More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0991 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0991  translation initiation factor IF-3  100 
 
 		 201 aa  412  1e-114  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0993  translation initiation factor IF-3  69.54 
 
 		 156 aa  228  7e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00820  translation initiation factor IF-3  66.45 
 
 		 155 aa  220  9.999999999999999e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.218786  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644  translation initiation factor IF-3  65.9 
 
 		 186 aa  217  1e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00296657  normal  0.0579282 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1907  translation initiation factor IF-3  61.05 
 
 		 189 aa  209  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0560  translation initiation factor IF-3  57.58 
 
 		 186 aa  207  8e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00554989 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3743  translation initiation factor IF-3  61.54 
 
 		 239 aa  204  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0674596  hitchhiker  0.00196724 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2218  translation initiation factor IF-3  60.12 
 
 		 185 aa  197  9e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0420504 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1222  translation initiation factor IF-3  61.82 
 
 		 176 aa  189  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000572155  hitchhiker  0.00763284 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0025  initiation factor 3  64.29 
 
 		 129 aa  187  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  48.21 
 
 		 197 aa  167  1e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 178 aa  165  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  48.81 
 
 		 173 aa  162  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  47.53 
 
 		 173 aa  160  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  47.02 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2103  translation initiation factor 3  50 
 
 		 177 aa  157  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  0.133955 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2996  translation initiation factor IF-3  45.96 
 
 		 173 aa  157  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  48.15 
 
 		 172 aa  156  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  43.01 
 
 		 238 aa  156  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3622  translation initiation factor IF-3  41 
 
 		 357 aa  155  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0913675  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  46.99 
 
 		 202 aa  154  8e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2853  translation initiation factor IF-3  52.17 
 
 		 174 aa  153  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0116753 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  46.91 
 
 		 198 aa  152  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000135112  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2229  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 173 aa  152  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00231449 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0930  translation initiation factor 3  43.82 
 
 		 178 aa  152  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2858  translation initiation factor 3  52.29 
 
 		 173 aa  151  5e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.357759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2307  translation initiation factor IF-3  47.02 
 
 		 154 aa  151  5e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00282878  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14590  translation initiation factor 3  46.11 
 
 		 401 aa  151  5.9999999999999996e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  43.1 
 
 		 171 aa  151  7e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000964088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  40.61 
 
 		 225 aa  151  8e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  44.79 
 
 		 179 aa  150  8.999999999999999e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2399  translation initiation factor 3  47.62 
 
 		 205 aa  150  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  46.01 
 
 		 166 aa  149  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000101645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  46.01 
 
 		 166 aa  149  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000012216  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  48.15 
 
 		 225 aa  149  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11658  translation initiation factor IF-3  44.31 
 
 		 201 aa  149  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4690  translation initiation factor IF-3  45.4 
 
 		 166 aa  149  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.37112e-62 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  43.33 
 
 		 219 aa  149  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4699  translation initiation factor IF-3  45.4 
 
 		 166 aa  149  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000260309  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4406  translation initiation factor IF-3  45.4 
 
 		 166 aa  149  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000111711  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  46.63 
 
 		 190 aa  149  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  45.4 
 
 		 195 aa  149  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000432272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4471  translation initiation factor IF-3  45.4 
 
 		 195 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4306  translation initiation factor IF-3  45.4 
 
 		 195 aa  149  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000145665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4317  translation initiation factor IF-3  45.4 
 
 		 195 aa  149  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000117232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  45.4 
 
 		 186 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000690292  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  44.57 
 
 		 205 aa  149  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  46.15 
 
 		 190 aa  148  5e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1311  translation initiation factor IF-3  45.68 
 
 		 164 aa  148  6e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000644552  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  47.88 
 
 		 194 aa  148  6e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  44.44 
 
 		 202 aa  148  6e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  47.88 
 
 		 194 aa  148  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1624  translation initiation factor IF-3  40.61 
 
 		 415 aa  148  6e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.640548 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3261  translation initiation factor IF-3  46.01 
 
 		 195 aa  147  7e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000125648  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1161  translation initiation factor 3  49.01 
 
 		 154 aa  147  7e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.930143 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1225  translation initiation factor 3  46.3 
 
 		 164 aa  147  8e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000314962  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0522  translation initiation factor IF-3  42.59 
 
 		 193 aa  147  8e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000692532  hitchhiker  0.000000579185 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1477  translation initiation factor 3  46.06 
 
 		 396 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0613769  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  44.44 
 
 		 164 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2981  translation initiation factor 3  41.15 
 
 		 238 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1301  translation initiation factor 3  45.28 
 
 		 175 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.444006  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2996  translation initiation factor 3  41.15 
 
 		 238 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171641  normal  0.0309942 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  47.02 
 
 		 192 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0489  translation initiation factor IF-3  45.88 
 
 		 176 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000720798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3025  translation initiation factor 3  41.15 
 
 		 238 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1480  translation initiation factor IF-3  46.06 
 
 		 356 aa  145  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000187235 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2172  translation initiation factor IF-3  46.36 
 
 		 154 aa  145  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000864988  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1557  translation initiation factor IF-3  49.02 
 
 		 156 aa  145  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3169  translation initiation factor IF-3  44.44 
 
 		 277 aa  145  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22440  translation initiation factor 3  43.37 
 
 		 329 aa  145  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  46.06 
 
 		 194 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1244  translation initiation factor IF-3  47.9 
 
 		 175 aa  145  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000317297  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  44.51 
 
 		 173 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0724  translation initiation factor IF-3  45.86 
 
 		 194 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000346718  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1103  translation initiation factor IF-3  45.45 
 
 		 233 aa  145  4.0000000000000006e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0433779  normal  0.928932 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2218  translation initiation factor IF-3  44.38 
 
 		 182 aa  145  4.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000264089  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3090  translation initiation factor IF-3  49.67 
 
 		 179 aa  144  6e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.639467  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3488  translation initiation factor 3  47.65 
 
 		 173 aa  144  6e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2042  translation initiation factor IF-3  42.11 
 
 		 199 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0708817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  44.44 
 
 		 198 aa  144  8.000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3328  translation initiation factor IF-3  40.53 
 
 		 243 aa  144  8.000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.825238  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2804  translation initiation factor IF-3  43.45 
 
 		 180 aa  143  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0166  translation initiation factor IF-3  42.94 
 
 		 197 aa  144  1e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.805148  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2466  translation initiation factor IF-3  46.91 
 
 		 177 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00240261  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  45.78 
 
 		 178 aa  143  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  45.78 
 
 		 178 aa  143  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2038  translation initiation factor IF-3  42.6 
 
 		 177 aa  143  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.369536 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  44.97 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3224  translation initiation factor IF-3  46.91 
 
 		 183 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51494 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2638  translation initiation factor IF-3  46.3 
 
 		 169 aa  143  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.294805  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4675  translation initiation factor IF-3  42.6 
 
 		 177 aa  143  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.361003  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3480  translation initiation factor IF-3  46.91 
 
 		 183 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0422454  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1968  translation initiation factor IF-3  46.91 
 
 		 183 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00361564  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1316  translation initiation factor IF-3  44.19 
 
 		 351 aa  143  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1409  translation initiation factor IF-3  44.79 
 
 		 172 aa  143  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.37178e-16  unclonable  1.3418400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1778  translation initiation factor IF-3  48.37 
 
 		 156 aa  142  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.843423 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0065  translation initiation factor IF-3  41.76 
 
 		 184 aa  142  3e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1800  translation initiation factor 3  46.91 
 
 		 163 aa  142  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00939294  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1772  translation initiation factor IF-3  46.75 
 
 		 200 aa  142  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000139127  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1738  translation initiation factor IF-3  46.75 
 
 		 200 aa  142  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000196833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>