More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0560 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_0560  translation initiation factor IF-3  100 
 
 		 186 aa  378  1e-104  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00554989 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1907  translation initiation factor IF-3  59.24 
 
 		 189 aa  208  3e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1222  translation initiation factor IF-3  65.88 
 
 		 176 aa  207  5e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000572155  hitchhiker  0.00763284 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2218  translation initiation factor IF-3  65.09 
 
 		 185 aa  206  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0420504 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644  translation initiation factor IF-3  65.45 
 
 		 186 aa  202  2e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00296657  normal  0.0579282 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3743  translation initiation factor IF-3  58.62 
 
 		 239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0674596  hitchhiker  0.00196724 
 
 
-
 
NC_002950  PG0991  translation initiation factor IF-3  57.58 
 
 		 201 aa  196  2.0000000000000003e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00820  translation initiation factor IF-3  58.06 
 
 		 155 aa  195  3e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.218786  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0993  translation initiation factor IF-3  58.94 
 
 		 156 aa  193  1e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0025  initiation factor 3  59.69 
 
 		 129 aa  169  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3261  translation initiation factor IF-3  46.78 
 
 		 195 aa  160  7e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000125648  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  50.91 
 
 		 194 aa  157  6e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  48.15 
 
 		 202 aa  158  6e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  50.91 
 
 		 194 aa  157  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  49.7 
 
 		 194 aa  157  7e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4406  translation initiation factor IF-3  46.67 
 
 		 166 aa  157  7e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000111711  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4699  translation initiation factor IF-3  46.67 
 
 		 166 aa  157  7e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000260309  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  46.67 
 
 		 186 aa  157  7e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000690292  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4690  translation initiation factor IF-3  46.67 
 
 		 166 aa  157  7e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.37112e-62 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  49.7 
 
 		 172 aa  157  8e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  46.67 
 
 		 195 aa  157  8e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000432272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4471  translation initiation factor IF-3  46.67 
 
 		 195 aa  157  8e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4306  translation initiation factor IF-3  46.67 
 
 		 195 aa  157  8e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000145665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4317  translation initiation factor IF-3  46.67 
 
 		 195 aa  157  8e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000117232  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  42.29 
 
 		 178 aa  157  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2172  translation initiation factor IF-3  51.41 
 
 		 154 aa  157  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000864988  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  46.06 
 
 		 166 aa  157  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000012216  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  46.06 
 
 		 166 aa  157  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000101645  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3622  translation initiation factor IF-3  44.63 
 
 		 357 aa  157  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0913675  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  42.69 
 
 		 173 aa  156  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  43.53 
 
 		 202 aa  156  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  45.03 
 
 		 219 aa  155  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  43.93 
 
 		 190 aa  153  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  46.91 
 
 		 171 aa  154  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000964088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  46.63 
 
 		 173 aa  150  7e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  44.91 
 
 		 238 aa  150  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  45.06 
 
 		 173 aa  150  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  44.91 
 
 		 225 aa  149  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  43.71 
 
 		 197 aa  148  5e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  44.31 
 
 		 198 aa  147  6e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  44.32 
 
 		 190 aa  145  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  43.9 
 
 		 179 aa  146  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  43.01 
 
 		 207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2996  translation initiation factor IF-3  43.48 
 
 		 173 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0830  translation initiation factor IF-3  43.83 
 
 		 169 aa  145  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.124767  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2229  translation initiation factor IF-3  49.38 
 
 		 173 aa  145  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00231449 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2307  translation initiation factor IF-3  46.1 
 
 		 154 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00282878  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  44.91 
 
 		 198 aa  143  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000135112  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1095  translation initiation factor IF-3  44.23 
 
 		 156 aa  143  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.171775  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1557  translation initiation factor IF-3  42.95 
 
 		 156 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1891  translation initiation factor IF-3  44.23 
 
 		 156 aa  143  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1729  translation initiation factor IF-3  46.93 
 
 		 190 aa  143  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2594  translation initiation factor IF-3  44.23 
 
 		 156 aa  143  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1713  translation initiation factor IF-3  44.23 
 
 		 156 aa  143  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225755  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1538  translation initiation factor IF-3  44.23 
 
 		 156 aa  143  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  46.3 
 
 		 227 aa  143  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1736  translation initiation factor IF-3  44.23 
 
 		 156 aa  143  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  43.09 
 
 		 205 aa  142  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2103  translation initiation factor 3  45.91 
 
 		 177 aa  143  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  0.133955 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2042  translation initiation factor IF-3  45.51 
 
 		 199 aa  142  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0708817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3163  translation initiation factor IF-3  43.71 
 
 		 252 aa  142  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2853  translation initiation factor IF-3  45.91 
 
 		 174 aa  142  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0116753 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0964  translation initiation factor IF-3  43.59 
 
 		 156 aa  142  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.698743  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3039  translation initiation factor IF-3  47.9 
 
 		 212 aa  142  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271102  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0201  translation initiation factor IF-3  43.59 
 
 		 156 aa  142  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00116998  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0171  translation initiation factor IF-3  40.96 
 
 		 202 aa  142  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0802308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18461  translation initiation factor IF-3  46.37 
 
 		 190 aa  142  3e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  42.68 
 
 		 164 aa  142  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0522  translation initiation factor IF-3  43.83 
 
 		 193 aa  142  4e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000692532  hitchhiker  0.000000579185 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0065  translation initiation factor IF-3  40.11 
 
 		 184 aa  142  4e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1225  translation initiation factor 3  43.21 
 
 		 164 aa  141  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000314962  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01551  translation initiation factor IF-3  45.81 
 
 		 219 aa  141  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11658  translation initiation factor IF-3  43.83 
 
 		 201 aa  141  5e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18271  translation initiation factor IF-3  45.81 
 
 		 190 aa  141  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.125602  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1778  translation initiation factor IF-3  43.59 
 
 		 156 aa  141  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.843423 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1372  translation initiation factor 3  42.31 
 
 		 156 aa  141  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0696405  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4675  translation initiation factor IF-3  42.94 
 
 		 177 aa  141  6e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.361003  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  45.21 
 
 		 165 aa  141  6e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2418  translation initiation factor IF-3  46.3 
 
 		 196 aa  141  6e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22440  translation initiation factor 3  45.93 
 
 		 329 aa  141  6e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2038  translation initiation factor IF-3  42.94 
 
 		 177 aa  141  7e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.369536 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  41.52 
 
 		 187 aa  141  7e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2755  translation initiation factor IF-3  42.31 
 
 		 156 aa  140  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1412  translation initiation factor IF-3  49.65 
 
 		 143 aa  140  9e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000852308  normal  0.493061 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1768  translation initiation factor IF-3  45.68 
 
 		 221 aa  140  9e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.40976 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1400  translation initiation factor IF-3  43.59 
 
 		 156 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0821028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4616  translation initiation factor 3  43.59 
 
 		 156 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00507113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0994  translation initiation factor IF-3  43.59 
 
 		 156 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14590  translation initiation factor 3  43.98 
 
 		 401 aa  140  9.999999999999999e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1453  translation initiation factor IF-3  43.59 
 
 		 156 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0525841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1360  translation initiation factor IF-3  43.59 
 
 		 156 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.485624  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1476  translation initiation factor IF-3  43.59 
 
 		 156 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348442  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  43.98 
 
 		 225 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_002620  TC0221  translation initiation factor IF-3  41.36 
 
 		 186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00015702  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6087  Translation initiation factor 3 (IF-3)-like protein  46.3 
 
 		 222 aa  139  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1103  translation initiation factor IF-3  44.2 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0433779  normal  0.928932 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1763  translation initiation factor 3  48.18 
 
 		 137 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2150  translation initiation factor IF-3  44.79 
 
 		 173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3328  translation initiation factor IF-3  44.44 
 
 		 243 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.825238  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  43.56 
 
 		 173 aa  139  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>