More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3043 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_3043  initiation factor 3  100 
 
 		 139 aa  286  8e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000731556  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  57.55 
 
 		 172 aa  168  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1412  translation initiation factor IF-3  56.12 
 
 		 143 aa  167  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000852308  normal  0.493061 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  53.62 
 
 		 171 aa  164  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000964088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2307  translation initiation factor IF-3  53.24 
 
 		 154 aa  161  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00282878  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  55.56 
 
 		 173 aa  159  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2996  translation initiation factor IF-3  57.14 
 
 		 173 aa  158  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  55.07 
 
 		 194 aa  158  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1419  translation initiation factor IF-3  52.9 
 
 		 146 aa  156  7e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000288109  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4742  translation initiation factor IF-3  51.11 
 
 		 176 aa  155  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.676759  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1612  translation initiation factor IF-3  51.85 
 
 		 173 aa  154  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252676 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  53.62 
 
 		 194 aa  153  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  53.62 
 
 		 194 aa  153  6e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1624  translation initiation factor IF-3  51.11 
 
 		 176 aa  153  6e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101313 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1906  translation initiation factor IF-3  51.11 
 
 		 173 aa  153  7e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  53.85 
 
 		 173 aa  153  8e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4267  translation initiation factor IF-3  53.68 
 
 		 178 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2538  translation initiation factor IF-3  54.07 
 
 		 173 aa  151  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.838605  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1763  translation initiation factor 3  52.31 
 
 		 137 aa  152  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  50.75 
 
 		 202 aa  151  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  53.33 
 
 		 192 aa  151  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  51.49 
 
 		 219 aa  151  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4232  translation initiation factor IF-3  48.89 
 
 		 173 aa  150  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738998 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4532  translation initiation factor IF-3  53.68 
 
 		 204 aa  150  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0803  translation initiation factor IF-3  51.45 
 
 		 178 aa  150  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0265  translation initiation factor IF-3  54.07 
 
 		 173 aa  150  5.9999999999999996e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.910814  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2229  translation initiation factor IF-3  56.12 
 
 		 173 aa  150  5.9999999999999996e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00231449 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1613  translation initiation factor IF-3  51.11 
 
 		 145 aa  150  8e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000306668  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2172  translation initiation factor IF-3  50.72 
 
 		 154 aa  150  8e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000864988  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0041  translation initiation factor IF-3  52.59 
 
 		 192 aa  149  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2032  translation initiation factor IF-3  51.49 
 
 		 134 aa  149  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2117  translation initiation factor IF-3  51.49 
 
 		 134 aa  149  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.998323  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  51.85 
 
 		 174 aa  149  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0983  translation initiation factor IF-3  57.46 
 
 		 176 aa  149  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.104 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2638  translation initiation factor IF-3  57.46 
 
 		 169 aa  148  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.294805  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  52.17 
 
 		 165 aa  148  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3158  translation initiation factor IF-3  48.89 
 
 		 173 aa  149  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0065  translation initiation factor IF-3  51.85 
 
 		 145 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0200  translation initiation factor IF-3  51.47 
 
 		 151 aa  148  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0428  translation initiation factor IF-3  48.89 
 
 		 156 aa  148  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  53.33 
 
 		 187 aa  148  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 238 aa  148  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1991  translation initiation factor IF-3  57.04 
 
 		 138 aa  148  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.386988  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0489  translation initiation factor IF-3  57.78 
 
 		 176 aa  148  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000720798  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3483  translation initiation factor IF-3  52.67 
 
 		 132 aa  148  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.113137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2747  translation initiation factor IF-3  51.85 
 
 		 169 aa  147  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.128829 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3052  translation initiation factor IF-3  50.36 
 
 		 182 aa  147  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  50.37 
 
 		 164 aa  147  5e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  50.75 
 
 		 225 aa  146  7e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3163  translation initiation factor IF-3  48.18 
 
 		 252 aa  146  7e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1975  translation initiation factor IF-3  56.72 
 
 		 233 aa  146  8e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1988  translation initiation factor IF-3  56.72 
 
 		 230 aa  146  9e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.61417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1903  translation initiation factor IF-3  56.72 
 
 		 232 aa  146  9e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.982503  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  51.11 
 
 		 154 aa  146  9e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  48.15 
 
 		 190 aa  146  9e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1823  translation initiation factor 3 (bIF-3)  54.07 
 
 		 153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000272282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0168  translation initiation factor IF-3  51.91 
 
 		 132 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1008  translation initiation factor 3  50.72 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0442083  hitchhiker  0.00912814 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0412  translation initiation factor IF-3  51.91 
 
 		 144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.601649  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0766  translation initiation factor IF-3  48.15 
 
 		 181 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0077  translation initiation factor IF-3  51.11 
 
 		 171 aa  144  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  50.37 
 
 		 178 aa  144  5e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  48.15 
 
 		 202 aa  144  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01384  translation initiation factor IF-3  51.11 
 
 		 159 aa  144  5e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0641  translation initiation factor IF-3  49.63 
 
 		 175 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  49.63 
 
 		 178 aa  143  7.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0069  translation initiation factor IF-3  50.37 
 
 		 171 aa  143  7.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.097761 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1778  translation initiation factor IF-3  46.67 
 
 		 156 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.843423 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1880  translation initiation factor IF-3  54.74 
 
 		 229 aa  143  9e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.10659 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1161  translation initiation factor 3  48.89 
 
 		 154 aa  143  9e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.930143 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2676  translation initiation factor 3  50 
 
 		 137 aa  142  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.233816 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4616  translation initiation factor 3  46.67 
 
 		 156 aa  142  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00507113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3488  translation initiation factor 3  54.81 
 
 		 173 aa  142  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0341  initiation factor 3  51.15 
 
 		 132 aa  143  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2002  translation initiation factor 3  47.1 
 
 		 153 aa  142  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0994  translation initiation factor IF-3  46.67 
 
 		 156 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0218  translation initiation factor IF-3  51.11 
 
 		 200 aa  142  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1360  translation initiation factor IF-3  46.67 
 
 		 156 aa  142  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.485624  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1453  translation initiation factor IF-3  46.67 
 
 		 156 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0525841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1476  translation initiation factor IF-3  46.67 
 
 		 156 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348442  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1400  translation initiation factor IF-3  46.67 
 
 		 156 aa  142  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0821028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2150  translation initiation factor IF-3  48.89 
 
 		 173 aa  142  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  48.51 
 
 		 197 aa  142  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0190  translation initiation factor IF-3  50.74 
 
 		 186 aa  141  3e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.140917  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  44.93 
 
 		 173 aa  140  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  46.15 
 
 		 207 aa  140  4e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1095  translation initiation factor IF-3  45.93 
 
 		 156 aa  140  5e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.171775  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1891  translation initiation factor IF-3  45.93 
 
 		 156 aa  140  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2594  translation initiation factor IF-3  45.93 
 
 		 156 aa  140  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1736  translation initiation factor IF-3  45.93 
 
 		 156 aa  140  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1713  translation initiation factor IF-3  45.93 
 
 		 156 aa  140  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225755  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0724  translation initiation factor IF-3  48.91 
 
 		 194 aa  140  5e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000346718  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1538  translation initiation factor IF-3  45.93 
 
 		 156 aa  140  5e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0201  translation initiation factor IF-3  45.93 
 
 		 156 aa  140  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00116998  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0488  translation initiation factor IF-3  48.09 
 
 		 184 aa  140  6e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.270402  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  46.04 
 
 		 179 aa  140  6e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0964  translation initiation factor IF-3  45.93 
 
 		 156 aa  140  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.698743  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2613  translation initiation factor IF-3  46.83 
 
 		 172 aa  140  6e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0154974  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  50.77 
 
 		 198 aa  140  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2242  translation initiation factor IF-3  46.83 
 
 		 166 aa  140  7e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000466118  hitchhiker  0.00531509 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>