More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2146 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2146  translation initiation factor IF-3  100 
 
 		 173 aa  346  8e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000692224  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1858  translation initiation factor IF-3  98.27 
 
 		 173 aa  342  2e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000644129  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  58.33 
 
 		 202 aa  212  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  57.74 
 
 		 190 aa  208  3e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  58.64 
 
 		 179 aa  208  4e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  55.83 
 
 		 164 aa  204  6e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  55.36 
 
 		 195 aa  203  8e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000432272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4471  translation initiation factor IF-3  55.36 
 
 		 195 aa  203  8e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4306  translation initiation factor IF-3  55.36 
 
 		 195 aa  203  8e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000145665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4317  translation initiation factor IF-3  55.36 
 
 		 195 aa  203  8e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000117232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  55.36 
 
 		 186 aa  203  8e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000690292  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3261  translation initiation factor IF-3  55.95 
 
 		 195 aa  202  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000125648  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1311  translation initiation factor IF-3  57.06 
 
 		 164 aa  202  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000644552  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  57.23 
 
 		 198 aa  202  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  54.44 
 
 		 187 aa  199  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  56.17 
 
 		 166 aa  198  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000012216  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  56.17 
 
 		 166 aa  198  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000101645  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4699  translation initiation factor IF-3  55.56 
 
 		 166 aa  197  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000260309  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4690  translation initiation factor IF-3  55.56 
 
 		 166 aa  197  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.37112e-62 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1225  translation initiation factor 3  56.44 
 
 		 164 aa  197  6e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000314962  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4406  translation initiation factor IF-3  55.56 
 
 		 166 aa  197  7e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000111711  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  54.04 
 
 		 202 aa  188  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  52.07 
 
 		 238 aa  187  9e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2666  translation initiation factor IF-3  53.53 
 
 		 176 aa  186  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0447  translation initiation factor IF-3  59.51 
 
 		 164 aa  186  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000472838  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  55.49 
 
 		 178 aa  185  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  55.49 
 
 		 178 aa  185  3e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  51.19 
 
 		 171 aa  184  5e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000964088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  51.48 
 
 		 225 aa  183  8e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  50.98 
 
 		 154 aa  183  9e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  52.1 
 
 		 178 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2054  translation initiation factor IF-3  55.92 
 
 		 152 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000423398  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  53.66 
 
 		 194 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  53.09 
 
 		 174 aa  180  8.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  53.66 
 
 		 194 aa  179  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  53.66 
 
 		 194 aa  179  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2172  translation initiation factor IF-3  53.64 
 
 		 154 aa  179  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000864988  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  49.1 
 
 		 219 aa  178  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  54.88 
 
 		 190 aa  178  2.9999999999999997e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3163  translation initiation factor IF-3  50.92 
 
 		 252 aa  178  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2150  translation initiation factor IF-3  52.47 
 
 		 173 aa  177  5.999999999999999e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  53.37 
 
 		 173 aa  177  7e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1204  translation initiation factor IF-3  53.57 
 
 		 171 aa  177  7e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000244125  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2156  translation initiation factor IF-3  52.07 
 
 		 175 aa  177  9e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000187486  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1409  translation initiation factor IF-3  50.93 
 
 		 172 aa  176  1e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.37178e-16  unclonable  1.3418400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  50.3 
 
 		 173 aa  176  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  51.63 
 
 		 165 aa  176  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2109  translation initiation factor IF-3  50.62 
 
 		 219 aa  175  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000273336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4232  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 173 aa  175  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738998 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1800  translation initiation factor 3  54.6 
 
 		 163 aa  174  5e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00939294  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  52.47 
 
 		 173 aa  174  5e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  50.62 
 
 		 172 aa  174  6e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1241  translation initiation factor 3  48.45 
 
 		 170 aa  174  7e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000256408  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1244  translation initiation factor IF-3  54.39 
 
 		 175 aa  173  9.999999999999999e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000317297  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1613  translation initiation factor IF-3  56.43 
 
 		 145 aa  172  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000306668  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2619  translation initiation factor IF-3  57.67 
 
 		 176 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  48.54 
 
 		 227 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4267  translation initiation factor IF-3  52.8 
 
 		 178 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0218  translation initiation factor IF-3  50.93 
 
 		 200 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4742  translation initiation factor IF-3  48.77 
 
 		 176 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.676759  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3158  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 173 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1772  translation initiation factor IF-3  55.28 
 
 		 200 aa  171  5.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000139127  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1738  translation initiation factor IF-3  55.28 
 
 		 200 aa  171  5.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000196833  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1924  translation initiation factor IF-3  57.93 
 
 		 180 aa  170  9e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000676935  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1914  translation initiation factor IF-3  57.93 
 
 		 180 aa  170  9e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.119522  normal  0.223345 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1624  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 176 aa  170  9e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101313 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01676  hypothetical protein  57.93 
 
 		 180 aa  170  9e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0101258  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2218  translation initiation factor IF-3  49.39 
 
 		 182 aa  170  9e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000264089  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2466  translation initiation factor IF-3  50.92 
 
 		 177 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00240261  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2908  translation initiation factor IF-3  51.25 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3224  translation initiation factor IF-3  50.92 
 
 		 183 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51494 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1612  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 173 aa  169  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1906  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 173 aa  170  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1968  translation initiation factor IF-3  50.92 
 
 		 183 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00361564  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3480  translation initiation factor IF-3  50.92 
 
 		 183 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0422454  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1161  translation initiation factor 3  51.32 
 
 		 154 aa  169  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.930143 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0471  translation initiation factor IF-3  52.44 
 
 		 171 aa  169  1e-41  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.973019  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  50.93 
 
 		 192 aa  169  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2418  translation initiation factor IF-3  47.65 
 
 		 196 aa  169  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0441  translation initiation factor IF-3  46.63 
 
 		 179 aa  169  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.077533  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0069  translation initiation factor IF-3  49.07 
 
 		 171 aa  169  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.097761 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4532  translation initiation factor IF-3  52.17 
 
 		 204 aa  169  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3488  translation initiation factor 3  57.14 
 
 		 173 aa  169  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  47.65 
 
 		 205 aa  169  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  49.38 
 
 		 173 aa  169  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2981  translation initiation factor 3  48.82 
 
 		 238 aa  169  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2996  translation initiation factor 3  48.82 
 
 		 238 aa  169  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171641  normal  0.0309942 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3025  translation initiation factor 3  48.82 
 
 		 238 aa  169  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0190  translation initiation factor IF-3  51.79 
 
 		 186 aa  168  3e-41  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.140917  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2181  translation initiation factor IF-3  57.93 
 
 		 180 aa  168  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0268784  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3328  translation initiation factor IF-3  47.67 
 
 		 243 aa  168  4e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.825238  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2459  translation initiation factor 3  47.93 
 
 		 243 aa  168  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1889  translation initiation factor IF-3  57.93 
 
 		 180 aa  167  5e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1952  translation initiation factor IF-3  57.32 
 
 		 180 aa  167  5e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.26259  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1089  translation initiation factor IF-3  51.52 
 
 		 176 aa  167  9e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000188384  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1384  translation initiation factor IF-3  51.52 
 
 		 176 aa  166  1e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000113221  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0412  translation initiation factor IF-3  55.24 
 
 		 144 aa  166  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.601649  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0077  translation initiation factor IF-3  47.83 
 
 		 171 aa  166  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0641  translation initiation factor IF-3  48.15 
 
 		 175 aa  166  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2052  translation initiation factor IF-3  57.32 
 
 		 180 aa  166  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0593383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>