More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_00820 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_00820  translation initiation factor IF-3  100 
 
 		 155 aa  310  3.9999999999999997e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.218786  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0993  translation initiation factor IF-3  83.44 
 
 		 156 aa  261  3e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0025  initiation factor 3  80.62 
 
 		 129 aa  216  7.999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0991  translation initiation factor IF-3  66.45 
 
 		 201 aa  209  1e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0560  translation initiation factor IF-3  58.06 
 
 		 186 aa  195  2.0000000000000003e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00554989 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1907  translation initiation factor IF-3  63.87 
 
 		 189 aa  193  6e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3743  translation initiation factor IF-3  62.58 
 
 		 239 aa  187  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0674596  hitchhiker  0.00196724 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644  translation initiation factor IF-3  64.29 
 
 		 186 aa  185  3e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00296657  normal  0.0579282 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2218  translation initiation factor IF-3  65.79 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0420504 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1222  translation initiation factor IF-3  61.29 
 
 		 176 aa  164  5.9999999999999996e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000572155  hitchhiker  0.00763284 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  50.34 
 
 		 173 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  51.66 
 
 		 197 aa  157  6e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  47.59 
 
 		 164 aa  154  6e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  49.34 
 
 		 202 aa  153  7e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2172  translation initiation factor IF-3  48.32 
 
 		 154 aa  153  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000864988  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1613  translation initiation factor IF-3  51.06 
 
 		 145 aa  150  7e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000306668  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  44.44 
 
 		 154 aa  150  8e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0522  translation initiation factor IF-3  48.05 
 
 		 193 aa  149  1e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000692532  hitchhiker  0.000000579185 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1161  translation initiation factor 3  50 
 
 		 154 aa  149  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.930143 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  47.06 
 
 		 165 aa  149  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1301  translation initiation factor 3  46.75 
 
 		 175 aa  149  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.444006  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  45.45 
 
 		 238 aa  148  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2996  translation initiation factor IF-3  45.51 
 
 		 173 aa  148  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  51.61 
 
 		 194 aa  148  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  50.97 
 
 		 194 aa  147  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  50.97 
 
 		 194 aa  147  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  44.81 
 
 		 225 aa  145  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1763  translation initiation factor 3  51.09 
 
 		 137 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3071  translation initiation factor IF-3  46.15 
 
 		 182 aa  144  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427548  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0428  translation initiation factor IF-3  44.87 
 
 		 156 aa  144  5e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0489  translation initiation factor IF-3  47.68 
 
 		 176 aa  144  5e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000720798  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  47.37 
 
 		 207 aa  143  7.0000000000000006e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  47.44 
 
 		 225 aa  143  7.0000000000000006e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  48.03 
 
 		 198 aa  143  7.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000135112  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  46.15 
 
 		 178 aa  142  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0724  translation initiation factor IF-3  46 
 
 		 194 aa  143  1e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000346718  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2066  translation initiation factor 3  45.51 
 
 		 179 aa  142  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.383221  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0713  translation initiation factor 3  44.23 
 
 		 249 aa  142  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  45.45 
 
 		 198 aa  142  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  41.72 
 
 		 187 aa  142  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1557  translation initiation factor IF-3  46.79 
 
 		 156 aa  141  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3488  translation initiation factor 3  50 
 
 		 173 aa  141  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  44.23 
 
 		 219 aa  141  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2307  translation initiation factor IF-3  44.9 
 
 		 154 aa  141  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00282878  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1372  translation initiation factor 3  47.44 
 
 		 156 aa  140  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0696405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2755  translation initiation factor IF-3  47.44 
 
 		 156 aa  140  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1778  translation initiation factor IF-3  47.44 
 
 		 156 aa  140  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.843423 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3622  translation initiation factor IF-3  41.29 
 
 		 357 aa  140  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0913675  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2385  translation initiation factor IF-3  46.79 
 
 		 192 aa  140  7e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157849  normal  0.289584 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  47.1 
 
 		 190 aa  140  8e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4616  translation initiation factor 3  47.44 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00507113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1453  translation initiation factor IF-3  47.44 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0525841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0994  translation initiation factor IF-3  47.44 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  41.83 
 
 		 179 aa  139  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1360  translation initiation factor IF-3  47.44 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.485624  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1400  translation initiation factor IF-3  47.44 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0821028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1476  translation initiation factor IF-3  47.44 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348442  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2638  translation initiation factor IF-3  45.58 
 
 		 169 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.294805  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1800  translation initiation factor 3  47.4 
 
 		 163 aa  138  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00939294  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3169  translation initiation factor IF-3  46.05 
 
 		 277 aa  138  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0065  translation initiation factor IF-3  44.3 
 
 		 184 aa  138  3e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  46.1 
 
 		 173 aa  138  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2042  translation initiation factor IF-3  45.51 
 
 		 199 aa  138  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0708817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0930  translation initiation factor 3  42 
 
 		 178 aa  138  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  46.48 
 
 		 173 aa  137  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  44.23 
 
 		 173 aa  137  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  44.87 
 
 		 178 aa  136  8.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  44.87 
 
 		 178 aa  136  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1008  translation initiation factor 3  46.1 
 
 		 155 aa  136  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0442083  hitchhiker  0.00912814 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1419  translation initiation factor IF-3  43.06 
 
 		 146 aa  136  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000288109  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1412  translation initiation factor IF-3  46.76 
 
 		 143 aa  136  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000852308  normal  0.493061 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2150  translation initiation factor IF-3  44.44 
 
 		 173 aa  135  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0766  translation initiation factor IF-3  43.24 
 
 		 181 aa  135  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2459  translation initiation factor 3  44.87 
 
 		 243 aa  135  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0964  translation initiation factor IF-3  46.15 
 
 		 156 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.698743  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1713  translation initiation factor IF-3  46.15 
 
 		 156 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225755  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1095  translation initiation factor IF-3  46.15 
 
 		 156 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.171775  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1891  translation initiation factor IF-3  46.15 
 
 		 156 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2594  translation initiation factor IF-3  46.15 
 
 		 156 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1736  translation initiation factor IF-3  46.15 
 
 		 156 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0201  translation initiation factor IF-3  46.15 
 
 		 156 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00116998  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1538  translation initiation factor IF-3  46.15 
 
 		 156 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  41.83 
 
 		 171 aa  135  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000964088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1311  translation initiation factor IF-3  43.51 
 
 		 164 aa  134  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000644552  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3163  translation initiation factor IF-3  41.45 
 
 		 252 aa  134  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2139  translation initiation factor IF-3  46.79 
 
 		 177 aa  134  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0045601  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2103  translation initiation factor 3  45.51 
 
 		 177 aa  134  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  0.133955 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1316  translation initiation factor IF-3  44.87 
 
 		 351 aa  134  6.0000000000000005e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2054  translation initiation factor IF-3  45.27 
 
 		 152 aa  134  7.000000000000001e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000423398  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3261  translation initiation factor IF-3  42.95 
 
 		 195 aa  133  7.000000000000001e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000125648  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0441  translation initiation factor IF-3  43.24 
 
 		 179 aa  133  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.077533  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2229  translation initiation factor IF-3  46.41 
 
 		 173 aa  133  8e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00231449 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4675  translation initiation factor IF-3  43.92 
 
 		 177 aa  133  9e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.361003  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  44.44 
 
 		 172 aa  133  9e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  41.83 
 
 		 202 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0983  translation initiation factor IF-3  44.08 
 
 		 176 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.104 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  42.31 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000101645  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2853  translation initiation factor IF-3  44.87 
 
 		 174 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0116753 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0767  translation initiation factor 3  46.58 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0171  translation initiation factor IF-3  43.23 
 
 		 202 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0802308  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>