More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3743 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3743  translation initiation factor IF-3  100 
 
 		 239 aa  483  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0674596  hitchhiker  0.00196724 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0560  translation initiation factor IF-3  57.46 
 
 		 186 aa  216  2e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00554989 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1907  translation initiation factor IF-3  58.64 
 
 		 189 aa  211  7e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00820  translation initiation factor IF-3  62.58 
 
 		 155 aa  207  2e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.218786  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0991  translation initiation factor IF-3  61.54 
 
 		 201 aa  205  5e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0993  translation initiation factor IF-3  63.46 
 
 		 156 aa  203  2e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644  translation initiation factor IF-3  60.66 
 
 		 186 aa  188  5e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00296657  normal  0.0579282 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2218  translation initiation factor IF-3  58.29 
 
 		 185 aa  181  7e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0420504 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1222  translation initiation factor IF-3  62.65 
 
 		 176 aa  179  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000572155  hitchhiker  0.00763284 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  46.81 
 
 		 194 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  47.25 
 
 		 238 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  51.85 
 
 		 225 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  50.3 
 
 		 194 aa  164  9e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  50.3 
 
 		 194 aa  164  9e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0025  initiation factor 3  58.91 
 
 		 129 aa  164  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1509  translation initiation factor IF-3  45.45 
 
 		 204 aa  164  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00441613  normal  0.913408 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0171  translation initiation factor IF-3  45.06 
 
 		 202 aa  160  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0802308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  49.07 
 
 		 164 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  48.78 
 
 		 202 aa  159  4e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14590  translation initiation factor 3  44.09 
 
 		 401 aa  157  1e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3261  translation initiation factor IF-3  50.3 
 
 		 195 aa  157  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000125648  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0166  translation initiation factor IF-3  45.78 
 
 		 197 aa  156  3e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.805148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3163  translation initiation factor IF-3  48.17 
 
 		 252 aa  156  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1311  translation initiation factor IF-3  48.15 
 
 		 164 aa  155  7e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000644552  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  47.88 
 
 		 195 aa  154  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000432272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4471  translation initiation factor IF-3  47.88 
 
 		 195 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4306  translation initiation factor IF-3  47.88 
 
 		 195 aa  154  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000145665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4317  translation initiation factor IF-3  47.88 
 
 		 195 aa  154  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000117232  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4690  translation initiation factor IF-3  47.88 
 
 		 166 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.37112e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4699  translation initiation factor IF-3  47.88 
 
 		 166 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000260309  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  47.88 
 
 		 186 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000690292  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  47.88 
 
 		 166 aa  154  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000012216  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  47.88 
 
 		 166 aa  154  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000101645  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  47.53 
 
 		 173 aa  154  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3622  translation initiation factor IF-3  41.11 
 
 		 357 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0913675  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4406  translation initiation factor IF-3  47.88 
 
 		 166 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000111711  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  46.39 
 
 		 202 aa  153  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  44.71 
 
 		 173 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  47.7 
 
 		 219 aa  152  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  45.4 
 
 		 179 aa  152  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2996  translation initiation factor IF-3  45.34 
 
 		 173 aa  151  7e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1103  translation initiation factor IF-3  41.75 
 
 		 233 aa  151  8e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0433779  normal  0.928932 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22440  translation initiation factor 3  43.5 
 
 		 329 aa  151  8e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3169  translation initiation factor IF-3  44.57 
 
 		 277 aa  151  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  42.61 
 
 		 178 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1624  translation initiation factor IF-3  43.23 
 
 		 415 aa  150  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.640548 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1477  translation initiation factor 3  44.77 
 
 		 396 aa  149  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0613769  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  45.24 
 
 		 173 aa  149  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  44.75 
 
 		 197 aa  149  4e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3488  translation initiation factor 3  49.08 
 
 		 173 aa  149  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1480  translation initiation factor IF-3  44.2 
 
 		 356 aa  149  5e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000187235 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  45.51 
 
 		 190 aa  148  9e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2229  translation initiation factor IF-3  49.4 
 
 		 173 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00231449 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  46.3 
 
 		 198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1613  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 145 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000306668  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2853  translation initiation factor IF-3  45.56 
 
 		 174 aa  146  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0116753 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  43.4 
 
 		 165 aa  146  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2538  translation initiation factor IF-3  44.17 
 
 		 173 aa  146  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.838605  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  44.44 
 
 		 207 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_002620  TC0221  translation initiation factor IF-3  41.67 
 
 		 186 aa  145  5e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00015702  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  42.77 
 
 		 187 aa  145  6e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0930  translation initiation factor 3  42.42 
 
 		 178 aa  145  6e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1372  translation initiation factor 3  46.79 
 
 		 156 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0696405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2218  translation initiation factor IF-3  45.03 
 
 		 182 aa  145  8.000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000264089  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2755  translation initiation factor IF-3  46.79 
 
 		 156 aa  144  9e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1557  translation initiation factor IF-3  46.15 
 
 		 156 aa  144  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  45.45 
 
 		 172 aa  144  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  44.58 
 
 		 178 aa  144  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1225  translation initiation factor 3  44.44 
 
 		 164 aa  144  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000314962  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1763  translation initiation factor 3  49.64 
 
 		 137 aa  144  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5473  translation initiation factor IF-3  44.38 
 
 		 204 aa  144  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4267  translation initiation factor IF-3  45.4 
 
 		 178 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  44.58 
 
 		 178 aa  143  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1714  translation initiation factor IF-3  43.41 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2418  translation initiation factor IF-3  42.13 
 
 		 196 aa  143  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  45.4 
 
 		 173 aa  144  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2103  translation initiation factor 3  44.85 
 
 		 177 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  0.133955 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0122  translation initiation factor IF-3  43.41 
 
 		 206 aa  143  3e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.176537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4532  translation initiation factor IF-3  44.17 
 
 		 204 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  44.19 
 
 		 225 aa  143  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0190  translation initiation factor IF-3  42.93 
 
 		 186 aa  143  3e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.140917  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2042  translation initiation factor IF-3  43.75 
 
 		 199 aa  142  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0708817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2307  translation initiation factor IF-3  44.81 
 
 		 154 aa  142  4e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00282878  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2466  translation initiation factor IF-3  44.24 
 
 		 177 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00240261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1968  translation initiation factor IF-3  44.24 
 
 		 183 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00361564  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3224  translation initiation factor IF-3  44.24 
 
 		 183 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51494 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3480  translation initiation factor IF-3  44.24 
 
 		 183 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0422454  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  41.85 
 
 		 227 aa  142  6e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1204  translation initiation factor IF-3  47.53 
 
 		 171 aa  142  7e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000244125  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  46.67 
 
 		 198 aa  141  8e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000135112  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0155  translation initiation factor IF-3  45.03 
 
 		 213 aa  141  9e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1889  translation initiation factor IF-3  49.09 
 
 		 180 aa  141  9e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1952  translation initiation factor IF-3  48.48 
 
 		 180 aa  140  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.26259  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2052  translation initiation factor IF-3  49.09 
 
 		 180 aa  140  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0593383  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2459  translation initiation factor 3  43.35 
 
 		 243 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3039  translation initiation factor IF-3  40.88 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271102  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0803  translation initiation factor IF-3  43.56 
 
 		 178 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2181  translation initiation factor IF-3  48.48 
 
 		 180 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0268784  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2666  translation initiation factor IF-3  42.77 
 
 		 176 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2804  translation initiation factor IF-3  42.17 
 
 		 180 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>