
 		 174 aa  154  7e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0116753 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  48.7 
 
 		 195 aa  154  9e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000432272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4471  translation initiation factor IF-3  48.7 
 
 		 195 aa  154  9e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4306  translation initiation factor IF-3  48.7 
 
 		 195 aa  154  9e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000145665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4317  translation initiation factor IF-3  48.7 
 
 		 195 aa  154  9e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000117232  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  48.99 
 
 		 202 aa  154  9e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>