More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1244 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1244  translation initiation factor IF-3  100 
 
 		 175 aa  353  8.999999999999999e-97  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000317297  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1772  translation initiation factor IF-3  94.29 
 
 		 200 aa  310  5.999999999999999e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000139127  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1738  translation initiation factor IF-3  94.29 
 
 		 200 aa  310  5.999999999999999e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000196833  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  73.1 
 
 		 202 aa  261  4e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  72.25 
 
 		 190 aa  259  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3261  translation initiation factor IF-3  68.21 
 
 		 195 aa  256  2e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000125648  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  67.05 
 
 		 195 aa  254  5e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000432272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4471  translation initiation factor IF-3  67.05 
 
 		 195 aa  254  5e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4306  translation initiation factor IF-3  67.05 
 
 		 195 aa  254  5e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000145665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4317  translation initiation factor IF-3  67.05 
 
 		 195 aa  254  5e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000117232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  67.05 
 
 		 186 aa  254  6e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000690292  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  68.48 
 
 		 166 aa  250  6e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000012216  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  68.48 
 
 		 166 aa  250  6e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000101645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4690  translation initiation factor IF-3  67.88 
 
 		 166 aa  249  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.37112e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4699  translation initiation factor IF-3  67.88 
 
 		 166 aa  249  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000260309  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4406  translation initiation factor IF-3  67.88 
 
 		 166 aa  249  2e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000111711  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1409  translation initiation factor IF-3  70.3 
 
 		 172 aa  240  9e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.37178e-16  unclonable  1.3418400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1241  translation initiation factor 3  64.85 
 
 		 170 aa  232  2.0000000000000002e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000256408  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1089  translation initiation factor IF-3  60.57 
 
 		 176 aa  206  2e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000188384  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1225  translation initiation factor 3  61.49 
 
 		 164 aa  205  3e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000314962  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  57.41 
 
 		 179 aa  205  3e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1384  translation initiation factor IF-3  60 
 
 		 176 aa  204  6e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000113221  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  54.12 
 
 		 238 aa  197  7.999999999999999e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  55.28 
 
 		 164 aa  196  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  52.94 
 
 		 225 aa  193  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  51.81 
 
 		 219 aa  192  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  52.35 
 
 		 198 aa  192  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  54.17 
 
 		 172 aa  192  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  53.37 
 
 		 202 aa  192  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  52.07 
 
 		 187 aa  189  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1311  translation initiation factor IF-3  54.66 
 
 		 164 aa  189  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000644552  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1204  translation initiation factor IF-3  59.01 
 
 		 171 aa  185  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000244125  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2172  translation initiation factor IF-3  58.9 
 
 		 154 aa  185  3e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000864988  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  53.05 
 
 		 171 aa  185  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000964088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  53.29 
 
 		 154 aa  183  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  52.73 
 
 		 178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  52.73 
 
 		 178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2033  translation initiation factor IF-3  59.26 
 
 		 216 aa  182  3e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000152468  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3163  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 252 aa  181  5.0000000000000004e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2996  translation initiation factor IF-3  51.22 
 
 		 173 aa  180  9.000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  49.7 
 
 		 173 aa  179  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0428  translation initiation factor IF-3  54.61 
 
 		 156 aa  179  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  50.62 
 
 		 178 aa  178  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1249  translation initiation factor IF-3  50.93 
 
 		 174 aa  178  4e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.246001 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  50.3 
 
 		 190 aa  178  4e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2666  translation initiation factor IF-3  52.38 
 
 		 176 aa  178  4e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0660  translation initiation factor IF-3  48 
 
 		 176 aa  177  4.999999999999999e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000367528  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1301  translation initiation factor 3  52.63 
 
 		 175 aa  177  5.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.444006  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  48.78 
 
 		 194 aa  177  7e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2150  translation initiation factor IF-3  49.4 
 
 		 173 aa  177  7e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0641  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 175 aa  177  8e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1823  translation initiation factor 3 (bIF-3)  62.67 
 
 		 153 aa  177  8e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000272282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2853  translation initiation factor IF-3  52.9 
 
 		 174 aa  176  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0116753 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  49.39 
 
 		 194 aa  175  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  48.24 
 
 		 207 aa  175  2e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  49.39 
 
 		 194 aa  175  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  53.95 
 
 		 165 aa  175  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2103  translation initiation factor 3  51.61 
 
 		 177 aa  175  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  0.133955 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2229  translation initiation factor IF-3  52.98 
 
 		 173 aa  175  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00231449 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1858  translation initiation factor IF-3  54.39 
 
 		 173 aa  175  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000644129  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3622  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 357 aa  175  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0913675  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3090  translation initiation factor IF-3  51.61 
 
 		 179 aa  174  4e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.639467  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  46.99 
 
 		 174 aa  175  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2146  translation initiation factor IF-3  54.39 
 
 		 173 aa  174  6e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000692224  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0447  translation initiation factor IF-3  54.37 
 
 		 164 aa  174  6e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000472838  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2054  translation initiation factor IF-3  52.67 
 
 		 152 aa  174  7e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000423398  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 173 aa  174  7e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  47.67 
 
 		 197 aa  174  7e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0983  translation initiation factor IF-3  48.26 
 
 		 176 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.104 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1613  translation initiation factor IF-3  58.45 
 
 		 145 aa  172  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000306668  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2619  translation initiation factor IF-3  57.14 
 
 		 176 aa  173  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  49.07 
 
 		 173 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1161  translation initiation factor 3  53.33 
 
 		 154 aa  173  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.930143 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2858  translation initiation factor 3  51.61 
 
 		 173 aa  173  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.357759  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2466  translation initiation factor IF-3  49.69 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00240261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3480  translation initiation factor IF-3  49.69 
 
 		 183 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0422454  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1968  translation initiation factor IF-3  48.5 
 
 		 183 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00361564  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3224  translation initiation factor IF-3  49.69 
 
 		 183 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51494 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2638  translation initiation factor IF-3  52.1 
 
 		 169 aa  171  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.294805  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  47.09 
 
 		 198 aa  171  5e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000135112  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1906  translation initiation factor IF-3  47.67 
 
 		 173 aa  171  5e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1624  translation initiation factor IF-3  47.67 
 
 		 176 aa  171  5e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101313 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1008  translation initiation factor 3  51.97 
 
 		 155 aa  171  5.999999999999999e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0442083  hitchhiker  0.00912814 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0766  translation initiation factor IF-3  52 
 
 		 181 aa  170  7.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0830  translation initiation factor IF-3  52.15 
 
 		 169 aa  169  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.124767  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1612  translation initiation factor IF-3  47.09 
 
 		 173 aa  170  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252676 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4742  translation initiation factor IF-3  45.35 
 
 		 176 aa  169  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.676759  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3488  translation initiation factor 3  50.3 
 
 		 173 aa  169  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20430  translation initiation factor IF-3  50.3 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2109  translation initiation factor IF-3  46.99 
 
 		 219 aa  169  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000273336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1800  translation initiation factor 3  52.8 
 
 		 163 aa  169  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00939294  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1443  translation initiation factor 3  55.63 
 
 		 143 aa  169  2e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000186833  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3052  translation initiation factor IF-3  48.45 
 
 		 182 aa  169  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1678  translation initiation factor IF-3  48.45 
 
 		 170 aa  168  3e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0127847  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0065  translation initiation factor IF-3  48.15 
 
 		 184 aa  169  3e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3158  translation initiation factor IF-3  46.51 
 
 		 173 aa  168  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0364  translation initiation factor 3  48.8 
 
 		 182 aa  168  4e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000297976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2804  translation initiation factor IF-3  47.37 
 
 		 180 aa  167  7e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2538  translation initiation factor IF-3  44.44 
 
 		 173 aa  167  8e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.838605  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2163  translation initiation factor IF-3  50.9 
 
 		 177 aa  167  9e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000118732  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>