More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2033 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2033  translation initiation factor IF-3  100 
 
 		 216 aa  439  9.999999999999999e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000152468  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  55.05 
 
 		 195 aa  217  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000432272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4471  translation initiation factor IF-3  55.05 
 
 		 195 aa  217  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4306  translation initiation factor IF-3  55.05 
 
 		 195 aa  217  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000145665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4317  translation initiation factor IF-3  55.05 
 
 		 195 aa  217  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000117232  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  64.2 
 
 		 166 aa  216  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000101645  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  63.58 
 
 		 186 aa  217  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000690292  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  64.2 
 
 		 166 aa  216  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000012216  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3261  translation initiation factor IF-3  55.72 
 
 		 195 aa  216  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000125648  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4699  translation initiation factor IF-3  63.58 
 
 		 166 aa  216  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000260309  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4690  translation initiation factor IF-3  63.58 
 
 		 166 aa  216  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.37112e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4406  translation initiation factor IF-3  62.35 
 
 		 166 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000111711  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1384  translation initiation factor IF-3  68.02 
 
 		 176 aa  211  7e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000113221  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  62.96 
 
 		 190 aa  207  8e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  56.7 
 
 		 202 aa  207  9e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1089  translation initiation factor IF-3  65.7 
 
 		 176 aa  205  5e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000188384  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1241  translation initiation factor 3  56.79 
 
 		 170 aa  195  3e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000256408  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1409  translation initiation factor IF-3  57.06 
 
 		 172 aa  190  1e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.37178e-16  unclonable  1.3418400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1738  translation initiation factor IF-3  54.26 
 
 		 200 aa  182  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000196833  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1772  translation initiation factor IF-3  54.26 
 
 		 200 aa  182  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000139127  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1244  translation initiation factor IF-3  59.26 
 
 		 175 aa  180  1e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000317297  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  47.09 
 
 		 202 aa  177  8e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1225  translation initiation factor 3  53.09 
 
 		 164 aa  171  6.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000314962  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1311  translation initiation factor IF-3  51.23 
 
 		 164 aa  170  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000644552  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1443  translation initiation factor 3  61.31 
 
 		 143 aa  170  2e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000186833  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  44.92 
 
 		 194 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  44.92 
 
 		 194 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1800  translation initiation factor 3  51.53 
 
 		 163 aa  165  4e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00939294  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2150  translation initiation factor IF-3  50.92 
 
 		 173 aa  165  5e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  46.07 
 
 		 194 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  48.45 
 
 		 164 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  49.39 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0428  translation initiation factor IF-3  50.65 
 
 		 156 aa  161  6e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  48.47 
 
 		 173 aa  160  1e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  48.45 
 
 		 187 aa  160  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2666  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 176 aa  160  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1678  translation initiation factor IF-3  50.31 
 
 		 170 aa  159  3e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0127847  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1008  translation initiation factor 3  51.61 
 
 		 155 aa  159  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0442083  hitchhiker  0.00912814 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0641  translation initiation factor IF-3  48.47 
 
 		 175 aa  159  3e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2804  translation initiation factor IF-3  47.43 
 
 		 180 aa  159  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  46.51 
 
 		 178 aa  159  4e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  45.93 
 
 		 178 aa  158  6e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  49.69 
 
 		 198 aa  158  6e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2172  translation initiation factor IF-3  48.32 
 
 		 154 aa  158  6e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000864988  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  44.44 
 
 		 190 aa  157  8e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  49.07 
 
 		 172 aa  157  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  47.56 
 
 		 238 aa  157  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0447  translation initiation factor IF-3  54.04 
 
 		 164 aa  156  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000472838  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1924  translation initiation factor IF-3  51.16 
 
 		 180 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000676935  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1914  translation initiation factor IF-3  51.16 
 
 		 180 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.119522  normal  0.223345 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1768  translation initiation factor IF-3  44.13 
 
 		 221 aa  155  5.0000000000000005e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.40976 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01676  hypothetical protein  51.16 
 
 		 180 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0101258  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2109  translation initiation factor IF-3  46.01 
 
 		 219 aa  155  6e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000273336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2996  translation initiation factor IF-3  45.4 
 
 		 173 aa  154  9e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  43.98 
 
 		 207 aa  154  1e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1612  translation initiation factor IF-3  46.95 
 
 		 173 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252676 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3158  translation initiation factor IF-3  46.95 
 
 		 173 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  45.78 
 
 		 197 aa  152  5e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  46.01 
 
 		 173 aa  151  5.9999999999999996e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1968  translation initiation factor IF-3  43.89 
 
 		 183 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00361564  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0983  translation initiation factor IF-3  45.4 
 
 		 176 aa  151  7e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.104 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2596  translation initiation factor IF-3  47.31 
 
 		 177 aa  151  8e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000880416  hitchhiker  0.000575086 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2466  translation initiation factor IF-3  45.51 
 
 		 177 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00240261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0218  translation initiation factor IF-3  44.62 
 
 		 200 aa  151  8.999999999999999e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3480  translation initiation factor IF-3  45.51 
 
 		 183 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0422454  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3224  translation initiation factor IF-3  45.51 
 
 		 183 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51494 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  43.82 
 
 		 178 aa  150  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  47.56 
 
 		 173 aa  150  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  43.98 
 
 		 198 aa  150  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000135112  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1906  translation initiation factor IF-3  45.73 
 
 		 173 aa  150  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1624  translation initiation factor IF-3  45.73 
 
 		 176 aa  150  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101313 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2619  translation initiation factor IF-3  54.27 
 
 		 176 aa  149  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3488  translation initiation factor 3  50.92 
 
 		 173 aa  149  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0522  translation initiation factor IF-3  45.09 
 
 		 193 aa  149  3e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000692532  hitchhiker  0.000000579185 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01384  translation initiation factor IF-3  49.03 
 
 		 159 aa  149  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1736  translation initiation factor IF-3  45.81 
 
 		 156 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1095  translation initiation factor IF-3  45.81 
 
 		 156 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.171775  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1713  translation initiation factor IF-3  45.81 
 
 		 156 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225755  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1891  translation initiation factor IF-3  45.81 
 
 		 156 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2594  translation initiation factor IF-3  45.81 
 
 		 156 aa  149  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3622  translation initiation factor IF-3  43.1 
 
 		 357 aa  149  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0913675  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  46.01 
 
 		 174 aa  149  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1538  translation initiation factor IF-3  45.81 
 
 		 156 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4267  translation initiation factor IF-3  46.01 
 
 		 178 aa  148  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3163  translation initiation factor IF-3  44.72 
 
 		 252 aa  148  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0964  translation initiation factor IF-3  45.81 
 
 		 156 aa  148  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.698743  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  44.72 
 
 		 179 aa  148  5e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0201  translation initiation factor IF-3  45.81 
 
 		 156 aa  148  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00116998  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  44.1 
 
 		 219 aa  148  6e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2229  translation initiation factor IF-3  49.69 
 
 		 173 aa  148  6e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00231449 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2146  translation initiation factor IF-3  52.8 
 
 		 173 aa  148  6e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000692224  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1858  translation initiation factor IF-3  52.8 
 
 		 173 aa  148  6e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000644129  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0221  translation initiation factor IF-3  47.2 
 
 		 186 aa  148  7e-35  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00015702  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1778  translation initiation factor IF-3  45.81 
 
 		 156 aa  148  7e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.843423 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1400  translation initiation factor IF-3  45.81 
 
 		 156 aa  148  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0821028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1453  translation initiation factor IF-3  45.81 
 
 		 156 aa  147  8e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0525841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2181  translation initiation factor IF-3  50.58 
 
 		 180 aa  147  8e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0268784  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1204  translation initiation factor IF-3  47.9 
 
 		 171 aa  148  8e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000244125  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1360  translation initiation factor IF-3  45.81 
 
 		 156 aa  148  8e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.485624  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1476  translation initiation factor IF-3  45.81 
 
 		 156 aa  147  8e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>