More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1434 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  100 
 
 		 225 aa  452  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  87.56 
 
 		 238 aa  397  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3163  translation initiation factor IF-3  78.24 
 
 		 252 aa  280  1e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  60.75 
 
 		 219 aa  256  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  55.21 
 
 		 164 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  55.56 
 
 		 202 aa  198  3.9999999999999996e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  54.88 
 
 		 187 aa  198  5e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  59.01 
 
 		 202 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  56.63 
 
 		 172 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1241  translation initiation factor 3  60.25 
 
 		 170 aa  197  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000256408  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  57.4 
 
 		 190 aa  196  2.0000000000000003e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1612  translation initiation factor IF-3  57.49 
 
 		 173 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252676 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3622  translation initiation factor IF-3  53.63 
 
 		 357 aa  194  8.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0913675  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0766  translation initiation factor IF-3  53.71 
 
 		 181 aa  194  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3261  translation initiation factor IF-3  53.33 
 
 		 195 aa  193  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000125648  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  53.37 
 
 		 179 aa  194  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1624  translation initiation factor IF-3  56.29 
 
 		 176 aa  193  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101313 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1906  translation initiation factor IF-3  56.29 
 
 		 173 aa  192  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  54.97 
 
 		 195 aa  191  5e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000432272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4471  translation initiation factor IF-3  54.97 
 
 		 195 aa  191  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4306  translation initiation factor IF-3  54.97 
 
 		 195 aa  191  5e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000145665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4317  translation initiation factor IF-3  54.97 
 
 		 195 aa  191  5e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000117232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  54.97 
 
 		 186 aa  192  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000690292  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3158  translation initiation factor IF-3  55.69 
 
 		 173 aa  190  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2172  translation initiation factor IF-3  58.28 
 
 		 154 aa  190  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000864988  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  57.76 
 
 		 166 aa  190  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000012216  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4690  translation initiation factor IF-3  57.14 
 
 		 166 aa  189  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.37112e-62 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  56.14 
 
 		 190 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  52.41 
 
 		 174 aa  190  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4699  translation initiation factor IF-3  57.14 
 
 		 166 aa  189  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000260309  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  58.17 
 
 		 165 aa  190  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  57.76 
 
 		 166 aa  190  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000101645  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  53.66 
 
 		 194 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  53.66 
 
 		 194 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  54.27 
 
 		 194 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2229  translation initiation factor IF-3  54.76 
 
 		 173 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00231449 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2109  translation initiation factor IF-3  55.42 
 
 		 219 aa  189  2.9999999999999997e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000273336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4406  translation initiation factor IF-3  57.14 
 
 		 166 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000111711  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  56.29 
 
 		 178 aa  189  4e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  54.55 
 
 		 173 aa  189  4e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  55.69 
 
 		 178 aa  188  5e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1204  translation initiation factor IF-3  55.76 
 
 		 171 aa  187  9e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000244125  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2156  translation initiation factor IF-3  52.38 
 
 		 175 aa  187  1e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000187486  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  51.46 
 
 		 198 aa  186  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1225  translation initiation factor 3  52.15 
 
 		 164 aa  186  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000314962  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4742  translation initiation factor IF-3  55.83 
 
 		 176 aa  186  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.676759  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0641  translation initiation factor IF-3  55.42 
 
 		 175 aa  185  5e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0364  translation initiation factor 3  53.61 
 
 		 182 aa  185  5e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000297976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1218  translation initiation factor IF-3  55.41 
 
 		 173 aa  185  6e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0326522  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1249  translation initiation factor IF-3  54.44 
 
 		 174 aa  185  6e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.246001 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4232  translation initiation factor IF-3  53.89 
 
 		 173 aa  184  7e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738998 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1968  translation initiation factor IF-3  53.05 
 
 		 183 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00361564  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2466  translation initiation factor IF-3  53.05 
 
 		 177 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00240261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3224  translation initiation factor IF-3  53.05 
 
 		 183 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51494 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3480  translation initiation factor IF-3  53.05 
 
 		 183 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0422454  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0428  translation initiation factor IF-3  55.26 
 
 		 156 aa  182  3e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  53.09 
 
 		 197 aa  182  3e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1311  translation initiation factor IF-3  48.47 
 
 		 164 aa  182  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000644552  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3488  translation initiation factor 3  56.02 
 
 		 173 aa  181  7e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  52.63 
 
 		 154 aa  180  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  53.94 
 
 		 225 aa  181  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2042  translation initiation factor IF-3  52.12 
 
 		 199 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0708817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  50.62 
 
 		 207 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  47.57 
 
 		 205 aa  179  4e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  50.61 
 
 		 171 aa  179  4e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000964088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  52.12 
 
 		 173 aa  178  7e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2981  translation initiation factor 3  44.19 
 
 		 238 aa  178  7e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3025  translation initiation factor 3  44.19 
 
 		 238 aa  178  7e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2996  translation initiation factor 3  44.19 
 
 		 238 aa  177  8e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171641  normal  0.0309942 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2666  translation initiation factor IF-3  46.75 
 
 		 176 aa  177  8e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  50.91 
 
 		 178 aa  177  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  51.81 
 
 		 173 aa  177  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2459  translation initiation factor 3  48.55 
 
 		 243 aa  177  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4675  translation initiation factor IF-3  52.1 
 
 		 177 aa  177  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.361003  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 198 aa  176  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000135112  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1412  translation initiation factor IF-3  56.34 
 
 		 143 aa  176  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000852308  normal  0.493061 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0190  translation initiation factor IF-3  48.86 
 
 		 186 aa  176  3e-43  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.140917  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1409  translation initiation factor IF-3  54.04 
 
 		 172 aa  176  3e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.37178e-16  unclonable  1.3418400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0830  translation initiation factor IF-3  52.1 
 
 		 169 aa  176  4e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.124767  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2150  translation initiation factor IF-3  49.4 
 
 		 173 aa  175  4e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  48.78 
 
 		 173 aa  175  4e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2218  translation initiation factor IF-3  50.3 
 
 		 182 aa  175  4e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000264089  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2996  translation initiation factor IF-3  52.17 
 
 		 173 aa  175  5e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  50.3 
 
 		 227 aa  175  5e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6087  Translation initiation factor 3 (IF-3)-like protein  51.53 
 
 		 222 aa  174  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0803  translation initiation factor IF-3  51.2 
 
 		 178 aa  174  9e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1772  translation initiation factor IF-3  52.87 
 
 		 200 aa  174  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000139127  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1932  translation initiation factor IF-3  53.66 
 
 		 177 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00133999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2638  translation initiation factor IF-3  54.55 
 
 		 169 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.294805  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1738  translation initiation factor IF-3  52.87 
 
 		 200 aa  174  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000196833  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1008  translation initiation factor 3  53.55 
 
 		 155 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0442083  hitchhiker  0.00912814 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1800  translation initiation factor 3  52.44 
 
 		 163 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00939294  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3169  translation initiation factor IF-3  51.53 
 
 		 277 aa  173  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3328  translation initiation factor IF-3  46.52 
 
 		 243 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.825238  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2379  translation initiation factor IF-3  53.66 
 
 		 177 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0845211  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0441  translation initiation factor IF-3  51.53 
 
 		 179 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.077533  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2163  translation initiation factor IF-3  53.66 
 
 		 177 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000118732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1314  translation initiation factor IF-3  47.06 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241721  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2505  translation initiation factor IF-3  53.66 
 
 		 177 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.99075  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11658  translation initiation factor IF-3  49.71 
 
 		 201 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>