More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR2117 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR2117  translation initiation factor IF-3  100 
 
 		 134 aa  269  9e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.998323  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2032  translation initiation factor IF-3  100 
 
 		 134 aa  269  9e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0803  translation initiation factor IF-3  98.51 
 
 		 178 aa  264  2.9999999999999995e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0200  translation initiation factor IF-3  88.64 
 
 		 151 aa  242  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3483  translation initiation factor IF-3  87.88 
 
 		 132 aa  238  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.113137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4532  translation initiation factor IF-3  86.57 
 
 		 204 aa  238  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4267  translation initiation factor IF-3  86.57 
 
 		 178 aa  237  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  82.84 
 
 		 192 aa  231  3e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1341  translation initiation factor IF-3  79.1 
 
 		 173 aa  224  2e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  75.37 
 
 		 174 aa  220  4e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  81.06 
 
 		 173 aa  218  3e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4232  translation initiation factor IF-3  75.37 
 
 		 173 aa  216  7e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738998 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4742  translation initiation factor IF-3  73.13 
 
 		 176 aa  214  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.676759  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1906  translation initiation factor IF-3  74.63 
 
 		 173 aa  214  4e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1624  translation initiation factor IF-3  74.63 
 
 		 176 aa  214  4e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101313 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1612  translation initiation factor IF-3  73.13 
 
 		 173 aa  212  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252676 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0641  translation initiation factor IF-3  77.1 
 
 		 175 aa  211  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2109  translation initiation factor IF-3  75.76 
 
 		 219 aa  209  7e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000273336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0065  translation initiation factor IF-3  75.76 
 
 		 145 aa  208  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0168  translation initiation factor IF-3  75.76 
 
 		 132 aa  208  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0041  translation initiation factor IF-3  75.76 
 
 		 192 aa  208  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3158  translation initiation factor IF-3  70.9 
 
 		 173 aa  208  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0341  initiation factor 3  75 
 
 		 132 aa  206  8e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0218  translation initiation factor IF-3  74.24 
 
 		 200 aa  204  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0069  translation initiation factor IF-3  73.48 
 
 		 171 aa  202  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.097761 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  70.68 
 
 		 202 aa  201  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0077  translation initiation factor IF-3  71.97 
 
 		 171 aa  201  3e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1763  translation initiation factor 3  69.92 
 
 		 137 aa  199  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  69.85 
 
 		 194 aa  194  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  69.12 
 
 		 194 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  69.85 
 
 		 194 aa  194  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3488  translation initiation factor 3  74.63 
 
 		 173 aa  194  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2747  translation initiation factor IF-3  70.23 
 
 		 169 aa  194  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.128829 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2538  translation initiation factor IF-3  67.18 
 
 		 173 aa  192  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.838605  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0265  translation initiation factor IF-3  68.7 
 
 		 173 aa  189  8e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.910814  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1196  translation initiation factor IF-3  77.17 
 
 		 173 aa  188  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.501518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0123  translation initiation factor 3  79.53 
 
 		 201 aa  187  5e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.228507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  64.18 
 
 		 173 aa  185  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0412  translation initiation factor IF-3  67.18 
 
 		 144 aa  184  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.601649  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2150  translation initiation factor IF-3  67.94 
 
 		 173 aa  182  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2676  translation initiation factor 3  63.36 
 
 		 137 aa  181  4.0000000000000006e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.233816 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  59.7 
 
 		 173 aa  176  8e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  62.6 
 
 		 190 aa  175  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  58.21 
 
 		 178 aa  173  9e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  60.31 
 
 		 178 aa  172  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  60.31 
 
 		 178 aa  172  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2218  translation initiation factor IF-3  60.45 
 
 		 182 aa  172  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000264089  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0471  translation initiation factor IF-3  62.12 
 
 		 171 aa  170  7.999999999999999e-42  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.973019  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2103  translation initiation factor 3  59.54 
 
 		 177 aa  169  9e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  0.133955 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2804  translation initiation factor IF-3  58.21 
 
 		 180 aa  169  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1778  translation initiation factor IF-3  58.02 
 
 		 156 aa  168  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.843423 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1008  translation initiation factor 3  62.6 
 
 		 155 aa  168  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0442083  hitchhiker  0.00912814 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1161  translation initiation factor 3  58.21 
 
 		 154 aa  169  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.930143 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2098  translation initiation factor IF-3  58.21 
 
 		 147 aa  169  2e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01384  translation initiation factor IF-3  59.7 
 
 		 159 aa  168  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2019  translation initiation factor IF-3  58.21 
 
 		 147 aa  168  2e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1453  translation initiation factor IF-3  58.02 
 
 		 156 aa  167  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0525841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4616  translation initiation factor 3  58.02 
 
 		 156 aa  167  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00507113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0488  translation initiation factor IF-3  59.09 
 
 		 184 aa  167  4e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.270402  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0994  translation initiation factor IF-3  58.02 
 
 		 156 aa  167  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1400  translation initiation factor IF-3  58.02 
 
 		 156 aa  167  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0821028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1360  translation initiation factor IF-3  58.02 
 
 		 156 aa  167  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.485624  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1476  translation initiation factor IF-3  58.02 
 
 		 156 aa  167  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348442  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2853  translation initiation factor IF-3  57.25 
 
 		 174 aa  167  5e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0116753 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0201  translation initiation factor IF-3  58.02 
 
 		 156 aa  167  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00116998  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0964  translation initiation factor IF-3  58.02 
 
 		 156 aa  167  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.698743  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1095  translation initiation factor IF-3  58.02 
 
 		 156 aa  167  6e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.171775  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1891  translation initiation factor IF-3  58.02 
 
 		 156 aa  167  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1538  translation initiation factor IF-3  58.02 
 
 		 156 aa  167  6e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2594  translation initiation factor IF-3  58.02 
 
 		 156 aa  167  6e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1736  translation initiation factor IF-3  58.02 
 
 		 156 aa  167  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1713  translation initiation factor IF-3  58.02 
 
 		 156 aa  167  6e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225755  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1557  translation initiation factor IF-3  56.82 
 
 		 156 aa  166  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1871  translation initiation factor IF-3  57.58 
 
 		 181 aa  166  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1372  translation initiation factor 3  57.58 
 
 		 156 aa  166  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0696405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0767  translation initiation factor 3  59.06 
 
 		 146 aa  166  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  54.48 
 
 		 154 aa  165  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0830  translation initiation factor IF-3  58.65 
 
 		 169 aa  165  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.124767  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2755  translation initiation factor IF-3  56.82 
 
 		 156 aa  165  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2002  translation initiation factor 3  58.96 
 
 		 153 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2858  translation initiation factor 3  57.25 
 
 		 173 aa  164  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.357759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  60.31 
 
 		 198 aa  164  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3090  translation initiation factor IF-3  56.49 
 
 		 179 aa  164  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.639467  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  56.39 
 
 		 238 aa  164  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  56.72 
 
 		 165 aa  163  5.9999999999999996e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1768  translation initiation factor IF-3  62.3 
 
 		 221 aa  163  9e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.40976 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01687  translation initiation factor IF-3  63.64 
 
 		 144 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00539573  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1924  translation initiation factor IF-3  63.64 
 
 		 180 aa  163  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000676935  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1429  translation initiation factor IF-3  63.64 
 
 		 144 aa  162  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00177736  hitchhiker  0.00888747 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1936  translation initiation factor IF-3  63.64 
 
 		 144 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150093  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1473  translation initiation factor IF-3  63.64 
 
 		 144 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000416491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1914  translation initiation factor IF-3  63.64 
 
 		 180 aa  163  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.119522  normal  0.223345 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1799  translation initiation factor IF-3  63.64 
 
 		 144 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017178  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1839  translation initiation factor IF-3  63.64 
 
 		 144 aa  162  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000057261  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2011  translation initiation factor IF-3  63.64 
 
 		 144 aa  162  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.727215 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2436  translation initiation factor IF-3  63.64 
 
 		 144 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000110655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1960  translation initiation factor IF-3  63.64 
 
 		 144 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000234201  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1445  translation initiation factor IF-3  63.64 
 
 		 144 aa  162  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0313674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01676  hypothetical protein  63.64 
 
 		 180 aa  163  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0101258  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1462  translation initiation factor IF-3  63.64 
 
 		 144 aa  162  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.131964  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>