More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2218 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2218  translation initiation factor IF-3  100 
 
 		 185 aa  373  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0420504 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1222  translation initiation factor IF-3  74.85 
 
 		 176 aa  236  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000572155  hitchhiker  0.00763284 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0560  translation initiation factor IF-3  65.09 
 
 		 186 aa  234  6e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00554989 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0993  translation initiation factor IF-3  67.55 
 
 		 156 aa  214  7e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1907  translation initiation factor IF-3  66.29 
 
 		 189 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00820  translation initiation factor IF-3  65.79 
 
 		 155 aa  206  2e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.218786  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0991  translation initiation factor IF-3  60.12 
 
 		 201 aa  202  2e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644  translation initiation factor IF-3  60.96 
 
 		 186 aa  194  6e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00296657  normal  0.0579282 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3743  translation initiation factor IF-3  58.72 
 
 		 239 aa  186  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0674596  hitchhiker  0.00196724 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0025  initiation factor 3  64.29 
 
 		 129 aa  172  3.9999999999999995e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  48.86 
 
 		 195 aa  169  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000432272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4471  translation initiation factor IF-3  48.86 
 
 		 195 aa  169  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4306  translation initiation factor IF-3  48.86 
 
 		 195 aa  169  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000145665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4317  translation initiation factor IF-3  48.86 
 
 		 195 aa  169  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000117232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  48.86 
 
 		 186 aa  169  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000690292  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3261  translation initiation factor IF-3  49.11 
 
 		 195 aa  168  4e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000125648  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4690  translation initiation factor IF-3  51.23 
 
 		 166 aa  167  7e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.37112e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4699  translation initiation factor IF-3  51.23 
 
 		 166 aa  167  7e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000260309  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4406  translation initiation factor IF-3  50.62 
 
 		 166 aa  167  7e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000111711  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  50.62 
 
 		 166 aa  167  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000012216  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  50.62 
 
 		 166 aa  167  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000101645  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  47.9 
 
 		 238 aa  164  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  47.34 
 
 		 207 aa  161  5.0000000000000005e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  45.81 
 
 		 194 aa  160  9e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  45.25 
 
 		 194 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  45.25 
 
 		 194 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  47.5 
 
 		 173 aa  159  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  45.2 
 
 		 202 aa  159  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  46.11 
 
 		 225 aa  158  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1311  translation initiation factor IF-3  46.91 
 
 		 164 aa  158  5e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000644552  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  45.66 
 
 		 197 aa  158  5e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  49.08 
 
 		 172 aa  157  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  46.11 
 
 		 219 aa  157  6e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  45.76 
 
 		 190 aa  155  4e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2229  translation initiation factor IF-3  50.92 
 
 		 173 aa  154  6e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00231449 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  47.53 
 
 		 164 aa  153  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2172  translation initiation factor IF-3  48.65 
 
 		 154 aa  153  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000864988  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1225  translation initiation factor 3  45.68 
 
 		 164 aa  153  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000314962  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0489  translation initiation factor IF-3  50.9 
 
 		 176 aa  152  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000720798  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0166  translation initiation factor IF-3  44.44 
 
 		 197 aa  152  2.9999999999999998e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.805148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  46.99 
 
 		 198 aa  152  4e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000135112  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2307  translation initiation factor IF-3  48.03 
 
 		 154 aa  151  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00282878  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2638  translation initiation factor IF-3  50.62 
 
 		 169 aa  151  5e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.294805  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  42.13 
 
 		 202 aa  150  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1412  translation initiation factor IF-3  51.45 
 
 		 143 aa  150  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000852308  normal  0.493061 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  44.38 
 
 		 171 aa  150  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000964088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  42.94 
 
 		 205 aa  149  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3163  translation initiation factor IF-3  46.01 
 
 		 252 aa  149  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3622  translation initiation factor IF-3  43.5 
 
 		 357 aa  148  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0913675  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  45.09 
 
 		 190 aa  148  5e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0171  translation initiation factor IF-3  42.59 
 
 		 202 aa  147  7e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0802308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1968  translation initiation factor IF-3  43.21 
 
 		 183 aa  147  9e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00361564  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3480  translation initiation factor IF-3  43.21 
 
 		 183 aa  147  9e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0422454  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3224  translation initiation factor IF-3  43.21 
 
 		 183 aa  147  9e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51494 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2466  translation initiation factor IF-3  43.21 
 
 		 177 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00240261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3052  translation initiation factor IF-3  47.2 
 
 		 182 aa  146  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  44.64 
 
 		 198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2459  translation initiation factor 3  42.61 
 
 		 243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  43.56 
 
 		 173 aa  145  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2996  translation initiation factor IF-3  44.91 
 
 		 173 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0983  translation initiation factor IF-3  46.89 
 
 		 176 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.104 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11658  translation initiation factor IF-3  45.06 
 
 		 201 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  41.07 
 
 		 178 aa  145  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  45.06 
 
 		 227 aa  144  7.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1409  translation initiation factor IF-3  45.34 
 
 		 172 aa  143  1e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.37178e-16  unclonable  1.3418400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2418  translation initiation factor IF-3  45.68 
 
 		 196 aa  143  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1477  translation initiation factor 3  44.31 
 
 		 396 aa  143  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0613769  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0522  translation initiation factor IF-3  42.59 
 
 		 193 aa  143  2e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000692532  hitchhiker  0.000000579185 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0766  translation initiation factor IF-3  46.45 
 
 		 181 aa  142  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1480  translation initiation factor IF-3  44.31 
 
 		 356 aa  142  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000187235 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  40.48 
 
 		 173 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  44.44 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6087  Translation initiation factor 3 (IF-3)-like protein  43.83 
 
 		 222 aa  142  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0708  translation initiation factor IF-3  49.15 
 
 		 176 aa  142  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00002338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  41.72 
 
 		 174 aa  141  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1372  translation initiation factor 3  45.1 
 
 		 156 aa  141  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0696405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2755  translation initiation factor IF-3  45.1 
 
 		 156 aa  141  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  43.53 
 
 		 187 aa  140  7e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3328  translation initiation factor IF-3  45.06 
 
 		 243 aa  140  7e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.825238  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3488  translation initiation factor 3  46.01 
 
 		 173 aa  140  7e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2981  translation initiation factor 3  44.44 
 
 		 238 aa  140  7e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3025  translation initiation factor 3  44.44 
 
 		 238 aa  140  7e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14590  translation initiation factor 3  42.26 
 
 		 401 aa  140  8e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2996  translation initiation factor 3  44.44 
 
 		 238 aa  140  9e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171641  normal  0.0309942 
 
 
-
 
NC_002620  TC0221  translation initiation factor IF-3  41.42 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00015702  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1875  translation initiation factor IF-3  45.06 
 
 		 239 aa  140  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.384688 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  43.79 
 
 		 154 aa  140  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3169  translation initiation factor IF-3  42.51 
 
 		 277 aa  139  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2109  translation initiation factor IF-3  40.66 
 
 		 219 aa  139  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000273336  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2156  translation initiation factor IF-3  43.64 
 
 		 175 aa  139  3e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000187486  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1400  translation initiation factor IF-3  44.44 
 
 		 156 aa  139  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0821028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4616  translation initiation factor 3  44.44 
 
 		 156 aa  139  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00507113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0994  translation initiation factor IF-3  44.44 
 
 		 156 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1557  translation initiation factor IF-3  42.48 
 
 		 156 aa  139  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1360  translation initiation factor IF-3  44.44 
 
 		 156 aa  139  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.485624  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1453  translation initiation factor IF-3  44.44 
 
 		 156 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0525841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1476  translation initiation factor IF-3  44.44 
 
 		 156 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348442  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1316  translation initiation factor IF-3  42.26 
 
 		 351 aa  138  3.9999999999999997e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1882  translation initiation factor IF-3  44.72 
 
 		 204 aa  138  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0284235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  42.42 
 
 		 179 aa  138  4.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>