More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0534 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  100 
 
 
165 aa  327  3e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  71.79 
 
 
187 aa  246  1e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  67.97 
 
 
164 aa  232  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  71.24 
 
 
154 aa  232  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  68.42 
 
 
198 aa  216  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  62.75 
 
 
179 aa  213  8e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2172  translation initiation factor IF-3  64 
 
 
154 aa  208  3e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000864988  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2054  translation initiation factor IF-3  60.26 
 
 
152 aa  206  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000423398  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1613  translation initiation factor IF-3  69.85 
 
 
145 aa  205  3e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000306668  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  59.28 
 
 
227 aa  204  5e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1225  translation initiation factor 3  60.13 
 
 
164 aa  202  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000314962  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  61.18 
 
 
202 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  60.13 
 
 
178 aa  196  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2042  translation initiation factor IF-3  58.79 
 
 
199 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0708817  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  59.48 
 
 
178 aa  195  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5473  translation initiation factor IF-3  61.18 
 
 
204 aa  194  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  58.17 
 
 
202 aa  194  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1311  translation initiation factor IF-3  55.56 
 
 
164 aa  194  4.0000000000000005e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000644552  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5483  translation initiation factor IF-3  58.79 
 
 
250 aa  194  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195942  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  60.25 
 
 
225 aa  194  5.000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3052  translation initiation factor IF-3  61.18 
 
 
182 aa  194  6e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2459  translation initiation factor 3  56.79 
 
 
243 aa  194  6e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1204  translation initiation factor IF-3  58.17 
 
 
171 aa  193  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000244125  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  58.94 
 
 
173 aa  192  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1419  translation initiation factor IF-3  62.24 
 
 
146 aa  191  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000288109  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  59.35 
 
 
205 aa  191  3e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1875  translation initiation factor IF-3  59.87 
 
 
239 aa  191  4e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.384688 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1882  translation initiation factor IF-3  59.87 
 
 
204 aa  191  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0284235  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25690  translation initiation factor 3  58.86 
 
 
168 aa  190  7e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4675  translation initiation factor IF-3  59.48 
 
 
177 aa  190  7e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.361003  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3071  translation initiation factor IF-3  59.21 
 
 
182 aa  189  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427548  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  58.17 
 
 
225 aa  189  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  56.1 
 
 
197 aa  189  1e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0428  translation initiation factor IF-3  57.42 
 
 
156 aa  189  1e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  55.26 
 
 
173 aa  189  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2418  translation initiation factor IF-3  54.55 
 
 
196 aa  189  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2066  translation initiation factor 3  57.06 
 
 
179 aa  188  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.383221  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2996  translation initiation factor 3  57.58 
 
 
238 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171641  normal  0.0309942 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2981  translation initiation factor 3  57.58 
 
 
238 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1301  translation initiation factor 3  59.48 
 
 
175 aa  189  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.444006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3025  translation initiation factor 3  57.58 
 
 
238 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0065  translation initiation factor IF-3  61.44 
 
 
184 aa  188  2.9999999999999997e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  57.52 
 
 
190 aa  188  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0200  translation initiation factor IF-3  58.28 
 
 
151 aa  188  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2038  translation initiation factor IF-3  58.82 
 
 
177 aa  188  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.369536 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6087  Translation initiation factor 3 (IF-3)-like protein  57.89 
 
 
222 aa  187  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897729  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1557  translation initiation factor IF-3  54.9 
 
 
156 aa  187  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  57.05 
 
 
173 aa  187  4e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11658  translation initiation factor IF-3  58.71 
 
 
201 aa  188  4e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0488  translation initiation factor IF-3  55.56 
 
 
184 aa  187  5e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.270402  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0441  translation initiation factor IF-3  59.48 
 
 
179 aa  187  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.077533  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  59.48 
 
 
192 aa  187  5.999999999999999e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3328  translation initiation factor IF-3  56.36 
 
 
243 aa  187  5.999999999999999e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.825238  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  56.21 
 
 
174 aa  186  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  56.21 
 
 
238 aa  186  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  59.35 
 
 
194 aa  186  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0766  translation initiation factor IF-3  50 
 
 
181 aa  185  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1095  translation initiation factor IF-3  55.56 
 
 
156 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.171775  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1891  translation initiation factor IF-3  55.56 
 
 
156 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0964  translation initiation factor IF-3  55.56 
 
 
156 aa  185  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.698743  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1736  translation initiation factor IF-3  55.56 
 
 
156 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2594  translation initiation factor IF-3  55.56 
 
 
156 aa  186  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1372  translation initiation factor 3  54.9 
 
 
156 aa  185  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0696405  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0201  translation initiation factor IF-3  55.56 
 
 
156 aa  185  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00116998  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1713  translation initiation factor IF-3  55.56 
 
 
156 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225755  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2139  translation initiation factor IF-3  58.55 
 
 
177 aa  186  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0045601  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  58.17 
 
 
171 aa  185  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000964088  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1538  translation initiation factor IF-3  55.56 
 
 
156 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2755  translation initiation factor IF-3  54.9 
 
 
156 aa  185  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22658  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3622  translation initiation factor IF-3  57.24 
 
 
357 aa  184  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0913675  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3039  translation initiation factor IF-3  55.26 
 
 
212 aa  183  9e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271102  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  57.42 
 
 
194 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  54.25 
 
 
178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1612  translation initiation factor IF-3  56.86 
 
 
173 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00252676 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  57.42 
 
 
194 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1906  translation initiation factor IF-3  56.21 
 
 
173 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1624  translation initiation factor IF-3  56.21 
 
 
176 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0101313 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  56.86 
 
 
172 aa  181  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1008  translation initiation factor 3  55.56 
 
 
155 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0442083  hitchhiker  0.00912814 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  52.26 
 
 
219 aa  181  5.0000000000000004e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1400  translation initiation factor IF-3  53.59 
 
 
156 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0821028  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  54.9 
 
 
173 aa  181  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1823  translation initiation factor 3 (bIF-3)  58.28 
 
 
153 aa  181  5.0000000000000004e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000272282  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1161  translation initiation factor 3  55.63 
 
 
154 aa  181  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.930143 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1360  translation initiation factor IF-3  53.59 
 
 
156 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.485624  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4616  translation initiation factor 3  53.59 
 
 
156 aa  181  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00507113  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0994  translation initiation factor IF-3  53.59 
 
 
156 aa  181  6e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1453  translation initiation factor IF-3  53.59 
 
 
156 aa  181  6e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0525841  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1476  translation initiation factor IF-3  53.59 
 
 
156 aa  181  6e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348442  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12250  translation initiation factor 3  58.39 
 
 
195 aa  180  6e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.109497  normal  0.154931 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1778  translation initiation factor IF-3  52.94 
 
 
156 aa  180  6e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.843423 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1968  translation initiation factor IF-3  53.59 
 
 
183 aa  180  7e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00361564  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2002  translation initiation factor 3  59.86 
 
 
153 aa  180  7e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112753  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1763  translation initiation factor 3  59.56 
 
 
137 aa  180  7e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2466  translation initiation factor IF-3  53.59 
 
 
177 aa  180  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00240261  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0830  translation initiation factor IF-3  57.89 
 
 
169 aa  180  8.000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.124767  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4267  translation initiation factor IF-3  55.56 
 
 
178 aa  180  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3480  translation initiation factor IF-3  53.59 
 
 
183 aa  180  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0422454  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3224  translation initiation factor IF-3  53.59 
 
 
183 aa  180  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.51494 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3169  translation initiation factor IF-3  56.58 
 
 
277 aa  180  9.000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>