More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1443 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1443  translation initiation factor 3  100 
 
 		 143 aa  286  6e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000186833  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1280  translation initiation factor 3  65 
 
 		 214 aa  189  8e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.453323  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  56.34 
 
 		 166 aa  171  5e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000012216  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  56.34 
 
 		 166 aa  171  5e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000101645  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4699  translation initiation factor IF-3  55.63 
 
 		 166 aa  170  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000260309  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4690  translation initiation factor IF-3  55.63 
 
 		 166 aa  170  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.37112e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  55.63 
 
 		 195 aa  169  9e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000432272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4471  translation initiation factor IF-3  55.63 
 
 		 195 aa  169  9e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4306  translation initiation factor IF-3  55.63 
 
 		 195 aa  169  9e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000145665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4317  translation initiation factor IF-3  55.63 
 
 		 195 aa  169  9e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000117232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  55.63 
 
 		 186 aa  169  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000690292  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4406  translation initiation factor IF-3  54.93 
 
 		 166 aa  168  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000111711  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3261  translation initiation factor IF-3  54.23 
 
 		 195 aa  167  4e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000125648  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1241  translation initiation factor 3  57.25 
 
 		 170 aa  167  6e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000256408  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1409  translation initiation factor IF-3  53.96 
 
 		 172 aa  163  9e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.37178e-16  unclonable  1.3418400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1384  translation initiation factor IF-3  65.93 
 
 		 176 aa  162  1.0000000000000001e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000113221  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1089  translation initiation factor IF-3  65.93 
 
 		 176 aa  162  1.0000000000000001e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000188384  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  54.93 
 
 		 190 aa  160  7e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  55.71 
 
 		 202 aa  159  9e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  53.96 
 
 		 238 aa  152  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2033  translation initiation factor IF-3  61.31 
 
 		 216 aa  152  1e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000152468  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1738  translation initiation factor IF-3  57.25 
 
 		 200 aa  151  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000196833  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1772  translation initiation factor IF-3  57.25 
 
 		 200 aa  151  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000139127  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2172  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 154 aa  150  5e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000864988  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1244  translation initiation factor IF-3  55.63 
 
 		 175 aa  149  8.999999999999999e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000317297  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2109  translation initiation factor IF-3  51.47 
 
 		 219 aa  147  4e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000273336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1311  translation initiation factor IF-3  47.86 
 
 		 164 aa  147  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000644552  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  47.55 
 
 		 219 aa  147  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0803  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 178 aa  147  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1763  translation initiation factor 3  49.26 
 
 		 137 aa  147  7e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  47.86 
 
 		 173 aa  146  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2150  translation initiation factor IF-3  49.29 
 
 		 173 aa  145  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0077  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 171 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1613  translation initiation factor IF-3  46.85 
 
 		 145 aa  145  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000306668  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  51.8 
 
 		 225 aa  145  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  46.43 
 
 		 164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  47.48 
 
 		 202 aa  145  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2117  translation initiation factor IF-3  51.52 
 
 		 134 aa  143  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.998323  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0069  translation initiation factor IF-3  48.57 
 
 		 171 aa  143  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.097761 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4742  translation initiation factor IF-3  47.14 
 
 		 176 aa  143  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.676759  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0041  translation initiation factor IF-3  48.89 
 
 		 192 aa  142  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  46.38 
 
 		 207 aa  142  1e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1341  translation initiation factor IF-3  46.1 
 
 		 173 aa  142  1e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2032  translation initiation factor IF-3  51.52 
 
 		 134 aa  143  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1225  translation initiation factor 3  46.43 
 
 		 164 aa  143  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000314962  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0065  translation initiation factor IF-3  48.89 
 
 		 145 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0341  initiation factor 3  49.24 
 
 		 132 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0168  translation initiation factor IF-3  49.24 
 
 		 132 aa  141  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4232  translation initiation factor IF-3  47.14 
 
 		 173 aa  142  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738998 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  45.45 
 
 		 178 aa  141  3e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  45.45 
 
 		 178 aa  141  4e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  45.71 
 
 		 174 aa  141  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0412  translation initiation factor IF-3  46.43 
 
 		 144 aa  141  4e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.601649  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0428  translation initiation factor IF-3  45.45 
 
 		 156 aa  140  5e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1161  translation initiation factor 3  48.92 
 
 		 154 aa  140  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.930143 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0218  translation initiation factor IF-3  48.15 
 
 		 200 aa  140  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1906  translation initiation factor IF-3  48.53 
 
 		 173 aa  139  9e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  46.43 
 
 		 179 aa  140  9e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3158  translation initiation factor IF-3  47.79 
 
 		 173 aa  139  9e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1624  translation initiation factor IF-3  48.53 
 
 		 176 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101313 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0660  translation initiation factor IF-3  45.39 
 
 		 176 aa  138  1.9999999999999998e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000367528  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2538  translation initiation factor IF-3  47.14 
 
 		 173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.838605  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  47.14 
 
 		 192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  45.26 
 
 		 194 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0190  translation initiation factor IF-3  46.81 
 
 		 186 aa  138  1.9999999999999998e-32  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.140917  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0641  translation initiation factor IF-3  49.26 
 
 		 175 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  45.26 
 
 		 194 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  45.26 
 
 		 194 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3488  translation initiation factor 3  50.71 
 
 		 173 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0200  translation initiation factor IF-3  47.14 
 
 		 151 aa  137  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1612  translation initiation factor IF-3  47.06 
 
 		 173 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252676 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2054  translation initiation factor IF-3  43.57 
 
 		 152 aa  136  7e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000423398  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0471  translation initiation factor IF-3  47.79 
 
 		 171 aa  136  7.999999999999999e-32  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.973019  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2218  translation initiation factor IF-3  45.07 
 
 		 182 aa  136  8.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000264089  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2747  translation initiation factor IF-3  47.86 
 
 		 169 aa  136  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.128829 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  45.32 
 
 		 178 aa  135  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4267  translation initiation factor IF-3  46.43 
 
 		 178 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2804  translation initiation factor IF-3  46.04 
 
 		 180 aa  135  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  46.38 
 
 		 190 aa  134  3.0000000000000003e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  45.26 
 
 		 198 aa  134  4e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000135112  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4532  translation initiation factor IF-3  46.43 
 
 		 204 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3483  translation initiation factor IF-3  46.97 
 
 		 132 aa  134  6.0000000000000005e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.113137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2307  translation initiation factor IF-3  46.43 
 
 		 154 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00282878  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3071  translation initiation factor IF-3  44.6 
 
 		 182 aa  133  7.000000000000001e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427548  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1372  translation initiation factor 3  46.04 
 
 		 156 aa  133  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0696405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  44.29 
 
 		 187 aa  133  9e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  48.57 
 
 		 172 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1008  translation initiation factor 3  48.09 
 
 		 155 aa  133  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0442083  hitchhiker  0.00912814 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2755  translation initiation factor IF-3  46.04 
 
 		 156 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22658  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2418  translation initiation factor IF-3  47.41 
 
 		 196 aa  132  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0767  translation initiation factor 3  49.61 
 
 		 146 aa  132  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2466  translation initiation factor IF-3  41.96 
 
 		 177 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00240261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3480  translation initiation factor IF-3  41.96 
 
 		 183 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0422454  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1778  translation initiation factor IF-3  43.17 
 
 		 156 aa  131  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.843423 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3224  translation initiation factor IF-3  41.96 
 
 		 183 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51494 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1968  translation initiation factor IF-3  41.96 
 
 		 183 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00361564  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1400  translation initiation factor IF-3  43.17 
 
 		 156 aa  131  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0821028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  45.59 
 
 		 198 aa  131  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2002  translation initiation factor 3  49.23 
 
 		 153 aa  131  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2103  translation initiation factor 3  43.17 
 
 		 177 aa  131  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  0.133955 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>