More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1988 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1988  translation initiation factor IF-3  100 
 
 		 230 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.61417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1903  translation initiation factor IF-3  100 
 
 		 232 aa  360  1e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.982503  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1975  translation initiation factor IF-3  98.95 
 
 		 233 aa  356  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1880  translation initiation factor IF-3  90.1 
 
 		 229 aa  323  1e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.10659 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  60.12 
 
 		 172 aa  207  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0983  translation initiation factor IF-3  55.42 
 
 		 176 aa  201  8e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.104 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2996  translation initiation factor IF-3  53.01 
 
 		 173 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  55.42 
 
 		 171 aa  196  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000964088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2229  translation initiation factor IF-3  60.74 
 
 		 173 aa  194  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00231449 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  45.45 
 
 		 238 aa  193  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0641  translation initiation factor IF-3  55.56 
 
 		 175 aa  193  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  54.55 
 
 		 173 aa  193  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  53.37 
 
 		 173 aa  192  5e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  51.2 
 
 		 190 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4267  translation initiation factor IF-3  52.47 
 
 		 178 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0488  translation initiation factor IF-3  46.96 
 
 		 184 aa  185  4e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.270402  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0713  translation initiation factor 3  49.29 
 
 		 249 aa  186  4e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2804  translation initiation factor IF-3  52.66 
 
 		 180 aa  185  5e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  50.6 
 
 		 202 aa  185  5e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  51.52 
 
 		 225 aa  185  6e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 194 aa  185  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  51.2 
 
 		 187 aa  184  7e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01384  translation initiation factor IF-3  56.41 
 
 		 159 aa  184  7e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2459  translation initiation factor 3  48.89 
 
 		 243 aa  184  8e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  51.52 
 
 		 178 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4532  translation initiation factor IF-3  51.23 
 
 		 204 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3261  translation initiation factor IF-3  49.4 
 
 		 195 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000125648  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2109  translation initiation factor IF-3  52.47 
 
 		 219 aa  183  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000273336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3158  translation initiation factor IF-3  52.15 
 
 		 173 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  48.86 
 
 		 202 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  51.5 
 
 		 227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2150  translation initiation factor IF-3  50.62 
 
 		 173 aa  182  3e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  50.61 
 
 		 194 aa  182  3e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  50.61 
 
 		 194 aa  182  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1612  translation initiation factor IF-3  51.53 
 
 		 173 aa  182  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252676 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0489  translation initiation factor IF-3  55.21 
 
 		 176 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000720798  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2307  translation initiation factor IF-3  53.59 
 
 		 154 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00282878  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2747  translation initiation factor IF-3  52.47 
 
 		 169 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.128829 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1008  translation initiation factor 3  56.13 
 
 		 155 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0442083  hitchhiker  0.00912814 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  51.81 
 
 		 198 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  50.86 
 
 		 225 aa  181  6e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  51.85 
 
 		 174 aa  181  8.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  50.9 
 
 		 205 aa  181  8.000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1968  translation initiation factor IF-3  51.83 
 
 		 183 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00361564  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2466  translation initiation factor IF-3  51.83 
 
 		 177 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00240261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  52.47 
 
 		 173 aa  180  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1924  translation initiation factor IF-3  54.12 
 
 		 180 aa  179  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000676935  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  48.19 
 
 		 195 aa  179  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000432272  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1624  translation initiation factor IF-3  50.31 
 
 		 176 aa  180  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101313 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  47.16 
 
 		 207 aa  180  2e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3480  translation initiation factor IF-3  51.83 
 
 		 183 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0422454  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4471  translation initiation factor IF-3  48.19 
 
 		 195 aa  179  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4306  translation initiation factor IF-3  48.19 
 
 		 195 aa  179  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000145665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4317  translation initiation factor IF-3  48.19 
 
 		 195 aa  179  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000117232  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1914  translation initiation factor IF-3  54.12 
 
 		 180 aa  179  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.119522  normal  0.223345 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3224  translation initiation factor IF-3  51.83 
 
 		 183 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51494 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01676  hypothetical protein  54.12 
 
 		 180 aa  179  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0101258  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1906  translation initiation factor IF-3  50.31 
 
 		 173 aa  180  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  48.19 
 
 		 186 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000690292  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  50.91 
 
 		 173 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2613  translation initiation factor IF-3  52.66 
 
 		 172 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0154974  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1875  translation initiation factor IF-3  48.26 
 
 		 239 aa  179  4e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.384688 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4742  translation initiation factor IF-3  51.53 
 
 		 176 aa  179  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.676759  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2638  translation initiation factor IF-3  52.41 
 
 		 169 aa  178  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.294805  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2242  translation initiation factor IF-3  54.6 
 
 		 166 aa  178  4.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000466118  hitchhiker  0.00531509 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1412  translation initiation factor IF-3  59.15 
 
 		 143 aa  178  7e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000852308  normal  0.493061 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2538  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 173 aa  177  9e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.838605  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0265  translation initiation factor IF-3  53.7 
 
 		 173 aa  177  9e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.910814  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  48.75 
 
 		 164 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  48.15 
 
 		 179 aa  177  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0803  translation initiation factor IF-3  51.85 
 
 		 178 aa  177  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  51.53 
 
 		 178 aa  177  2e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  50.92 
 
 		 178 aa  176  2e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  52.6 
 
 		 165 aa  177  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  52.63 
 
 		 154 aa  177  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  51.83 
 
 		 198 aa  177  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000135112  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0190  translation initiation factor IF-3  48.33 
 
 		 186 aa  176  2e-43  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.140917  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5473  translation initiation factor IF-3  48.84 
 
 		 204 aa  176  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0200  translation initiation factor IF-3  53.33 
 
 		 151 aa  176  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3039  translation initiation factor IF-3  48.37 
 
 		 212 aa  176  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271102  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1678  translation initiation factor IF-3  50.93 
 
 		 170 aa  176  3e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0127847  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4699  translation initiation factor IF-3  48.75 
 
 		 166 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000260309  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4690  translation initiation factor IF-3  48.75 
 
 		 166 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.37112e-62 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2853  translation initiation factor IF-3  48.3 
 
 		 174 aa  176  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0116753 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2042  translation initiation factor IF-3  45.18 
 
 		 199 aa  176  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0708817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  48.12 
 
 		 166 aa  175  5e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000101645  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0471  translation initiation factor IF-3  50.92 
 
 		 171 aa  175  5e-43  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.973019  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  46.59 
 
 		 197 aa  175  5e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  48.12 
 
 		 166 aa  175  5e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000012216  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1778  translation initiation factor IF-3  50.97 
 
 		 156 aa  175  6e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.843423 
 
 
-
 
NC_002620  TC0221  translation initiation factor IF-3  45.51 
 
 		 186 aa  175  7e-43  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00015702  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4232  translation initiation factor IF-3  50.31 
 
 		 173 aa  175  7e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738998 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4406  translation initiation factor IF-3  48.75 
 
 		 166 aa  174  7e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000111711  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0428  translation initiation factor IF-3  51.97 
 
 		 156 aa  175  7e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1400  translation initiation factor IF-3  50.97 
 
 		 156 aa  174  7e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0821028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3488  translation initiation factor 3  54.49 
 
 		 173 aa  175  7e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1360  translation initiation factor IF-3  50.97 
 
 		 156 aa  174  7e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.485624  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4616  translation initiation factor 3  50.97 
 
 		 156 aa  174  8e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00507113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  50.62 
 
 		 192 aa  174  8e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1476  translation initiation factor IF-3  50.97 
 
 		 156 aa  174  8e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>