More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0425 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  100 
 
 		 171 aa  343  8e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000964088  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  62.2 
 
 		 172 aa  223  8e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  58.64 
 
 		 173 aa  203  7e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2307  translation initiation factor IF-3  60.26 
 
 		 154 aa  201  6e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00282878  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  55.29 
 
 		 173 aa  197  5e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2996  translation initiation factor IF-3  55.97 
 
 		 173 aa  197  7.999999999999999e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  52.66 
 
 		 198 aa  193  9e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  52.35 
 
 		 202 aa  191  4e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  53.05 
 
 		 179 aa  191  4e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  53.89 
 
 		 178 aa  191  5e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2229  translation initiation factor IF-3  57.32 
 
 		 173 aa  190  7e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00231449 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  54.76 
 
 		 202 aa  190  8e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  53.05 
 
 		 194 aa  189  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2613  translation initiation factor IF-3  52.94 
 
 		 172 aa  189  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0154974  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  54.04 
 
 		 197 aa  189  1e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  57.14 
 
 		 154 aa  189  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  53.7 
 
 		 164 aa  188  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  53.53 
 
 		 173 aa  188  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  51.18 
 
 		 207 aa  187  4e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  54.44 
 
 		 187 aa  188  4e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  53.66 
 
 		 194 aa  187  5e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  52.94 
 
 		 190 aa  187  5e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  53.66 
 
 		 194 aa  187  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2150  translation initiation factor IF-3  55.56 
 
 		 173 aa  186  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1412  translation initiation factor IF-3  62.86 
 
 		 143 aa  186  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000852308  normal  0.493061 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0983  translation initiation factor IF-3  55.83 
 
 		 176 aa  185  3e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.104 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  58.17 
 
 		 165 aa  185  3e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3090  translation initiation factor IF-3  54.84 
 
 		 179 aa  184  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.639467  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0830  translation initiation factor IF-3  57.14 
 
 		 169 aa  184  5e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.124767  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0428  translation initiation factor IF-3  56.21 
 
 		 156 aa  184  6e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  50.61 
 
 		 238 aa  184  6e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  53.09 
 
 		 174 aa  184  7e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2242  translation initiation factor IF-3  53.05 
 
 		 166 aa  184  7e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000466118  hitchhiker  0.00531509 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2858  translation initiation factor 3  54.19 
 
 		 173 aa  184  7e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.357759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0488  translation initiation factor IF-3  54.25 
 
 		 184 aa  183  1.0000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.270402  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  53.7 
 
 		 190 aa  182  1.0000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2638  translation initiation factor IF-3  56.79 
 
 		 169 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.294805  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1161  translation initiation factor 3  57.62 
 
 		 154 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.930143 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1975  translation initiation factor IF-3  56.02 
 
 		 233 aa  181  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1880  translation initiation factor IF-3  55.42 
 
 		 229 aa  181  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.10659 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3261  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 195 aa  181  6e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000125648  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 195 aa  180  7e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000432272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4471  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 195 aa  180  7e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4306  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 195 aa  180  7e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000145665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4317  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 195 aa  180  7e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000117232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 186 aa  180  7e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000690292  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0065  translation initiation factor IF-3  54.32 
 
 		 184 aa  180  8.000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0489  translation initiation factor IF-3  54.55 
 
 		 176 aa  180  9.000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000720798  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2103  translation initiation factor 3  52.9 
 
 		 177 aa  180  9.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  0.133955 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1903  translation initiation factor IF-3  55.42 
 
 		 232 aa  180  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.982503  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1988  translation initiation factor IF-3  55.42 
 
 		 230 aa  180  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.61417  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2853  translation initiation factor IF-3  54.19 
 
 		 174 aa  180  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0116753 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  50.61 
 
 		 225 aa  179  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1924  translation initiation factor IF-3  57.06 
 
 		 180 aa  178  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000676935  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4699  translation initiation factor IF-3  51.85 
 
 		 166 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000260309  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4690  translation initiation factor IF-3  51.85 
 
 		 166 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.37112e-62 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1914  translation initiation factor IF-3  57.06 
 
 		 180 aa  178  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.119522  normal  0.223345 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2172  translation initiation factor IF-3  55.1 
 
 		 154 aa  178  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000864988  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  51.55 
 
 		 198 aa  178  2.9999999999999997e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000135112  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01676  hypothetical protein  57.06 
 
 		 180 aa  178  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0101258  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3052  translation initiation factor IF-3  52.17 
 
 		 182 aa  178  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1557  translation initiation factor IF-3  55.56 
 
 		 156 aa  178  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  51.23 
 
 		 166 aa  177  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000012216  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  51.23 
 
 		 166 aa  177  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000101645  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2804  translation initiation factor IF-3  51.5 
 
 		 180 aa  177  4.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4406  translation initiation factor IF-3  51.85 
 
 		 166 aa  177  5.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000111711  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  49.07 
 
 		 227 aa  177  8e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0441  translation initiation factor IF-3  52.15 
 
 		 179 aa  176  9e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.077533  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1800  translation initiation factor 3  55.56 
 
 		 163 aa  176  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00939294  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1875  translation initiation factor IF-3  51.55 
 
 		 239 aa  176  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.384688 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3622  translation initiation factor IF-3  50.92 
 
 		 357 aa  176  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0913675  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2466  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 177 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00240261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3480  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 183 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0422454  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3224  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 183 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51494 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1968  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 183 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00361564  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  46.34 
 
 		 219 aa  176  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2218  translation initiation factor IF-3  49.38 
 
 		 182 aa  175  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000264089  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1736  translation initiation factor IF-3  53.59 
 
 		 156 aa  174  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0221  translation initiation factor IF-3  46.63 
 
 		 186 aa  174  4e-43  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00015702  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1095  translation initiation factor IF-3  53.59 
 
 		 156 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.171775  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0964  translation initiation factor IF-3  53.59 
 
 		 156 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.698743  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1891  translation initiation factor IF-3  53.59 
 
 		 156 aa  174  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2594  translation initiation factor IF-3  53.59 
 
 		 156 aa  174  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0201  translation initiation factor IF-3  53.59 
 
 		 156 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00116998  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1713  translation initiation factor IF-3  53.59 
 
 		 156 aa  174  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225755  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1613  translation initiation factor IF-3  58.57 
 
 		 145 aa  174  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000306668  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1538  translation initiation factor IF-3  53.59 
 
 		 156 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1882  translation initiation factor IF-3  50.93 
 
 		 204 aa  174  4e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0284235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1008  translation initiation factor 3  54.25 
 
 		 155 aa  174  5e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0442083  hitchhiker  0.00912814 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0471  translation initiation factor IF-3  50.92 
 
 		 171 aa  174  5e-43  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.973019  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3163  translation initiation factor IF-3  48.47 
 
 		 252 aa  174  5e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2459  translation initiation factor 3  46.71 
 
 		 243 aa  174  6e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0660  translation initiation factor IF-3  48.45 
 
 		 176 aa  174  7e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000367528  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  52.17 
 
 		 192 aa  174  7e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2181  translation initiation factor IF-3  57.67 
 
 		 180 aa  174  7e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0268784  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1871  translation initiation factor IF-3  51.95 
 
 		 181 aa  174  7e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2038  translation initiation factor IF-3  50.62 
 
 		 177 aa  173  8e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.369536 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1889  translation initiation factor IF-3  57.67 
 
 		 180 aa  172  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1341  translation initiation factor IF-3  49.38 
 
 		 173 aa  172  9.999999999999999e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0641  translation initiation factor IF-3  50.62 
 
 		 175 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>