More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1823 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_1823  translation initiation factor 3 (bIF-3)  100 
 
 		 153 aa  305  1.0000000000000001e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000272282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  64.24 
 
 		 154 aa  214  5e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  64.05 
 
 		 164 aa  212  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  61.18 
 
 		 187 aa  208  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  59.6 
 
 		 179 aa  204  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  62.09 
 
 		 202 aa  203  6e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  62 
 
 		 198 aa  203  7e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1613  translation initiation factor IF-3  66.2 
 
 		 145 aa  202  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000306668  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  62.09 
 
 		 190 aa  199  8e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  58.28 
 
 		 165 aa  199  9.999999999999999e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2054  translation initiation factor IF-3  58.55 
 
 		 152 aa  196  9e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000423398  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2172  translation initiation factor IF-3  58.78 
 
 		 154 aa  196  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000864988  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1225  translation initiation factor 3  59.21 
 
 		 164 aa  191  4e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000314962  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0766  translation initiation factor IF-3  56.21 
 
 		 181 aa  189  9e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  56.95 
 
 		 172 aa  188  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1241  translation initiation factor 3  53.33 
 
 		 170 aa  187  5e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000256408  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3622  translation initiation factor IF-3  51.33 
 
 		 357 aa  186  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0913675  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  56.21 
 
 		 195 aa  185  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000432272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4471  translation initiation factor IF-3  56.21 
 
 		 195 aa  185  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4306  translation initiation factor IF-3  56.21 
 
 		 195 aa  185  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000145665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4317  translation initiation factor IF-3  56.21 
 
 		 195 aa  185  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000117232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  56.21 
 
 		 186 aa  185  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000690292  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4699  translation initiation factor IF-3  56.21 
 
 		 166 aa  184  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000260309  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4690  translation initiation factor IF-3  56.21 
 
 		 166 aa  184  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.37112e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3261  translation initiation factor IF-3  56.21 
 
 		 195 aa  184  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000125648  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4406  translation initiation factor IF-3  56.21 
 
 		 166 aa  184  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000111711  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  54.3 
 
 		 171 aa  184  4e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000964088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  55.56 
 
 		 166 aa  184  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000012216  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  55.56 
 
 		 166 aa  184  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000101645  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2307  translation initiation factor IF-3  53.64 
 
 		 154 aa  183  7e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00282878  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0441  translation initiation factor IF-3  54.97 
 
 		 179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.077533  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1301  translation initiation factor 3  52.94 
 
 		 175 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.444006  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4675  translation initiation factor IF-3  53.29 
 
 		 177 aa  180  5.0000000000000004e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.361003  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2038  translation initiation factor IF-3  52.32 
 
 		 177 aa  179  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.369536 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1204  translation initiation factor IF-3  59.48 
 
 		 171 aa  179  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000244125  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  52 
 
 		 202 aa  177  4e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  50.66 
 
 		 238 aa  177  4.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1738  translation initiation factor IF-3  62.09 
 
 		 200 aa  177  5.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000196833  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1772  translation initiation factor IF-3  62.09 
 
 		 200 aa  177  5.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000139127  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1419  translation initiation factor IF-3  56.94 
 
 		 146 aa  176  9e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000288109  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  47.33 
 
 		 219 aa  176  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1244  translation initiation factor IF-3  62.09 
 
 		 175 aa  176  1e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000317297  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0065  translation initiation factor IF-3  51.66 
 
 		 184 aa  176  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  52 
 
 		 197 aa  176  1e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0930  translation initiation factor 3  54 
 
 		 178 aa  176  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0428  translation initiation factor IF-3  51.66 
 
 		 156 aa  175  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 225 aa  174  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1409  translation initiation factor IF-3  53.59 
 
 		 172 aa  174  3e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.37178e-16  unclonable  1.3418400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_002620  TC0221  translation initiation factor IF-3  51.33 
 
 		 186 aa  174  4e-43  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00015702  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3071  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 182 aa  174  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427548  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1924  translation initiation factor IF-3  55.63 
 
 		 177 aa  174  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  51.33 
 
 		 207 aa  173  6e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  50.98 
 
 		 227 aa  173  7e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  50.67 
 
 		 205 aa  172  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6087  Translation initiation factor 3 (IF-3)-like protein  52 
 
 		 222 aa  172  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  50.67 
 
 		 173 aa  171  1.9999999999999998e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1311  translation initiation factor IF-3  50.66 
 
 		 164 aa  171  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000644552  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1161  translation initiation factor 3  50.66 
 
 		 154 aa  170  7.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.930143 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1412  translation initiation factor IF-3  57.14 
 
 		 143 aa  169  9e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000852308  normal  0.493061 
 
 
-
 
NC_002936  DET0752  translation initiation factor IF-3  54.3 
 
 		 168 aa  169  1e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000893397  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0802  translation initiation factor IF-3  55.63 
 
 		 176 aa  169  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3039  translation initiation factor IF-3  49.33 
 
 		 212 aa  169  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271102  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0830  translation initiation factor IF-3  55.63 
 
 		 176 aa  169  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3052  translation initiation factor IF-3  51.32 
 
 		 182 aa  169  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  50.67 
 
 		 225 aa  169  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  49.67 
 
 		 178 aa  168  3e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3163  translation initiation factor IF-3  48.67 
 
 		 252 aa  168  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12250  translation initiation factor 3  52.35 
 
 		 195 aa  168  3e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.109497  normal  0.154931 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2459  translation initiation factor 3  49.33 
 
 		 243 aa  168  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  49.01 
 
 		 178 aa  167  4e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2066  translation initiation factor 3  48.67 
 
 		 179 aa  167  4e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.383221  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2042  translation initiation factor IF-3  49.33 
 
 		 199 aa  167  4e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0708817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01384  translation initiation factor IF-3  50.99 
 
 		 159 aa  167  5e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0488  translation initiation factor IF-3  50.33 
 
 		 184 aa  167  5e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.270402  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  50.67 
 
 		 198 aa  167  6e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000135112  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  48.37 
 
 		 194 aa  167  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0713  translation initiation factor 3  51.33 
 
 		 249 aa  167  6e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  50.99 
 
 		 192 aa  167  6e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  52.32 
 
 		 173 aa  167  6e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1249  translation initiation factor IF-3  48.67 
 
 		 174 aa  166  9e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.246001 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1218  translation initiation factor IF-3  48.67 
 
 		 173 aa  166  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0326522  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2139  translation initiation factor IF-3  50.67 
 
 		 177 aa  166  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0045601  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2103  translation initiation factor 3  49.33 
 
 		 177 aa  166  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  0.133955 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5473  translation initiation factor IF-3  48.67 
 
 		 204 aa  166  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2853  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 174 aa  166  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0116753 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5483  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 250 aa  166  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4742  translation initiation factor IF-3  45.7 
 
 		 176 aa  165  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.676759  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  47.68 
 
 		 174 aa  166  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0447  translation initiation factor IF-3  55.03 
 
 		 164 aa  164  2.9999999999999998e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000472838  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3169  translation initiation factor IF-3  48 
 
 		 277 aa  164  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3043  initiation factor 3  54.07 
 
 		 139 aa  165  2.9999999999999998e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000731556  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2996  translation initiation factor IF-3  49.66 
 
 		 173 aa  165  2.9999999999999998e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1875  translation initiation factor IF-3  49.33 
 
 		 239 aa  164  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.384688 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0660  translation initiation factor IF-3  50.33 
 
 		 176 aa  164  4e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000367528  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1008  translation initiation factor 3  48.34 
 
 		 155 aa  164  4e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0442083  hitchhiker  0.00912814 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1882  translation initiation factor IF-3  49.33 
 
 		 204 aa  164  5e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0284235  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  47.02 
 
 		 178 aa  164  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0641  translation initiation factor IF-3  49.01 
 
 		 175 aa  164  5e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4232  translation initiation factor IF-3  45.7 
 
 		 173 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738998 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25690  translation initiation factor 3  48.32 
 
 		 168 aa  164  5.9999999999999996e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>