More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0802 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0802  translation initiation factor IF-3  100 
 
 		 176 aa  358  3e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0830  translation initiation factor IF-3  100 
 
 		 176 aa  358  3e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1924  translation initiation factor IF-3  82.18 
 
 		 177 aa  290  7e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2038  translation initiation factor IF-3  77.84 
 
 		 177 aa  286  1e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.369536 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4675  translation initiation factor IF-3  76.7 
 
 		 177 aa  282  2.0000000000000002e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.361003  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0441  translation initiation factor IF-3  75 
 
 		 179 aa  281  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.077533  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0065  translation initiation factor IF-3  76.79 
 
 		 184 aa  278  3e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0930  translation initiation factor 3  68.02 
 
 		 178 aa  257  5.0000000000000005e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17631  translation initiation factor IF-3  72 
 
 		 202 aa  253  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0085  translation initiation factor IF-3  72.57 
 
 		 217 aa  250  6e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0131  translation initiation factor IF-3  72.57 
 
 		 217 aa  250  7e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.122365  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01551  translation initiation factor IF-3  72.57 
 
 		 219 aa  250  9.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1215  translation initiation factor IF-3  70.86 
 
 		 202 aa  247  6e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20901  translation initiation factor IF-3  70.29 
 
 		 202 aa  245  2e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.240556  normal  0.63143 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1729  translation initiation factor IF-3  70.29 
 
 		 190 aa  244  4e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18271  translation initiation factor IF-3  70.29 
 
 		 190 aa  244  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.125602  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18251  translation initiation factor IF-3  70.29 
 
 		 195 aa  243  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.412706  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18461  translation initiation factor IF-3  69.71 
 
 		 190 aa  243  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  54.44 
 
 		 202 aa  196  1.0000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3622  translation initiation factor IF-3  49.71 
 
 		 357 aa  189  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0913675  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  54.88 
 
 		 187 aa  188  2.9999999999999997e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  52.76 
 
 		 164 aa  188  4e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  51.53 
 
 		 179 aa  183  9e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2042  translation initiation factor IF-3  50.91 
 
 		 199 aa  182  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0708817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  50.91 
 
 		 227 aa  181  6e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5483  translation initiation factor IF-3  51.52 
 
 		 250 aa  179  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  54.25 
 
 		 154 aa  179  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  50.62 
 
 		 202 aa  179  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  51.48 
 
 		 178 aa  178  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  48.26 
 
 		 194 aa  178  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  51.48 
 
 		 178 aa  178  4e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6087  Translation initiation factor 3 (IF-3)-like protein  49.69 
 
 		 222 aa  177  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3039  translation initiation factor IF-3  49.7 
 
 		 212 aa  177  4.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271102  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14590  translation initiation factor 3  50.31 
 
 		 401 aa  177  8e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  48.26 
 
 		 194 aa  176  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0713  translation initiation factor 3  51.43 
 
 		 249 aa  176  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  52.5 
 
 		 173 aa  176  1e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  48.26 
 
 		 194 aa  176  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  51.23 
 
 		 190 aa  176  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1225  translation initiation factor 3  50.92 
 
 		 164 aa  176  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000314962  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5473  translation initiation factor IF-3  49.09 
 
 		 204 aa  175  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2459  translation initiation factor 3  49.39 
 
 		 243 aa  175  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  48.54 
 
 		 219 aa  175  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  54.32 
 
 		 171 aa  175  4e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000964088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  53.59 
 
 		 165 aa  174  5e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22440  translation initiation factor 3  49.09 
 
 		 329 aa  174  7e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1103  translation initiation factor IF-3  47.88 
 
 		 233 aa  173  9.999999999999999e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0433779  normal  0.928932 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1624  translation initiation factor IF-3  48.48 
 
 		 415 aa  173  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.640548 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  48.81 
 
 		 225 aa  172  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  47.62 
 
 		 238 aa  172  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  45.56 
 
 		 174 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  49.39 
 
 		 178 aa  171  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3169  translation initiation factor IF-3  46.63 
 
 		 277 aa  171  3.9999999999999995e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2172  translation initiation factor IF-3  54.3 
 
 		 154 aa  171  5.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000864988  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  46.95 
 
 		 205 aa  170  6.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2054  translation initiation factor IF-3  50.66 
 
 		 152 aa  170  9e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000423398  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2150  translation initiation factor IF-3  47.34 
 
 		 173 aa  169  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  48.78 
 
 		 173 aa  170  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1480  translation initiation factor IF-3  49.09 
 
 		 356 aa  169  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000187235 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  50.9 
 
 		 190 aa  170  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1477  translation initiation factor 3  49.09 
 
 		 396 aa  169  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0613769  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  49.38 
 
 		 172 aa  169  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 192 aa  169  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  49.39 
 
 		 198 aa  169  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0475  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 253 aa  169  3e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1613  translation initiation factor IF-3  57.14 
 
 		 145 aa  167  5e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000306668  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3488  translation initiation factor 3  49.7 
 
 		 173 aa  168  5e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  48.48 
 
 		 225 aa  167  5e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  47.93 
 
 		 173 aa  167  8e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1768  translation initiation factor IF-3  49.11 
 
 		 221 aa  167  9e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.40976 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2466  translation initiation factor IF-3  48.28 
 
 		 177 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00240261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0803  translation initiation factor IF-3  46.33 
 
 		 178 aa  166  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3224  translation initiation factor IF-3  48.28 
 
 		 183 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51494 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3480  translation initiation factor IF-3  48.28 
 
 		 183 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0422454  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1968  translation initiation factor IF-3  48.28 
 
 		 183 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00361564  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  45.73 
 
 		 173 aa  165  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2066  translation initiation factor 3  49.04 
 
 		 179 aa  166  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.383221  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1249  translation initiation factor IF-3  48.19 
 
 		 174 aa  166  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.246001 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3071  translation initiation factor IF-3  48.41 
 
 		 182 aa  166  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427548  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  45.45 
 
 		 186 aa  165  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000690292  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2804  translation initiation factor IF-3  48.77 
 
 		 180 aa  165  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  45.45 
 
 		 195 aa  164  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000432272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4471  translation initiation factor IF-3  45.45 
 
 		 195 aa  164  5e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4306  translation initiation factor IF-3  45.45 
 
 		 195 aa  164  5e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000145665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4317  translation initiation factor IF-3  45.45 
 
 		 195 aa  164  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000117232  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0641  translation initiation factor IF-3  46.15 
 
 		 175 aa  164  5e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3163  translation initiation factor IF-3  45.78 
 
 		 252 aa  164  5.9999999999999996e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1823  translation initiation factor 3 (bIF-3)  55.26 
 
 		 153 aa  164  5.9999999999999996e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000272282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1800  translation initiation factor 3  50.31 
 
 		 163 aa  164  5.9999999999999996e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00939294  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4532  translation initiation factor IF-3  46.75 
 
 		 204 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4267  translation initiation factor IF-3  46.75 
 
 		 178 aa  164  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4690  translation initiation factor IF-3  46.91 
 
 		 166 aa  164  8e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.37112e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4699  translation initiation factor IF-3  46.91 
 
 		 166 aa  164  8e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000260309  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3261  translation initiation factor IF-3  46.91 
 
 		 195 aa  163  9e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000125648  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  46.63 
 
 		 197 aa  163  1.0000000000000001e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4406  translation initiation factor IF-3  46.91 
 
 		 166 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000111711  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  46.3 
 
 		 166 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000012216  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1977  translation initiation factor IF-3  50.57 
 
 		 177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.269445  normal  0.0568676 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2747  translation initiation factor IF-3  46.34 
 
 		 169 aa  163  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.128829 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  46.3 
 
 		 166 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000101645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>