More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5590 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
326 aa  650    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.501197  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1951  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.13 
 
 
325 aa  366  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.497916  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7099  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.52 
 
 
327 aa  350  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.92 
 
 
328 aa  338  5.9999999999999996e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10217  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3928  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.15 
 
 
325 aa  338  9e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4002  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.15 
 
 
325 aa  338  9e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3943  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.15 
 
 
325 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.104136 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.76 
 
 
325 aa  332  8e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.982552  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.53 
 
 
325 aa  330  2e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.161114  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.39 
 
 
327 aa  321  9.000000000000001e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11309  oligopeptide-transport integral membrane protein ABC transporter oppB  54.6 
 
 
325 aa  317  2e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3278  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.7 
 
 
325 aa  286  2e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000912922  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08480  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  43.19 
 
 
344 aa  270  2.9999999999999997e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0817  ABC peptide/nickel transport system permease protein  49.52 
 
 
336 aa  268  7e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.37 
 
 
327 aa  224  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.89 
 
 
328 aa  219  5e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.78 
 
 
327 aa  216  5e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1117  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.41 
 
 
327 aa  216  5e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.559973  normal  0.0105879 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7778  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.3 
 
 
322 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.413078 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1254  ABC transporter, permease protein  34.26 
 
 
327 aa  207  3e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000126232 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0920  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.88 
 
 
330 aa  205  9e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.311537 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1834  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.25 
 
 
326 aa  192  5e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4534  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.03 
 
 
336 aa  191  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.463935 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31130  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  33.43 
 
 
338 aa  181  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1632  putative ABC transporter permease  35.61 
 
 
336 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214794  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.02 
 
 
332 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0351  peptide ABC transporter, permease protein  35.92 
 
 
319 aa  170  3e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0408  peptide ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
319 aa  169  5e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.599742  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0873  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.97 
 
 
320 aa  162  6e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0307537  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.59 
 
 
322 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.205475 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.82 
 
 
321 aa  160  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2257  oligopeptide ABC transporter, permease component  32.82 
 
 
321 aa  158  9e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2554  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  32.82 
 
 
321 aa  158  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.55 
 
 
319 aa  157  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  35.04 
 
 
339 aa  156  6e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1059  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.26 
 
 
400 aa  155  9e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.543295  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.44 
 
 
319 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.981811  normal  0.0447006 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2175  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.82 
 
 
317 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.735506  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.24 
 
 
331 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  32.94 
 
 
337 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4291  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
338 aa  152  5.9999999999999996e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.11 
 
 
400 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71017  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5300  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  36.47 
 
 
316 aa  150  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340844  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  32.74 
 
 
336 aa  149  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.74 
 
 
336 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.4 
 
 
308 aa  150  4e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.74 
 
 
336 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  32.44 
 
 
336 aa  149  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  33.21 
 
 
336 aa  149  8e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.58 
 
 
319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.540957  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  32.45 
 
 
336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  32.45 
 
 
336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0183  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  32.74 
 
 
336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.31 
 
 
309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4097  dipeptide transporter permease DppB  32.39 
 
 
339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  32.44 
 
 
336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  32.44 
 
 
336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.74 
 
 
315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000049983  normal  0.670386 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.15 
 
 
336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 
335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.96 
 
 
318 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2849  ABC transporter permease protein  32.83 
 
 
313 aa  145  8.000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.585703  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5079  oligopeptide ABC transporter, permease protein  28.05 
 
 
318 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823719  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0131  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.32 
 
 
326 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
312 aa  145  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4683  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 
305 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.14 
 
 
334 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0244  dipeptide ABC transporter, permease protein DppB  32.74 
 
 
336 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
321 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181911  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0050  dipeptide transporter permease DppB  31.6 
 
 
339 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
322 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0045  dipeptide transporter permease DppB  31.82 
 
 
339 aa  144  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.43 
 
 
309 aa  144  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.23 
 
 
324 aa  144  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0257  dipeptide ABC transporter, permease protein DppB  32.74 
 
 
336 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0183254  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0438  dipeptide ABC transporter, permease protein  32.74 
 
 
336 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.287178  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.27 
 
 
334 aa  143  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.186843  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  31.69 
 
 
339 aa  143  4e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0206  oligopeptide ABC transporter, permease  28.05 
 
 
318 aa  143  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0267  oligopeptide ABC transporter, permease protein  28.48 
 
 
318 aa  143  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0139  dipeptide transporter permease DppB  33.69 
 
 
351 aa  143  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0246  oligopeptide ABC transporter, permease protein  29.1 
 
 
307 aa  143  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0542782  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1691  alkaline phosphatase  35.23 
 
 
336 aa  142  6e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.52 
 
 
336 aa  142  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1184  dipeptide ABC transporter, permease protein  32.75 
 
 
333 aa  142  7e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0134333  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2322  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  30.09 
 
 
348 aa  142  7e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.07 
 
 
336 aa  142  8e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532586  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.89 
 
 
335 aa  142  9e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.948745  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0569  oligopeptide ABC transporter, permease  30.09 
 
 
321 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1235  oligopeptide ABC transporter, permease protein  30.92 
 
 
309 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3500  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.38 
 
 
355 aa  141  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0791674  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.21 
 
 
311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.35 
 
 
318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3302  dipeptide ABC transporter, permease protein  32.54 
 
 
338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.31 
 
 
322 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2970  dipeptide ABC transporter, permease protein  32.54 
 
 
338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2357  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.38 
 
 
336 aa  140  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0452163  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1224  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.37 
 
 
313 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3377  dipeptide ABC transporter, permease protein  32.54 
 
 
338 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4297  alkaline phosphatase  32.55 
 
 
336 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.259448  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>