More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3169 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3169  translation initiation factor IF-3  100 
 
 		 277 aa  559  1e-158  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1624  translation initiation factor IF-3  73.06 
 
 		 415 aa  338  4e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.640548 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22440  translation initiation factor 3  75.45 
 
 		 329 aa  331  9e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1103  translation initiation factor IF-3  71.56 
 
 		 233 aa  322  5e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0433779  normal  0.928932 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2042  translation initiation factor IF-3  76.02 
 
 		 199 aa  305  4.0000000000000004e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0708817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6087  Translation initiation factor 3 (IF-3)-like protein  73.42 
 
 		 222 aa  300  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14590  translation initiation factor 3  71 
 
 		 401 aa  299  3e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2385  translation initiation factor IF-3  78.95 
 
 		 192 aa  295  4e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157849  normal  0.289584 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1316  translation initiation factor IF-3  80.68 
 
 		 351 aa  295  6e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5483  translation initiation factor IF-3  71.57 
 
 		 250 aa  293  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1477  translation initiation factor 3  62.93 
 
 		 396 aa  293  2e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0613769  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3039  translation initiation factor IF-3  70.2 
 
 		 212 aa  290  1e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271102  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1480  translation initiation factor IF-3  79.88 
 
 		 356 aa  285  4e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000187235 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3071  translation initiation factor IF-3  77.47 
 
 		 182 aa  285  5e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427548  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2459  translation initiation factor 3  74.32 
 
 		 243 aa  285  5e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  74.18 
 
 		 225 aa  280  1e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5473  translation initiation factor IF-3  74.72 
 
 		 204 aa  279  3e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2066  translation initiation factor 3  78.57 
 
 		 179 aa  275  5e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.383221  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  70.05 
 
 		 205 aa  271  6e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  74.3 
 
 		 227 aa  270  2e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2981  translation initiation factor 3  67 
 
 		 238 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3328  translation initiation factor IF-3  63.77 
 
 		 243 aa  270  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.825238  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3025  translation initiation factor 3  67 
 
 		 238 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2996  translation initiation factor 3  67 
 
 		 238 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171641  normal  0.0309942 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21910  translation initiation factor 3  73.6 
 
 		 208 aa  268  8e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.559617  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2139  translation initiation factor IF-3  81.13 
 
 		 177 aa  267  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0045601  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1875  translation initiation factor IF-3  70.06 
 
 		 239 aa  260  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.384688 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11658  translation initiation factor IF-3  68.54 
 
 		 201 aa  259  3e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2418  translation initiation factor IF-3  70 
 
 		 196 aa  259  5.0000000000000005e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12250  translation initiation factor 3  71.58 
 
 		 195 aa  257  1e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.109497  normal  0.154931 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25690  translation initiation factor 3  75.93 
 
 		 168 aa  255  6e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1882  translation initiation factor IF-3  72.84 
 
 		 204 aa  252  4.0000000000000004e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0284235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3052  translation initiation factor IF-3  69.7 
 
 		 182 aa  249  4e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0475  translation initiation factor IF-3  60.96 
 
 		 253 aa  232  5e-60  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1728  initiation factor 3  77.04 
 
 		 149 aa  227  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00351932  hitchhiker  0.00163995 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3542  initiation factor 3  71.63 
 
 		 175 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.407448  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3622  translation initiation factor IF-3  54.73 
 
 		 357 aa  213  3.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0913675  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  58.54 
 
 		 207 aa  212  5.999999999999999e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  57.32 
 
 		 198 aa  203  2e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000135112  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  51.93 
 
 		 197 aa  201  8e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0232  translation initiation factor 3  59.39 
 
 		 211 aa  199  3e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.627991  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1301  translation initiation factor 3  56.97 
 
 		 175 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.444006  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  51.72 
 
 		 202 aa  191  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  55.15 
 
 		 194 aa  185  7e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  55.15 
 
 		 194 aa  185  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0065  translation initiation factor IF-3  51.52 
 
 		 184 aa  185  8e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  54.88 
 
 		 198 aa  185  8e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  50.54 
 
 		 194 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  55.76 
 
 		 165 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  46 
 
 		 238 aa  182  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  53.33 
 
 		 173 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  50.92 
 
 		 174 aa  181  9.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0522  translation initiation factor IF-3  52.3 
 
 		 193 aa  181  1e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000692532  hitchhiker  0.000000579185 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  53.95 
 
 		 154 aa  180  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  48.65 
 
 		 187 aa  179  4e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0713  translation initiation factor 3  45.37 
 
 		 249 aa  179  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  51.2 
 
 		 178 aa  178  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3163  translation initiation factor IF-3  52.73 
 
 		 252 aa  176  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  51.2 
 
 		 173 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0930  translation initiation factor 3  46.67 
 
 		 178 aa  176  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2038  translation initiation factor IF-3  46.59 
 
 		 177 aa  176  5e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.369536 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1509  translation initiation factor IF-3  52.98 
 
 		 204 aa  175  6e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00441613  normal  0.913408 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  51.53 
 
 		 173 aa  175  7e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  51.52 
 
 		 225 aa  175  8e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  49.09 
 
 		 173 aa  175  9e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2156  translation initiation factor IF-3  49.12 
 
 		 175 aa  173  1.9999999999999998e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000187486  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4675  translation initiation factor IF-3  46.02 
 
 		 177 aa  173  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.361003  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  49.69 
 
 		 164 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  48.77 
 
 		 179 aa  173  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  50.3 
 
 		 172 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4267  translation initiation factor IF-3  49.69 
 
 		 178 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  52.76 
 
 		 192 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0441  translation initiation factor IF-3  46.67 
 
 		 179 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.077533  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  50.6 
 
 		 219 aa  172  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  48.8 
 
 		 178 aa  172  5e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4532  translation initiation factor IF-3  49.69 
 
 		 204 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  48.8 
 
 		 178 aa  172  5.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1968  translation initiation factor IF-3  50.3 
 
 		 183 aa  171  9e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00361564  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2466  translation initiation factor IF-3  50.3 
 
 		 177 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00240261  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1249  translation initiation factor IF-3  52.8 
 
 		 174 aa  171  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.246001 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0803  translation initiation factor IF-3  50.31 
 
 		 178 aa  171  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2109  translation initiation factor IF-3  51.53 
 
 		 219 aa  171  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000273336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3480  translation initiation factor IF-3  50.3 
 
 		 183 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0422454  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3224  translation initiation factor IF-3  50.3 
 
 		 183 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51494 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2853  translation initiation factor IF-3  50.9 
 
 		 174 aa  169  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0116753 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  51.5 
 
 		 190 aa  169  4e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2538  translation initiation factor IF-3  48.48 
 
 		 173 aa  169  6e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.838605  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1678  translation initiation factor IF-3  50.59 
 
 		 170 aa  169  7e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0127847  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3488  translation initiation factor 3  52.76 
 
 		 173 aa  168  8e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2747  translation initiation factor IF-3  48.19 
 
 		 169 aa  167  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.128829 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1341  translation initiation factor IF-3  46.63 
 
 		 173 aa  167  2e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2103  translation initiation factor 3  51.9 
 
 		 177 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  0.133955 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0364  translation initiation factor 3  47.93 
 
 		 182 aa  166  2.9999999999999998e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000297976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0641  translation initiation factor IF-3  49.69 
 
 		 175 aa  166  4e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1924  translation initiation factor IF-3  48.48 
 
 		 177 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0221  translation initiation factor IF-3  44.77 
 
 		 186 aa  166  5e-40  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00015702  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  46.58 
 
 		 171 aa  165  6.9999999999999995e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000964088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0679  translation initiation factor IF-3  51.79 
 
 		 168 aa  165  9e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  47.88 
 
 		 190 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1314  translation initiation factor IF-3  48.26 
 
 		 185 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>