More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3158 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3158  translation initiation factor IF-3  100 
 
 
173 aa  351  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1612  translation initiation factor IF-3  92.49 
 
 
173 aa  327  6e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00252676 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1624  translation initiation factor IF-3  92.49 
 
 
176 aa  326  9e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0101313 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1906  translation initiation factor IF-3  92.49 
 
 
173 aa  326  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4232  translation initiation factor IF-3  90.75 
 
 
173 aa  322  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00738998 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4742  translation initiation factor IF-3  89.6 
 
 
176 aa  320  9.000000000000001e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.676759  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0641  translation initiation factor IF-3  77.33 
 
 
175 aa  272  1.0000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2109  translation initiation factor IF-3  77.65 
 
 
219 aa  271  2.0000000000000002e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000273336  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  75.44 
 
 
174 aa  269  1e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0803  translation initiation factor IF-3  69.82 
 
 
178 aa  243  8e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4532  translation initiation factor IF-3  66.08 
 
 
204 aa  235  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4267  translation initiation factor IF-3  66.08 
 
 
178 aa  235  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  65.48 
 
 
192 aa  231  5e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0218  translation initiation factor IF-3  62.21 
 
 
200 aa  230  7.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0077  translation initiation factor IF-3  63.01 
 
 
171 aa  230  8.000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1341  translation initiation factor IF-3  60.12 
 
 
173 aa  228  2e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0041  translation initiation factor IF-3  62.79 
 
 
192 aa  229  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0069  translation initiation factor IF-3  62.43 
 
 
171 aa  228  4e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.097761 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  65.29 
 
 
173 aa  228  4e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0200  translation initiation factor IF-3  66.89 
 
 
151 aa  218  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3488  translation initiation factor 3  65.29 
 
 
173 aa  213  9e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2150  translation initiation factor IF-3  59.77 
 
 
173 aa  212  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235978  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  59.41 
 
 
202 aa  211  2.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1196  translation initiation factor IF-3  71.18 
 
 
173 aa  211  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.501518  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  60.37 
 
 
173 aa  208  3e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  58.62 
 
 
194 aa  208  3e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  58.62 
 
 
194 aa  208  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2117  translation initiation factor IF-3  70.9 
 
 
134 aa  208  4e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.998323  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2032  translation initiation factor IF-3  70.9 
 
 
134 aa  208  4e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2538  translation initiation factor IF-3  58.38 
 
 
173 aa  207  5e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.838605  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  56.9 
 
 
194 aa  207  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0065  translation initiation factor IF-3  65.28 
 
 
145 aa  206  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0265  translation initiation factor IF-3  58.14 
 
 
173 aa  206  1e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.910814  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2747  translation initiation factor IF-3  57.49 
 
 
169 aa  203  8e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.128829 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3483  translation initiation factor IF-3  69.7 
 
 
132 aa  201  5e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.113137  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0168  translation initiation factor IF-3  68.18 
 
 
132 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  56.29 
 
 
190 aa  198  3.9999999999999996e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0123  translation initiation factor 3  62.35 
 
 
201 aa  195  2.0000000000000003e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.228507  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  55.49 
 
 
173 aa  194  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0341  initiation factor 3  65.15 
 
 
132 aa  194  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  54.27 
 
 
178 aa  193  9e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  55.88 
 
 
238 aa  190  7e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  55.29 
 
 
225 aa  190  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1453  translation initiation factor IF-3  57.04 
 
 
156 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0525841  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4616  translation initiation factor 3  57.04 
 
 
156 aa  186  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00507113  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1400  translation initiation factor IF-3  57.04 
 
 
156 aa  186  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0821028  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1372  translation initiation factor 3  57.04 
 
 
156 aa  186  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0696405  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1161  translation initiation factor 3  57.75 
 
 
154 aa  186  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.930143 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0994  translation initiation factor IF-3  57.04 
 
 
156 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1360  translation initiation factor IF-3  57.04 
 
 
156 aa  186  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.485624  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1476  translation initiation factor IF-3  57.04 
 
 
156 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348442  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  52.27 
 
 
178 aa  186  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  52.27 
 
 
178 aa  185  2e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1763  translation initiation factor 3  60.9 
 
 
137 aa  185  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2218  translation initiation factor IF-3  53.49 
 
 
182 aa  185  3e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000264089  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2755  translation initiation factor IF-3  56.34 
 
 
156 aa  184  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22658  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1557  translation initiation factor IF-3  56.34 
 
 
156 aa  184  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1778  translation initiation factor IF-3  56.34 
 
 
156 aa  184  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.843423 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1713  translation initiation factor IF-3  52.94 
 
 
156 aa  183  9e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225755  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1095  translation initiation factor IF-3  52.94 
 
 
156 aa  183  9e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.171775  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1736  translation initiation factor IF-3  52.94 
 
 
156 aa  183  9e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1538  translation initiation factor IF-3  52.94 
 
 
156 aa  183  9e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1891  translation initiation factor IF-3  52.94 
 
 
156 aa  183  9e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2594  translation initiation factor IF-3  52.94 
 
 
156 aa  183  9e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1008  translation initiation factor 3  54.25 
 
 
155 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0442083  hitchhiker  0.00912814 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0201  translation initiation factor IF-3  52.94 
 
 
156 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00116998  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2103  translation initiation factor 3  54.25 
 
 
177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  0.133955 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0964  translation initiation factor IF-3  52.94 
 
 
156 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.698743  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0364  translation initiation factor 3  52.94 
 
 
182 aa  183  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000297976  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0488  translation initiation factor IF-3  54.25 
 
 
184 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.270402  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2853  translation initiation factor IF-3  54.25 
 
 
174 aa  182  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0116753 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0412  translation initiation factor IF-3  59.15 
 
 
144 aa  182  3e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.601649  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0830  translation initiation factor IF-3  53.99 
 
 
169 aa  181  6e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.124767  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  54.9 
 
 
165 aa  180  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  51.22 
 
 
187 aa  179  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2676  translation initiation factor 3  61.07 
 
 
137 aa  179  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.233816 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1800  translation initiation factor 3  56.41 
 
 
163 aa  179  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00939294  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1968  translation initiation factor IF-3  49.4 
 
 
183 aa  177  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00361564  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  49.38 
 
 
190 aa  177  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2466  translation initiation factor IF-3  50.32 
 
 
177 aa  177  7e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00240261  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3480  translation initiation factor IF-3  50.32 
 
 
183 aa  177  7e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0422454  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3224  translation initiation factor IF-3  50.32 
 
 
183 aa  177  7e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.51494 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3163  translation initiation factor IF-3  51.5 
 
 
252 aa  177  9e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170352  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  49.38 
 
 
202 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  48.15 
 
 
195 aa  175  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000432272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4471  translation initiation factor IF-3  48.15 
 
 
195 aa  175  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4306  translation initiation factor IF-3  48.15 
 
 
195 aa  175  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000145665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4317  translation initiation factor IF-3  48.15 
 
 
195 aa  175  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000117232  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  48.77 
 
 
166 aa  176  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000101645  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  48.15 
 
 
186 aa  175  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000690292  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0428  translation initiation factor IF-3  52.29 
 
 
156 aa  175  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  48.77 
 
 
166 aa  176  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000012216  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4690  translation initiation factor IF-3  48.15 
 
 
166 aa  175  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.37112e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4699  translation initiation factor IF-3  48.15 
 
 
166 aa  175  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000260309  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2002  translation initiation factor 3  56.34 
 
 
153 aa  175  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112753  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  52.44 
 
 
227 aa  175  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4406  translation initiation factor IF-3  48.15 
 
 
166 aa  174  5e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000111711  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  49.38 
 
 
164 aa  174  5e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2042  translation initiation factor IF-3  52.44 
 
 
199 aa  173  9e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0708817  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2221  translation initiation factor IF-3  55.23 
 
 
180 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000103984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>