More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1907 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1907  translation initiation factor IF-3  100 
 
 		 189 aa  380  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0560  translation initiation factor IF-3  59.24 
 
 		 186 aa  226  1e-58  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00554989 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0993  translation initiation factor IF-3  68.21 
 
 		 156 aa  219  1.9999999999999999e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644  translation initiation factor IF-3  65.03 
 
 		 186 aa  214  5.9999999999999996e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00296657  normal  0.0579282 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00820  translation initiation factor IF-3  63.87 
 
 		 155 aa  209  3e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.218786  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0991  translation initiation factor IF-3  61.05 
 
 		 201 aa  206  1e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2218  translation initiation factor IF-3  66.29 
 
 		 185 aa  204  4e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0420504 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3743  translation initiation factor IF-3  56.19 
 
 		 239 aa  202  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0674596  hitchhiker  0.00196724 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1222  translation initiation factor IF-3  64.5 
 
 		 176 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000572155  hitchhiker  0.00763284 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0025  initiation factor 3  62.7 
 
 		 129 aa  172  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  53.09 
 
 		 166 aa  170  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000101645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4690  translation initiation factor IF-3  52.47 
 
 		 166 aa  169  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.37112e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  52.47 
 
 		 186 aa  170  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000690292  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4699  translation initiation factor IF-3  52.47 
 
 		 166 aa  169  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000260309  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  53.09 
 
 		 166 aa  170  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000012216  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  52.47 
 
 		 195 aa  169  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000432272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4471  translation initiation factor IF-3  52.47 
 
 		 195 aa  169  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4306  translation initiation factor IF-3  52.47 
 
 		 195 aa  169  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000145665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4317  translation initiation factor IF-3  52.47 
 
 		 195 aa  169  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000117232  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4406  translation initiation factor IF-3  51.85 
 
 		 166 aa  168  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000111711  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3261  translation initiation factor IF-3  51.85 
 
 		 195 aa  167  8e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000125648  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  49.4 
 
 		 172 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2229  translation initiation factor IF-3  52.69 
 
 		 173 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00231449 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  51.23 
 
 		 202 aa  161  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  51.23 
 
 		 190 aa  161  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  49.69 
 
 		 238 aa  156  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  49.07 
 
 		 225 aa  155  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1311  translation initiation factor IF-3  48.77 
 
 		 164 aa  154  6e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000644552  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  46.3 
 
 		 164 aa  153  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  44.63 
 
 		 190 aa  152  2.9999999999999998e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2996  translation initiation factor IF-3  44.03 
 
 		 173 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3163  translation initiation factor IF-3  47.83 
 
 		 252 aa  151  5.9999999999999996e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1225  translation initiation factor 3  47.53 
 
 		 164 aa  150  8e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000314962  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1412  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 143 aa  150  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000852308  normal  0.493061 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  43.48 
 
 		 202 aa  150  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2307  translation initiation factor IF-3  45.33 
 
 		 154 aa  150  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00282878  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2466  translation initiation factor IF-3  46.3 
 
 		 177 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00240261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3224  translation initiation factor IF-3  46.3 
 
 		 183 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51494 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2172  translation initiation factor IF-3  47.33 
 
 		 154 aa  149  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000864988  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3480  translation initiation factor IF-3  46.3 
 
 		 183 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0422454  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  44.85 
 
 		 187 aa  149  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1968  translation initiation factor IF-3  46.3 
 
 		 183 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00361564  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  44.91 
 
 		 173 aa  149  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  44.79 
 
 		 179 aa  149  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  44 
 
 		 194 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  45.45 
 
 		 219 aa  148  6e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1409  translation initiation factor IF-3  49.07 
 
 		 172 aa  148  6e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.37178e-16  unclonable  1.3418400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  43.11 
 
 		 178 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3052  translation initiation factor IF-3  45.78 
 
 		 182 aa  146  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  43.03 
 
 		 173 aa  145  3e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  43.43 
 
 		 194 aa  145  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  43.43 
 
 		 194 aa  145  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4616  translation initiation factor 3  44.87 
 
 		 156 aa  145  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00507113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1557  translation initiation factor IF-3  44.44 
 
 		 156 aa  145  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0994  translation initiation factor IF-3  44.87 
 
 		 156 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1453  translation initiation factor IF-3  44.87 
 
 		 156 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0525841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1476  translation initiation factor IF-3  44.87 
 
 		 156 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348442  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1360  translation initiation factor IF-3  44.87 
 
 		 156 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.485624  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1400  translation initiation factor IF-3  44.87 
 
 		 156 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0821028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2853  translation initiation factor IF-3  47.24 
 
 		 174 aa  144  9e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0116753 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1372  translation initiation factor 3  44.44 
 
 		 156 aa  144  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0696405  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2908  translation initiation factor IF-3  43.48 
 
 		 185 aa  144  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0830  translation initiation factor IF-3  45.4 
 
 		 169 aa  143  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.124767  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2103  translation initiation factor 3  48.39 
 
 		 177 aa  144  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  0.133955 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2218  translation initiation factor IF-3  44.58 
 
 		 182 aa  143  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000264089  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1538  translation initiation factor IF-3  43.79 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1095  translation initiation factor IF-3  43.79 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.171775  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2755  translation initiation factor IF-3  43.79 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1891  translation initiation factor IF-3  43.79 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1713  translation initiation factor IF-3  43.79 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225755  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2594  translation initiation factor IF-3  43.79 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1241  translation initiation factor 3  44.85 
 
 		 170 aa  143  2e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000256408  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1736  translation initiation factor IF-3  43.79 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1778  translation initiation factor IF-3  44.23 
 
 		 156 aa  143  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.843423 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0201  translation initiation factor IF-3  43.79 
 
 		 156 aa  142  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00116998  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0724  translation initiation factor IF-3  43.31 
 
 		 194 aa  142  3e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000346718  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0964  translation initiation factor IF-3  43.79 
 
 		 156 aa  142  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.698743  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  45.96 
 
 		 198 aa  142  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  43.54 
 
 		 165 aa  141  5e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  44.85 
 
 		 171 aa  141  5e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000964088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1875  translation initiation factor IF-3  43.29 
 
 		 239 aa  141  7e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.384688 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3622  translation initiation factor IF-3  41.99 
 
 		 357 aa  140  8e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0913675  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  41.07 
 
 		 173 aa  140  8e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1763  translation initiation factor 3  45.11 
 
 		 137 aa  140  9e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20430  translation initiation factor IF-3  46.3 
 
 		 177 aa  140  9e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  44.51 
 
 		 207 aa  140  9e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_002620  TC0221  translation initiation factor IF-3  43.03 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00015702  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2505  translation initiation factor IF-3  43.43 
 
 		 177 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.99075  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1932  translation initiation factor IF-3  44.44 
 
 		 177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00133999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0488  translation initiation factor IF-3  46.41 
 
 		 184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.270402  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  44.37 
 
 		 173 aa  140  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1977  translation initiation factor IF-3  45.68 
 
 		 177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.269445  normal  0.0568676 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1882  translation initiation factor IF-3  43.48 
 
 		 204 aa  139  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0284235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1952  translation initiation factor IF-3  47.27 
 
 		 180 aa  139  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.26259  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1316  translation initiation factor IF-3  43.03 
 
 		 351 aa  139  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28660  translation initiation factor IF-3  43.43 
 
 		 177 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000259634 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0766  translation initiation factor IF-3  48.65 
 
 		 181 aa  139  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  41.18 
 
 		 205 aa  138  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  42.29 
 
 		 178 aa  138  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  44.51 
 
 		 225 aa  138  4.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>