More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0533 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
328 aa  659    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10217  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7099  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.67 
 
 
327 aa  375  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1951  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.52 
 
 
325 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.497916  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.92 
 
 
326 aa  338  5.9999999999999996e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.501197  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3928  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.38 
 
 
325 aa  315  9e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4002  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.38 
 
 
325 aa  315  9e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3943  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.38 
 
 
325 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.104136 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.6 
 
 
325 aa  311  7.999999999999999e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.982552  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.68 
 
 
325 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.161114  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.81 
 
 
327 aa  281  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11309  oligopeptide-transport integral membrane protein ABC transporter oppB  46.6 
 
 
325 aa  276  4e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3278  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.44 
 
 
325 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000912922  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08480  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  41.79 
 
 
344 aa  265  8e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0817  ABC peptide/nickel transport system permease protein  43.55 
 
 
336 aa  241  1e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1254  ABC transporter, permease protein  35.58 
 
 
327 aa  226  3e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000126232 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.2 
 
 
327 aa  226  3e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.31 
 
 
328 aa  216  5.9999999999999996e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0920  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.96 
 
 
330 aa  215  7e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.311537 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36 
 
 
327 aa  209  4e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31130  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  35.42 
 
 
338 aa  204  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4534  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.33 
 
 
336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.463935 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.05 
 
 
332 aa  198  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1834  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.64 
 
 
326 aa  191  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7778  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.5 
 
 
322 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.413078 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1117  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.46 
 
 
327 aa  180  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.559973  normal  0.0105879 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.74 
 
 
319 aa  176  4e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 
318 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.83 
 
 
332 aa  169  6e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00733957  hitchhiker  0.00049009 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0206  oligopeptide ABC transporter, permease  31.69 
 
 
318 aa  168  9e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0210  oligopeptide ABC transporter, permease  31.71 
 
 
318 aa  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0232  oligopeptide ABC transporter permease protein  31.71 
 
 
318 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5079  oligopeptide ABC transporter, permease protein  32 
 
 
318 aa  168  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823719  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0249  oligopeptide ABC transporter, permease protein  31.71 
 
 
318 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1632  putative ABC transporter permease  34.33 
 
 
336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0267  oligopeptide ABC transporter, permease protein  31.38 
 
 
318 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0246  oligopeptide ABC transporter, permease protein  32.89 
 
 
307 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0542782  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0219  oligopeptide ABC transporter permease  32.89 
 
 
307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0242  oligopeptide ABC transporter, permease protein  32.89 
 
 
307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.04 
 
 
321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.38 
 
 
318 aa  164  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0873  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 
320 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0307537  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1059  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.4 
 
 
400 aa  160  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.543295  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6954  oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  33.03 
 
 
319 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.4 
 
 
400 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71017  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1080  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.64 
 
 
307 aa  157  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.810626  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.64 
 
 
321 aa  157  3e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2257  oligopeptide ABC transporter, permease component  32.65 
 
 
321 aa  156  4e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2554  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  32.65 
 
 
321 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.88 
 
 
334 aa  155  7e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1620  peptide ABC transporter, permease protein  32.83 
 
 
321 aa  154  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.911317 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.24 
 
 
307 aa  155  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.801835  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8933  ABC transporter permease protein  36.79 
 
 
307 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.31 
 
 
321 aa  154  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0692911 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1766  peptide ABC transporter, permease protein  33.43 
 
 
321 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1411  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.72 
 
 
319 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0997  oligopeptide ABC transporter, permease protein  30.37 
 
 
316 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.28482e-62 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.33 
 
 
335 aa  154  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1444  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.34 
 
 
314 aa  153  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.935308  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.75 
 
 
313 aa  153  4e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.23 
 
 
331 aa  153  5e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0434  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.36 
 
 
358 aa  152  7e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0891876 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0823  oligopeptide ABC transporter, permease  30.37 
 
 
316 aa  152  8e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.164685  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0808  oligopeptide ABC transporter, permease  30.06 
 
 
316 aa  151  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282065  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.82 
 
 
313 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000789572  normal  0.0157107 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0384  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.11 
 
 
319 aa  150  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.512992 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.52 
 
 
321 aa  151  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0066  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.42 
 
 
334 aa  150  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.11 
 
 
311 aa  150  3e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4598  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.8 
 
 
319 aa  150  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.930375  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5358  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  32.41 
 
 
315 aa  150  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.1 
 
 
309 aa  150  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.62 
 
 
322 aa  150  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.205475 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
314 aa  150  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5300  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  33.55 
 
 
316 aa  149  5e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340844  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1323  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.56 
 
 
341 aa  149  8e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0238996  normal  0.501572 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.39 
 
 
319 aa  149  8e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.981811  normal  0.0447006 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.06 
 
 
316 aa  149  9e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00583871  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0004  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.58 
 
 
320 aa  149  9e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.101832  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.7 
 
 
309 aa  149  9e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 
315 aa  149  9e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4385  oligopeptide ABC transporter, permease protein  29.75 
 
 
316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.02052e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1001  oligopeptide ABC transporter, permease protein  29.79 
 
 
316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0859  oligopeptide ABC transporter permease  30.06 
 
 
316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0909  oligopeptide ABC transporter permease protein  30.06 
 
 
316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0836804  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0946  oligopeptide ABC transporter, permease protein  29.75 
 
 
316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4097  dipeptide transporter permease DppB  32.99 
 
 
339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.29 
 
 
308 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.21 
 
 
313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000799384  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.49 
 
 
320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.766968 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.49 
 
 
320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0405  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.8 
 
 
321 aa  147  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.8 
 
 
321 aa  147  3e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.12 
 
 
321 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181911  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0045  dipeptide transporter permease DppB  32.18 
 
 
339 aa  146  5e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1184  dipeptide ABC transporter, permease protein  29.71 
 
 
333 aa  146  6e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0134333  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0050  dipeptide transporter permease DppB  32.18 
 
 
339 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  32.99 
 
 
339 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0330  nickel-transporting ATPase  33.11 
 
 
334 aa  145  8.000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0802428 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>