More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1644 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1644  translation initiation factor IF-3  100 
 
 		 186 aa  376  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00296657  normal  0.0579282 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0560  translation initiation factor IF-3  65.45 
 
 		 186 aa  233  2.0000000000000002e-60  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00554989 
 
 
-
 
NC_002950  PG0991  translation initiation factor IF-3  65.9 
 
 		 201 aa  224  5.0000000000000005e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1907  translation initiation factor IF-3  65.03 
 
 		 189 aa  224  7e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0993  translation initiation factor IF-3  67.55 
 
 		 156 aa  211  4.9999999999999996e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00820  translation initiation factor IF-3  64.29 
 
 		 155 aa  210  7.999999999999999e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.218786  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3743  translation initiation factor IF-3  61.99 
 
 		 239 aa  196  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0674596  hitchhiker  0.00196724 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2218  translation initiation factor IF-3  60.96 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0420504 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1222  translation initiation factor IF-3  69.14 
 
 		 176 aa  194  5.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000572155  hitchhiker  0.00763284 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0025  initiation factor 3  66.67 
 
 		 129 aa  175  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  45.25 
 
 		 202 aa  164  5.9999999999999996e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  46.59 
 
 		 202 aa  159  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  44.89 
 
 		 186 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000690292  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  44.89 
 
 		 195 aa  158  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000432272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4471  translation initiation factor IF-3  44.89 
 
 		 195 aa  158  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4306  translation initiation factor IF-3  44.89 
 
 		 195 aa  158  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000145665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4317  translation initiation factor IF-3  44.89 
 
 		 195 aa  158  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000117232  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  45.81 
 
 		 194 aa  158  5e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  45.81 
 
 		 194 aa  158  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  44.69 
 
 		 194 aa  158  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4406  translation initiation factor IF-3  46.3 
 
 		 166 aa  157  7e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000111711  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  46.91 
 
 		 166 aa  157  8e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000012216  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  46.91 
 
 		 166 aa  157  8e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000101645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4690  translation initiation factor IF-3  46.3 
 
 		 166 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.37112e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3261  translation initiation factor IF-3  46.91 
 
 		 195 aa  156  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000125648  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4699  translation initiation factor IF-3  46.3 
 
 		 166 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000260309  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  47.59 
 
 		 225 aa  155  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  45.51 
 
 		 190 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  45.61 
 
 		 190 aa  154  5.0000000000000005e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  45.61 
 
 		 238 aa  153  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  45.06 
 
 		 164 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  47.56 
 
 		 173 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2172  translation initiation factor IF-3  47.3 
 
 		 154 aa  151  5e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000864988  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2996  translation initiation factor IF-3  44.64 
 
 		 173 aa  151  5e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  44.71 
 
 		 197 aa  151  5.9999999999999996e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  47.24 
 
 		 173 aa  149  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2229  translation initiation factor IF-3  48.8 
 
 		 173 aa  149  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00231449 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  41.72 
 
 		 179 aa  149  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  45.68 
 
 		 198 aa  148  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  43.53 
 
 		 178 aa  148  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  44.51 
 
 		 173 aa  147  9e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  46.3 
 
 		 172 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1225  translation initiation factor 3  46.3 
 
 		 164 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000314962  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1311  translation initiation factor IF-3  44.44 
 
 		 164 aa  145  4.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000644552  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  40.61 
 
 		 187 aa  145  4.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  43.93 
 
 		 219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  44.51 
 
 		 173 aa  145  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0803  translation initiation factor IF-3  43.75 
 
 		 178 aa  144  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3622  translation initiation factor IF-3  40.34 
 
 		 357 aa  144  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0913675  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1768  translation initiation factor IF-3  44.07 
 
 		 221 aa  144  7.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.40976 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1412  translation initiation factor IF-3  48.57 
 
 		 143 aa  143  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000852308  normal  0.493061 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3163  translation initiation factor IF-3  42.86 
 
 		 252 aa  143  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1763  translation initiation factor 3  47.06 
 
 		 137 aa  143  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  42.33 
 
 		 171 aa  142  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000964088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1557  translation initiation factor IF-3  45.1 
 
 		 156 aa  142  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2666  translation initiation factor IF-3  43.37 
 
 		 176 aa  142  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1314  translation initiation factor IF-3  43.5 
 
 		 185 aa  141  7e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241721  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2150  translation initiation factor IF-3  43.56 
 
 		 173 aa  140  8e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4267  translation initiation factor IF-3  44.32 
 
 		 178 aa  140  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  42.61 
 
 		 192 aa  140  9e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0724  translation initiation factor IF-3  43.95 
 
 		 194 aa  140  9e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000346718  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1008  translation initiation factor 3  47.06 
 
 		 155 aa  140  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0442083  hitchhiker  0.00912814 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  43.11 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2747  translation initiation factor IF-3  44.24 
 
 		 169 aa  140  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.128829 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1372  translation initiation factor 3  45.1 
 
 		 156 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0696405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2853  translation initiation factor IF-3  46.45 
 
 		 174 aa  140  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0116753 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2307  translation initiation factor IF-3  44.37 
 
 		 154 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00282878  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  42.26 
 
 		 174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2755  translation initiation factor IF-3  45.1 
 
 		 156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1613  translation initiation factor IF-3  48.91 
 
 		 145 aa  139  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000306668  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0265  translation initiation factor IF-3  43.1 
 
 		 173 aa  139  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.910814  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0522  translation initiation factor IF-3  42.01 
 
 		 193 aa  139  3e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000692532  hitchhiker  0.000000579185 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  44.37 
 
 		 165 aa  139  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2218  translation initiation factor IF-3  41.62 
 
 		 182 aa  139  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000264089  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  40.91 
 
 		 154 aa  138  3.9999999999999997e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2103  translation initiation factor 3  45.16 
 
 		 177 aa  138  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  0.133955 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  44.51 
 
 		 227 aa  138  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4532  translation initiation factor IF-3  43.18 
 
 		 204 aa  137  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2804  translation initiation factor IF-3  42.86 
 
 		 180 aa  137  7e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3488  translation initiation factor 3  46.71 
 
 		 173 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0221  translation initiation factor IF-3  40.12 
 
 		 186 aa  137  1e-31  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00015702  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1772  translation initiation factor IF-3  47.02 
 
 		 200 aa  137  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000139127  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2638  translation initiation factor IF-3  45.12 
 
 		 169 aa  137  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.294805  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1738  translation initiation factor IF-3  47.02 
 
 		 200 aa  137  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000196833  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0428  translation initiation factor IF-3  41.83 
 
 		 156 aa  137  1e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1095  translation initiation factor IF-3  43.79 
 
 		 156 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.171775  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1538  translation initiation factor IF-3  43.79 
 
 		 156 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1891  translation initiation factor IF-3  43.79 
 
 		 156 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0201  translation initiation factor IF-3  43.79 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00116998  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2594  translation initiation factor IF-3  43.79 
 
 		 156 aa  136  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1736  translation initiation factor IF-3  43.79 
 
 		 156 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1241  translation initiation factor 3  39.52 
 
 		 170 aa  135  2e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000256408  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0964  translation initiation factor IF-3  43.79 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.698743  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14590  translation initiation factor 3  43.83 
 
 		 401 aa  135  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1713  translation initiation factor IF-3  43.79 
 
 		 156 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225755  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0065  translation initiation factor IF-3  41.21 
 
 		 184 aa  135  3.0000000000000003e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2538  translation initiation factor IF-3  43.56 
 
 		 173 aa  135  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.838605  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0200  translation initiation factor IF-3  46.62 
 
 		 151 aa  135  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1409  translation initiation factor IF-3  44.1 
 
 		 172 aa  135  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.37178e-16  unclonable  1.3418400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1778  translation initiation factor IF-3  43.79 
 
 		 156 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.843423 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>