More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_22440 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_22440  translation initiation factor 3  100 
 
 		 329 aa  637    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1103  translation initiation factor IF-3  77.73 
 
 		 233 aa  367  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0433779  normal  0.928932 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1624  translation initiation factor IF-3  82.41 
 
 		 415 aa  355  5e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.640548 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1316  translation initiation factor IF-3  72.8 
 
 		 351 aa  333  2e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3169  translation initiation factor IF-3  82.51 
 
 		 277 aa  320  1.9999999999999998e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14590  translation initiation factor 3  55.66 
 
 		 401 aa  313  2.9999999999999996e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2042  translation initiation factor IF-3  76.53 
 
 		 199 aa  299  4e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0708817  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2385  translation initiation factor IF-3  82.42 
 
 		 192 aa  290  2e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157849  normal  0.289584 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1477  translation initiation factor 3  66.51 
 
 		 396 aa  287  1e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0613769  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3039  translation initiation factor IF-3  70.44 
 
 		 212 aa  286  5e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271102  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6087  Translation initiation factor 3 (IF-3)-like protein  82.42 
 
 		 222 aa  285  9e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5483  translation initiation factor IF-3  76.84 
 
 		 250 aa  283  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2459  translation initiation factor 3  74.19 
 
 		 243 aa  282  4.0000000000000003e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1480  translation initiation factor IF-3  73.3 
 
 		 356 aa  282  5.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000187235 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5473  translation initiation factor IF-3  80.24 
 
 		 204 aa  280  3e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  77.97 
 
 		 227 aa  275  7e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2981  translation initiation factor 3  67 
 
 		 238 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3025  translation initiation factor 3  67 
 
 		 238 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2996  translation initiation factor 3  67 
 
 		 238 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171641  normal  0.0309942 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  76.47 
 
 		 225 aa  270  2e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  72.09 
 
 		 205 aa  269  5.9999999999999995e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21910  translation initiation factor 3  71.67 
 
 		 208 aa  268  1e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.559617  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3328  translation initiation factor IF-3  74.85 
 
 		 243 aa  267  1e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.825238  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3071  translation initiation factor IF-3  74.25 
 
 		 182 aa  265  5.999999999999999e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427548  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11658  translation initiation factor IF-3  73.65 
 
 		 201 aa  263  3e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2139  translation initiation factor IF-3  80.5 
 
 		 177 aa  261  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0045601  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2066  translation initiation factor 3  75.45 
 
 		 179 aa  260  2e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.383221  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2418  translation initiation factor IF-3  70.95 
 
 		 196 aa  258  8e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1875  translation initiation factor IF-3  75 
 
 		 239 aa  258  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.384688 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12250  translation initiation factor 3  68.51 
 
 		 195 aa  252  5.000000000000001e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.109497  normal  0.154931 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3052  translation initiation factor IF-3  70.91 
 
 		 182 aa  251  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1882  translation initiation factor IF-3  74.53 
 
 		 204 aa  251  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0284235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25690  translation initiation factor 3  77.22 
 
 		 168 aa  249  3e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0475  translation initiation factor IF-3  65.75 
 
 		 253 aa  246  4e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1728  initiation factor 3  74.81 
 
 		 149 aa  224  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00351932  hitchhiker  0.00163995 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0232  translation initiation factor 3  65.41 
 
 		 211 aa  221  9.999999999999999e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.627991  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3542  initiation factor 3  73.38 
 
 		 175 aa  218  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.407448  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3622  translation initiation factor IF-3  51.39 
 
 		 357 aa  213  2.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0913675  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  52.66 
 
 		 207 aa  200  3e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  49.72 
 
 		 197 aa  194  1e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  53.94 
 
 		 198 aa  192  7e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000135112  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1301  translation initiation factor 3  56.79 
 
 		 175 aa  192  8e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.444006  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  51.2 
 
 		 202 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0065  translation initiation factor IF-3  50.3 
 
 		 184 aa  180  2.9999999999999997e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  52.73 
 
 		 194 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  52.12 
 
 		 173 aa  180  4e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  52.73 
 
 		 194 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  50.91 
 
 		 194 aa  178  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  50.6 
 
 		 178 aa  177  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  50 
 
 		 179 aa  177  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  51.2 
 
 		 173 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  53.61 
 
 		 198 aa  176  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  45.45 
 
 		 238 aa  176  7e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  49.4 
 
 		 219 aa  174  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  50.92 
 
 		 174 aa  172  5e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1509  translation initiation factor IF-3  50.33 
 
 		 204 aa  171  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00441613  normal  0.913408 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0930  translation initiation factor 3  47.27 
 
 		 178 aa  171  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0441  translation initiation factor IF-3  47.88 
 
 		 179 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.077533  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1678  translation initiation factor IF-3  51.83 
 
 		 170 aa  170  3e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0127847  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  49.07 
 
 		 171 aa  170  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000964088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0522  translation initiation factor IF-3  51.52 
 
 		 193 aa  169  5e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000692532  hitchhiker  0.000000579185 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0713  translation initiation factor 3  45.29 
 
 		 249 aa  169  5e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_002620  TC0221  translation initiation factor IF-3  45.93 
 
 		 186 aa  168  9e-41  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00015702  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  53.29 
 
 		 165 aa  169  9e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2038  translation initiation factor IF-3  46.06 
 
 		 177 aa  168  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.369536 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  47.93 
 
 		 173 aa  167  2e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3163  translation initiation factor IF-3  50.91 
 
 		 252 aa  167  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170352  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1249  translation initiation factor IF-3  51.22 
 
 		 174 aa  167  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.246001 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  47.88 
 
 		 172 aa  166  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0488  translation initiation factor IF-3  45.61 
 
 		 184 aa  166  4e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.270402  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1968  translation initiation factor IF-3  49.09 
 
 		 183 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00361564  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3480  translation initiation factor IF-3  49.09 
 
 		 183 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0422454  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  48.48 
 
 		 225 aa  166  5e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3224  translation initiation factor IF-3  49.09 
 
 		 183 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51494 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2218  translation initiation factor IF-3  47.31 
 
 		 182 aa  166  5e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000264089  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2466  translation initiation factor IF-3  49.09 
 
 		 177 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00240261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  50.3 
 
 		 190 aa  166  6.9999999999999995e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4675  translation initiation factor IF-3  45.45 
 
 		 177 aa  165  9e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.361003  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  50.31 
 
 		 173 aa  164  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0085  translation initiation factor IF-3  50.3 
 
 		 217 aa  165  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0803  translation initiation factor IF-3  50.31 
 
 		 178 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  49.39 
 
 		 187 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1161  translation initiation factor 3  51.95 
 
 		 154 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.930143 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0830  translation initiation factor IF-3  49.09 
 
 		 169 aa  163  3e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.124767  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2538  translation initiation factor IF-3  47.88 
 
 		 173 aa  164  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.838605  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1341  translation initiation factor IF-3  46.63 
 
 		 173 aa  163  3e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01551  translation initiation factor IF-3  50.3 
 
 		 219 aa  163  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  51.32 
 
 		 154 aa  163  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4532  translation initiation factor IF-3  48.47 
 
 		 204 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4267  translation initiation factor IF-3  49.08 
 
 		 178 aa  162  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0131  translation initiation factor IF-3  49.09 
 
 		 217 aa  162  8.000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.122365  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17631  translation initiation factor IF-3  48.48 
 
 		 202 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3261  translation initiation factor IF-3  48.48 
 
 		 195 aa  162  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000125648  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  48.48 
 
 		 195 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000432272  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4306  translation initiation factor IF-3  48.48 
 
 		 195 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000145665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4317  translation initiation factor IF-3  48.48 
 
 		 195 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000117232  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1924  translation initiation factor IF-3  47.88 
 
 		 177 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4699  translation initiation factor IF-3  48.48 
 
 		 166 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000260309  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  48.48 
 
 		 186 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000690292  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  50.31 
 
 		 192 aa  161  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>