More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0025 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0025  initiation factor 3  100 
 
 		 129 aa  258  2e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0993  translation initiation factor IF-3  79.07 
 
 		 156 aa  217  5e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00820  translation initiation factor IF-3  80.62 
 
 		 155 aa  216  7.999999999999999e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.218786  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0991  translation initiation factor IF-3  64.29 
 
 		 201 aa  176  8e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0560  translation initiation factor IF-3  59.69 
 
 		 186 aa  169  1e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00554989 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1907  translation initiation factor IF-3  62.02 
 
 		 189 aa  159  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2218  translation initiation factor IF-3  64.29 
 
 		 185 aa  151  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0420504 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644  translation initiation factor IF-3  66.67 
 
 		 186 aa  149  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00296657  normal  0.0579282 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3743  translation initiation factor IF-3  58.91 
 
 		 239 aa  147  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0674596  hitchhiker  0.00196724 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  50.39 
 
 		 173 aa  142  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1763  translation initiation factor 3  52.8 
 
 		 137 aa  141  4e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  52 
 
 		 202 aa  140  8e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  53.91 
 
 		 194 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  53.91 
 
 		 194 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1613  translation initiation factor IF-3  51.16 
 
 		 145 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000306668  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2172  translation initiation factor IF-3  51.18 
 
 		 154 aa  138  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000864988  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  48.84 
 
 		 178 aa  137  7e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  53.12 
 
 		 194 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  48.82 
 
 		 164 aa  136  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1222  translation initiation factor IF-3  58.14 
 
 		 176 aa  135  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000572155  hitchhiker  0.00763284 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0522  translation initiation factor IF-3  48.82 
 
 		 193 aa  133  6.0000000000000005e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000692532  hitchhiker  0.000000579185 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1161  translation initiation factor 3  51.16 
 
 		 154 aa  133  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.930143 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  46.51 
 
 		 173 aa  133  8e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1800  translation initiation factor 3  52.34 
 
 		 163 aa  133  8e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00939294  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2676  translation initiation factor 3  50.39 
 
 		 137 aa  133  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.233816 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 173 aa  131  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1778  translation initiation factor IF-3  49.61 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.843423 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1453  translation initiation factor IF-3  49.61 
 
 		 156 aa  131  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0525841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4616  translation initiation factor 3  49.61 
 
 		 156 aa  131  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00507113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0994  translation initiation factor IF-3  49.61 
 
 		 156 aa  131  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1360  translation initiation factor IF-3  49.61 
 
 		 156 aa  131  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.485624  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1476  translation initiation factor IF-3  49.61 
 
 		 156 aa  131  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348442  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1400  translation initiation factor IF-3  49.61 
 
 		 156 aa  131  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0821028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1557  translation initiation factor IF-3  48.84 
 
 		 156 aa  130  9e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1412  translation initiation factor IF-3  48.06 
 
 		 143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000852308  normal  0.493061 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2755  translation initiation factor IF-3  49.61 
 
 		 156 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1372  translation initiation factor 3  49.61 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0696405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2307  translation initiation factor IF-3  46.51 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00282878  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  47.62 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2996  translation initiation factor IF-3  45.74 
 
 		 173 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  46.46 
 
 		 198 aa  128  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1095  translation initiation factor IF-3  48.06 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.171775  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01384  translation initiation factor IF-3  47.66 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0201  translation initiation factor IF-3  48.06 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00116998  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1891  translation initiation factor IF-3  48.06 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1736  translation initiation factor IF-3  48.06 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2594  translation initiation factor IF-3  48.06 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0964  translation initiation factor IF-3  48.06 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.698743  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2002  translation initiation factor 3  48.03 
 
 		 153 aa  128  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1713  translation initiation factor IF-3  48.06 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225755  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1538  translation initiation factor IF-3  48.06 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3261  translation initiation factor IF-3  46.51 
 
 		 195 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000125648  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1008  translation initiation factor 3  49.22 
 
 		 155 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0442083  hitchhiker  0.00912814 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1419  translation initiation factor IF-3  46.88 
 
 		 146 aa  127  7.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000288109  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  46.83 
 
 		 171 aa  126  8.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000964088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0065  translation initiation factor IF-3  47.24 
 
 		 184 aa  126  9.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  44.96 
 
 		 219 aa  126  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0767  translation initiation factor 3  46.51 
 
 		 146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  48 
 
 		 197 aa  125  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0428  translation initiation factor IF-3  44.96 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4406  translation initiation factor IF-3  44.96 
 
 		 166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000111711  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  44.96 
 
 		 186 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000690292  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  45.74 
 
 		 166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000012216  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  45.74 
 
 		 166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000101645  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2218  translation initiation factor IF-3  47.24 
 
 		 182 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000264089  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2242  translation initiation factor IF-3  45.31 
 
 		 166 aa  125  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000466118  hitchhiker  0.00531509 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2466  translation initiation factor IF-3  47.29 
 
 		 177 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00240261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3480  translation initiation factor IF-3  47.29 
 
 		 183 aa  124  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0422454  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  44.96 
 
 		 195 aa  125  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000432272  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0724  translation initiation factor IF-3  48 
 
 		 194 aa  125  3e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000346718  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4699  translation initiation factor IF-3  44.96 
 
 		 166 aa  125  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000260309  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4471  translation initiation factor IF-3  44.96 
 
 		 195 aa  125  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4306  translation initiation factor IF-3  44.96 
 
 		 195 aa  125  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000145665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4317  translation initiation factor IF-3  44.96 
 
 		 195 aa  125  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000117232  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4690  translation initiation factor IF-3  44.96 
 
 		 166 aa  125  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.37112e-62 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2804  translation initiation factor IF-3  47.66 
 
 		 180 aa  124  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1968  translation initiation factor IF-3  47.29 
 
 		 183 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00361564  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2613  translation initiation factor IF-3  45.31 
 
 		 172 aa  125  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0154974  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3224  translation initiation factor IF-3  47.29 
 
 		 183 aa  124  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51494 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  44.96 
 
 		 190 aa  125  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2501  translation initiation factor IF-3  51.97 
 
 		 145 aa  124  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.303571  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  45.31 
 
 		 238 aa  124  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2098  translation initiation factor IF-3  44.53 
 
 		 147 aa  124  5e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1301  translation initiation factor 3  41.73 
 
 		 175 aa  124  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.444006  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0766  translation initiation factor IF-3  43.75 
 
 		 181 aa  124  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  45.6 
 
 		 207 aa  124  5e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2038  translation initiation factor IF-3  47.24 
 
 		 177 aa  124  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.369536 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2019  translation initiation factor IF-3  44.53 
 
 		 147 aa  123  6e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  45.24 
 
 		 202 aa  124  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2054  translation initiation factor IF-3  45.67 
 
 		 152 aa  123  7e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000423398  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  42.86 
 
 		 179 aa  123  7e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  43.41 
 
 		 187 aa  123  9e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0488  translation initiation factor IF-3  45.31 
 
 		 184 aa  122  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.270402  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3488  translation initiation factor 3  49.21 
 
 		 173 aa  122  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  44.53 
 
 		 225 aa  123  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  46.83 
 
 		 174 aa  123  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  47.29 
 
 		 172 aa  122  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2300  translation initiation factor IF-3  53.12 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28660  translation initiation factor IF-3  50.39 
 
 		 177 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000259634 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2044  translation initiation factor IF-3  53.12 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000102529  hitchhiker  0.00743884 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>