More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0724 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_0724  translation initiation factor IF-3  100 
 
 		 194 aa  389  1e-107  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000346718  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  56.96 
 
 		 202 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  53.46 
 
 		 173 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  56.33 
 
 		 192 aa  180  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1218  translation initiation factor IF-3  49.44 
 
 		 173 aa  179  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0326522  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  56.58 
 
 		 173 aa  177  5.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  48.57 
 
 		 219 aa  173  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0641  translation initiation factor IF-3  56.96 
 
 		 175 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  50.96 
 
 		 172 aa  171  5e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  48.54 
 
 		 197 aa  170  1e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2109  translation initiation factor IF-3  54.43 
 
 		 219 aa  170  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000273336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  49.69 
 
 		 165 aa  170  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1341  translation initiation factor IF-3  50.63 
 
 		 173 aa  169  3e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2996  translation initiation factor IF-3  51.57 
 
 		 173 aa  168  4e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1249  translation initiation factor IF-3  51.48 
 
 		 174 aa  168  5e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.246001 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4742  translation initiation factor IF-3  53.59 
 
 		 176 aa  167  8e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.676759  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2172  translation initiation factor IF-3  52.35 
 
 		 154 aa  167  8e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000864988  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3158  translation initiation factor IF-3  53.59 
 
 		 173 aa  167  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0803  translation initiation factor IF-3  53.8 
 
 		 178 aa  167  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4232  translation initiation factor IF-3  52.94 
 
 		 173 aa  166  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738998 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 173 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0713  translation initiation factor 3  47.65 
 
 		 249 aa  164  5e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  50.63 
 
 		 173 aa  164  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0077  translation initiation factor IF-3  51.27 
 
 		 171 aa  164  8e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  48.73 
 
 		 179 aa  164  8e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2307  translation initiation factor IF-3  49.33 
 
 		 154 aa  164  8e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00282878  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4267  translation initiation factor IF-3  51.9 
 
 		 178 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0069  translation initiation factor IF-3  51.27 
 
 		 171 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.097761 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0200  translation initiation factor IF-3  52.67 
 
 		 151 aa  163  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1624  translation initiation factor IF-3  52.94 
 
 		 176 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101313 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1906  translation initiation factor IF-3  52.94 
 
 		 173 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1763  translation initiation factor 3  58.21 
 
 		 137 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  45.26 
 
 		 225 aa  163  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  46.5 
 
 		 164 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  48.43 
 
 		 198 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  50.63 
 
 		 174 aa  162  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1612  translation initiation factor IF-3  52.94 
 
 		 173 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252676 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  52.83 
 
 		 194 aa  162  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1412  translation initiation factor IF-3  51.08 
 
 		 143 aa  162  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000852308  normal  0.493061 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  52.83 
 
 		 194 aa  162  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4532  translation initiation factor IF-3  51.27 
 
 		 204 aa  162  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  48.73 
 
 		 187 aa  162  4.0000000000000004e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3163  translation initiation factor IF-3  49.04 
 
 		 252 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  45.05 
 
 		 238 aa  161  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1311  translation initiation factor IF-3  48.73 
 
 		 164 aa  161  6e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000644552  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  50.94 
 
 		 194 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  47.47 
 
 		 178 aa  160  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  47.77 
 
 		 171 aa  160  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000964088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0364  translation initiation factor 3  52.87 
 
 		 182 aa  160  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000297976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  48.73 
 
 		 207 aa  159  2e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4675  translation initiation factor IF-3  49.04 
 
 		 177 aa  159  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.361003  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0041  translation initiation factor IF-3  49.37 
 
 		 192 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1419  translation initiation factor IF-3  53.52 
 
 		 146 aa  158  5e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000288109  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  48.73 
 
 		 202 aa  158  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  48.1 
 
 		 225 aa  158  6e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_002620  TC0221  translation initiation factor IF-3  46.11 
 
 		 186 aa  157  9e-38  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00015702  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3039  translation initiation factor IF-3  47.88 
 
 		 212 aa  157  9e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271102  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2156  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 175 aa  157  1e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000187486  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  49.68 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  47.59 
 
 		 205 aa  157  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3071  translation initiation factor IF-3  44.44 
 
 		 182 aa  157  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427548  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0660  translation initiation factor IF-3  45.57 
 
 		 176 aa  156  2e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000367528  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2638  translation initiation factor IF-3  50.94 
 
 		 169 aa  156  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.294805  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0218  translation initiation factor IF-3  48.73 
 
 		 200 aa  156  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1613  translation initiation factor IF-3  52.21 
 
 		 145 aa  156  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000306668  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2042  translation initiation factor IF-3  47.53 
 
 		 199 aa  156  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0708817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2747  translation initiation factor IF-3  49.68 
 
 		 169 aa  155  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.128829 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 190 aa  155  3e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  47.33 
 
 		 154 aa  155  4e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2038  translation initiation factor IF-3  47.77 
 
 		 177 aa  154  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.369536 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2229  translation initiation factor IF-3  48.41 
 
 		 173 aa  154  6e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00231449 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2613  translation initiation factor IF-3  51.9 
 
 		 172 aa  154  8e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0154974  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0065  translation initiation factor IF-3  47.13 
 
 		 184 aa  154  9e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2242  translation initiation factor IF-3  51.9 
 
 		 166 aa  154  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000466118  hitchhiker  0.00531509 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1314  translation initiation factor IF-3  41.82 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241721  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0082  translation initiation factor IF-3  48.73 
 
 		 171 aa  153  1e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000496209  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  49.06 
 
 		 198 aa  153  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000135112  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2032  translation initiation factor IF-3  54.89 
 
 		 134 aa  153  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2117  translation initiation factor IF-3  54.89 
 
 		 134 aa  153  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.998323  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5483  translation initiation factor IF-3  47.13 
 
 		 250 aa  152  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3169  translation initiation factor IF-3  48.41 
 
 		 277 aa  152  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2218  translation initiation factor IF-3  46.84 
 
 		 182 aa  152  2.9999999999999998e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000264089  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  47.77 
 
 		 190 aa  152  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1241  translation initiation factor 3  45.68 
 
 		 170 aa  151  5.9999999999999996e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000256408  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1875  translation initiation factor IF-3  44.94 
 
 		 239 aa  151  5.9999999999999996e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.384688 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2066  translation initiation factor 3  47.71 
 
 		 179 aa  151  5.9999999999999996e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.383221  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3488  translation initiation factor 3  54.43 
 
 		 173 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1409  translation initiation factor IF-3  48.43 
 
 		 172 aa  150  8e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.37178e-16  unclonable  1.3418400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5473  translation initiation factor IF-3  47.13 
 
 		 204 aa  150  8e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6087  Translation initiation factor 3 (IF-3)-like protein  47.77 
 
 		 222 aa  150  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2996  translation initiation factor 3  44.83 
 
 		 238 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171641  normal  0.0309942 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1225  translation initiation factor 3  46.2 
 
 		 164 aa  150  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000314962  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1882  translation initiation factor IF-3  44.94 
 
 		 204 aa  150  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0284235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1161  translation initiation factor 3  48.97 
 
 		 154 aa  150  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.930143 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2981  translation initiation factor 3  44.83 
 
 		 238 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2459  translation initiation factor 3  44.44 
 
 		 243 aa  150  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3025  translation initiation factor 3  44.83 
 
 		 238 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1968  translation initiation factor IF-3  49.04 
 
 		 183 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00361564  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1768  translation initiation factor IF-3  51.27 
 
 		 221 aa  149  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.40976 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0123  translation initiation factor 3  53.16 
 
 		 201 aa  149  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.228507  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>