More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0660 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0660  translation initiation factor IF-3  100 
 
 		 176 aa  351  2.9999999999999997e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000367528  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0923  translation initiation factor IF-3  74.26 
 
 		 141 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000477215  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1203  translation initiation factor IF-3  62.25 
 
 		 150 aa  190  7e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000877866  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 173 aa  185  2e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1253  translation initiation factor IF-3  61.81 
 
 		 144 aa  184  6e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00905146  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  51.25 
 
 		 207 aa  181  6e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  48.48 
 
 		 202 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1249  translation initiation factor IF-3  52.5 
 
 		 174 aa  176  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.246001 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2996  translation initiation factor IF-3  49.69 
 
 		 173 aa  175  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  47.65 
 
 		 178 aa  174  7e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  48.45 
 
 		 171 aa  174  8e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000964088  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  47.65 
 
 		 178 aa  173  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  50.62 
 
 		 198 aa  172  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000135112  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  47.53 
 
 		 166 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000012216  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  47.53 
 
 		 166 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000101645  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4699  translation initiation factor IF-3  46.91 
 
 		 166 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000260309  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1225  translation initiation factor 3  48.45 
 
 		 164 aa  171  3.9999999999999995e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000314962  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0713  translation initiation factor 3  50.3 
 
 		 249 aa  171  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4690  translation initiation factor IF-3  46.91 
 
 		 166 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.37112e-62 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1311  translation initiation factor IF-3  47.83 
 
 		 164 aa  171  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000644552  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  47.71 
 
 		 165 aa  171  5e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2638  translation initiation factor IF-3  52.17 
 
 		 169 aa  171  5e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.294805  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4406  translation initiation factor IF-3  46.91 
 
 		 166 aa  171  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000111711  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  48.45 
 
 		 179 aa  171  5e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  49.07 
 
 		 164 aa  171  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  48.7 
 
 		 154 aa  170  6.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  48.45 
 
 		 172 aa  170  7.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1314  translation initiation factor IF-3  50.93 
 
 		 185 aa  170  7.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241721  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  46.91 
 
 		 186 aa  170  9e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000690292  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  46.91 
 
 		 195 aa  170  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000432272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4471  translation initiation factor IF-3  46.91 
 
 		 195 aa  170  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4306  translation initiation factor IF-3  46.91 
 
 		 195 aa  170  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000145665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4317  translation initiation factor IF-3  46.91 
 
 		 195 aa  170  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000117232  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3261  translation initiation factor IF-3  45.68 
 
 		 195 aa  170  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000125648  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1218  translation initiation factor IF-3  51.63 
 
 		 173 aa  169  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0326522  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  46.67 
 
 		 190 aa  169  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2747  translation initiation factor IF-3  50.93 
 
 		 169 aa  168  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.128829 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  48.12 
 
 		 197 aa  168  4e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  48.12 
 
 		 202 aa  167  5e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2218  translation initiation factor IF-3  50.93 
 
 		 182 aa  167  6e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000264089  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1613  translation initiation factor IF-3  55.32 
 
 		 145 aa  167  7e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000306668  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3488  translation initiation factor 3  52.8 
 
 		 173 aa  167  8e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0983  translation initiation factor IF-3  46.39 
 
 		 176 aa  167  9e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.104 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  49.38 
 
 		 227 aa  167  9e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11658  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 201 aa  166  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0069  translation initiation factor IF-3  44.72 
 
 		 171 aa  166  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.097761 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  44.25 
 
 		 174 aa  166  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  48.45 
 
 		 178 aa  166  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5473  translation initiation factor IF-3  48.75 
 
 		 204 aa  166  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  47.85 
 
 		 194 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0077  translation initiation factor IF-3  44.1 
 
 		 171 aa  166  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  47.85 
 
 		 194 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  50.31 
 
 		 190 aa  165  2.9999999999999998e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3039  translation initiation factor IF-3  48.75 
 
 		 212 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271102  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  46.01 
 
 		 194 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0522  translation initiation factor IF-3  46.51 
 
 		 193 aa  165  2.9999999999999998e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000692532  hitchhiker  0.000000579185 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0218  translation initiation factor IF-3  44.72 
 
 		 200 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3052  translation initiation factor IF-3  48.75 
 
 		 182 aa  165  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  47.83 
 
 		 173 aa  164  5e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0428  translation initiation factor IF-3  47.06 
 
 		 156 aa  164  5.9999999999999996e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0766  translation initiation factor IF-3  47.68 
 
 		 181 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2418  translation initiation factor IF-3  48.12 
 
 		 196 aa  164  6.9999999999999995e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0364  translation initiation factor 3  49.08 
 
 		 182 aa  164  6.9999999999999995e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000297976  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1244  translation initiation factor IF-3  48 
 
 		 175 aa  163  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000317297  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  43.98 
 
 		 219 aa  163  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  47.5 
 
 		 205 aa  163  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2150  translation initiation factor IF-3  48.45 
 
 		 173 aa  162  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2066  translation initiation factor 3  49.03 
 
 		 179 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.383221  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  45.68 
 
 		 187 aa  162  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2538  translation initiation factor IF-3  47.2 
 
 		 173 aa  162  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.838605  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1161  translation initiation factor 3  54.55 
 
 		 154 aa  162  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.930143 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0641  translation initiation factor IF-3  47.83 
 
 		 175 aa  162  3e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0065  translation initiation factor IF-3  46.58 
 
 		 184 aa  161  4.0000000000000004e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0041  translation initiation factor IF-3  44.1 
 
 		 192 aa  161  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  48.45 
 
 		 173 aa  161  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3622  translation initiation factor IF-3  45 
 
 		 357 aa  160  7e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0913675  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  46.88 
 
 		 198 aa  160  8.000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2139  translation initiation factor IF-3  49.03 
 
 		 177 aa  160  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0045601  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0489  translation initiation factor IF-3  45.51 
 
 		 176 aa  159  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000720798  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2042  translation initiation factor IF-3  48.75 
 
 		 199 aa  160  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0708817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1409  translation initiation factor IF-3  42.94 
 
 		 172 aa  159  1e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.37178e-16  unclonable  1.3418400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  47.5 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3071  translation initiation factor IF-3  47.74 
 
 		 182 aa  160  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427548  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1341  translation initiation factor IF-3  43.53 
 
 		 173 aa  159  2e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  44.58 
 
 		 238 aa  159  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4742  translation initiation factor IF-3  46.1 
 
 		 176 aa  159  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.676759  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25690  translation initiation factor 3  51.03 
 
 		 168 aa  159  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1316  translation initiation factor IF-3  48.12 
 
 		 351 aa  159  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0930  translation initiation factor 3  47.2 
 
 		 178 aa  159  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2459  translation initiation factor 3  46.88 
 
 		 243 aa  159  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0708  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 176 aa  159  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00002338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1103  translation initiation factor IF-3  47.5 
 
 		 233 aa  158  3e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0433779  normal  0.928932 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0265  translation initiation factor IF-3  48.45 
 
 		 173 aa  158  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.910814  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  45.51 
 
 		 192 aa  158  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1875  translation initiation factor IF-3  48.75 
 
 		 239 aa  158  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.384688 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1882  translation initiation factor IF-3  48.75 
 
 		 204 aa  158  4e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0284235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5483  translation initiation factor IF-3  47.5 
 
 		 250 aa  157  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6087  Translation initiation factor 3 (IF-3)-like protein  47.5 
 
 		 222 aa  157  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2996  translation initiation factor 3  48.12 
 
 		 238 aa  157  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171641  normal  0.0309942 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3025  translation initiation factor 3  48.12 
 
 		 238 aa  157  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.335133 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>