More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0364 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0364  translation initiation factor 3  100 
 
 		 182 aa  371  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000297976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  57.89 
 
 		 202 aa  210  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  59.06 
 
 		 194 aa  207  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  59.06 
 
 		 194 aa  207  5e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  57.31 
 
 		 194 aa  206  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3488  translation initiation factor 3  59.17 
 
 		 173 aa  204  6e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  58.18 
 
 		 190 aa  200  8e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  54.07 
 
 		 174 aa  198  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  55.56 
 
 		 173 aa  194  6e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  55.03 
 
 		 173 aa  193  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1341  translation initiation factor IF-3  52.05 
 
 		 173 aa  190  7e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2150  translation initiation factor IF-3  53.85 
 
 		 173 aa  189  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4742  translation initiation factor IF-3  52.87 
 
 		 176 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.676759  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0803  translation initiation factor IF-3  52.91 
 
 		 178 aa  188  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  51.96 
 
 		 238 aa  187  8e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  53.94 
 
 		 178 aa  186  1e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  53.94 
 
 		 178 aa  186  1e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  54.07 
 
 		 192 aa  186  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  53.29 
 
 		 178 aa  186  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0641  translation initiation factor IF-3  51.76 
 
 		 175 aa  186  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  54.49 
 
 		 173 aa  186  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  53.29 
 
 		 225 aa  184  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4232  translation initiation factor IF-3  52.94 
 
 		 173 aa  184  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738998 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3622  translation initiation factor IF-3  50.28 
 
 		 357 aa  184  9e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0913675  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3158  translation initiation factor IF-3  52.94 
 
 		 173 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  54.27 
 
 		 205 aa  183  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  51.18 
 
 		 219 aa  182  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1624  translation initiation factor IF-3  51.15 
 
 		 176 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101313 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2466  translation initiation factor IF-3  51.98 
 
 		 177 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00240261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1968  translation initiation factor IF-3  54.04 
 
 		 183 aa  181  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00361564  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3224  translation initiation factor IF-3  51.98 
 
 		 183 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51494 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3480  translation initiation factor IF-3  51.98 
 
 		 183 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0422454  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0428  translation initiation factor IF-3  54.61 
 
 		 156 aa  181  7e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  53.29 
 
 		 227 aa  179  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4532  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 204 aa  179  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1906  translation initiation factor IF-3  51.76 
 
 		 173 aa  180  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4267  translation initiation factor IF-3  50.6 
 
 		 178 aa  179  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2218  translation initiation factor IF-3  50.89 
 
 		 182 aa  179  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000264089  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  50.91 
 
 		 173 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1008  translation initiation factor 3  53.59 
 
 		 155 aa  178  4e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0442083  hitchhiker  0.00912814 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0077  translation initiation factor IF-3  49.41 
 
 		 171 aa  178  4e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1612  translation initiation factor IF-3  51.18 
 
 		 173 aa  178  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252676 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2109  translation initiation factor IF-3  51.18 
 
 		 219 aa  178  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000273336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1977  translation initiation factor IF-3  55.28 
 
 		 177 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.269445  normal  0.0568676 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2538  translation initiation factor IF-3  49.11 
 
 		 173 aa  177  4.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.838605  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1800  translation initiation factor 3  54.04 
 
 		 163 aa  178  4.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00939294  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  50 
 
 		 207 aa  177  5.999999999999999e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2804  translation initiation factor IF-3  49.12 
 
 		 180 aa  176  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0489  translation initiation factor IF-3  49.43 
 
 		 176 aa  176  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000720798  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0830  translation initiation factor IF-3  54.94 
 
 		 169 aa  176  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.124767  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20430  translation initiation factor IF-3  51.7 
 
 		 177 aa  176  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  51.23 
 
 		 198 aa  176  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000135112  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2747  translation initiation factor IF-3  49.09 
 
 		 169 aa  176  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.128829 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2042  translation initiation factor IF-3  52.76 
 
 		 199 aa  176  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0708817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1768  translation initiation factor IF-3  55.03 
 
 		 221 aa  175  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.40976 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2981  translation initiation factor 3  54.88 
 
 		 238 aa  175  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3025  translation initiation factor 3  54.88 
 
 		 238 aa  175  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2379  translation initiation factor IF-3  52.8 
 
 		 177 aa  175  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0845211  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2163  translation initiation factor IF-3  52.8 
 
 		 177 aa  175  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000118732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2996  translation initiation factor 3  54.88 
 
 		 238 aa  175  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171641  normal  0.0309942 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1932  translation initiation factor IF-3  52.8 
 
 		 177 aa  174  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00133999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2638  translation initiation factor IF-3  52.12 
 
 		 169 aa  175  4e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.294805  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2505  translation initiation factor IF-3  53.42 
 
 		 177 aa  174  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.99075  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0041  translation initiation factor IF-3  49.11 
 
 		 192 aa  174  5e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0069  translation initiation factor IF-3  48.82 
 
 		 171 aa  174  5e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.097761 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11658  translation initiation factor IF-3  54.27 
 
 		 201 aa  174  5e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14590  translation initiation factor 3  53.7 
 
 		 401 aa  174  6e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28660  translation initiation factor IF-3  53.42 
 
 		 177 aa  174  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000259634 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0218  translation initiation factor IF-3  49.43 
 
 		 200 aa  174  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3328  translation initiation factor IF-3  54.27 
 
 		 243 aa  174  6e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.825238  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6087  Translation initiation factor 3 (IF-3)-like protein  52.76 
 
 		 222 aa  174  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897729  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2908  translation initiation factor IF-3  51.79 
 
 		 185 aa  174  8e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2052  translation initiation factor IF-3  54.27 
 
 		 180 aa  173  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0593383  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  53.37 
 
 		 225 aa  173  9.999999999999999e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0265  translation initiation factor IF-3  50.6 
 
 		 173 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.910814  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  51.85 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3052  translation initiation factor IF-3  54.32 
 
 		 182 aa  172  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0983  translation initiation factor IF-3  48.84 
 
 		 176 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.104 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2459  translation initiation factor 3  50.29 
 
 		 243 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1875  translation initiation factor IF-3  52.76 
 
 		 239 aa  171  5e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.384688 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3163  translation initiation factor IF-3  48.84 
 
 		 252 aa  171  5e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01384  translation initiation factor IF-3  50.97 
 
 		 159 aa  171  5.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1477  translation initiation factor 3  50.9 
 
 		 396 aa  171  5.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0613769  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0200  translation initiation factor IF-3  52.67 
 
 		 151 aa  171  6.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1763  translation initiation factor 3  60.77 
 
 		 137 aa  171  7.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0522  translation initiation factor IF-3  49.09 
 
 		 193 aa  170  7.999999999999999e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000692532  hitchhiker  0.000000579185 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1480  translation initiation factor IF-3  50.9 
 
 		 356 aa  170  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000187235 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1952  translation initiation factor IF-3  53.05 
 
 		 180 aa  170  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.26259  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1778  translation initiation factor IF-3  51.32 
 
 		 156 aa  169  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.843423 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1924  translation initiation factor IF-3  52.66 
 
 		 180 aa  169  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000676935  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3090  translation initiation factor IF-3  53.55 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.639467  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1316  translation initiation factor IF-3  53.09 
 
 		 351 aa  169  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1889  translation initiation factor IF-3  53.66 
 
 		 180 aa  169  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2181  translation initiation factor IF-3  53.66 
 
 		 180 aa  169  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0268784  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01676  hypothetical protein  52.66 
 
 		 180 aa  169  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0101258  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1914  translation initiation factor IF-3  52.66 
 
 		 180 aa  169  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.119522  normal  0.223345 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5483  translation initiation factor IF-3  53.99 
 
 		 250 aa  169  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1882  translation initiation factor IF-3  52.47 
 
 		 204 aa  169  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0284235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2853  translation initiation factor IF-3  51.92 
 
 		 174 aa  168  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0116753 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1736  translation initiation factor IF-3  50.33 
 
 		 156 aa  168  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>