More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0757 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
309 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1613  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  88.03 
 
 
339 aa  558  1e-158  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  75.08 
 
 
309 aa  494  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4107  oligopeptide ABC transporter, permease protein  76.05 
 
 
309 aa  473  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1235  oligopeptide ABC transporter, permease protein  75.73 
 
 
309 aa  472  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1090  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  74.43 
 
 
340 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0218658  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1301  oligopeptide ABC transporter, permease protein  74.43 
 
 
309 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1102  oligopeptide ABC transporter permease  74.43 
 
 
309 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1084  oligopeptide ABC transporter, permease  74.43 
 
 
309 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1339  oligopeptide ABC transporter, permease protein  74.43 
 
 
309 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000511987  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1078  oligopeptide ABC transporter, permease  74.43 
 
 
309 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1192  oligopeptide ABC transporter permease protein  74.43 
 
 
309 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1262  oligopeptide ABC transporter, permease protein  74.43 
 
 
309 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.49 
 
 
308 aa  395  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.46607  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1004  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.49 
 
 
308 aa  395  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.243628  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0570  oligopeptide ABC transporter, permease protein  61.17 
 
 
308 aa  377  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.61 
 
 
311 aa  360  2e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0159834  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0867  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.63 
 
 
308 aa  343  2e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0547  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.33 
 
 
306 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.472252  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.33 
 
 
306 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000653909  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0170  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.33 
 
 
305 aa  301  8.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
308 aa  300  1e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1931  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease component  47.87 
 
 
305 aa  298  8e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0186  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.34 
 
 
305 aa  295  6e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0186  oligopeptide ABC transporter permease  50.16 
 
 
307 aa  293  3e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0205  oligopeptide ABC transporter, permease protein  50.16 
 
 
307 aa  293  3e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0185  oligopeptide ABC transporter permease protein  50.16 
 
 
307 aa  293  3e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5114  oligopeptide ABC transporter, permease protein  50.33 
 
 
305 aa  290  2e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0205  oligopeptide ABC transporter, permease protein  50 
 
 
305 aa  289  4e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0229  oligopeptide ABC transporter, permease protein  50 
 
 
305 aa  289  4e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0149  oligopeptide ABC transporter, permease protein  46.05 
 
 
304 aa  288  5.0000000000000004e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.160386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0173  oligopeptide ABC transporter, permease  50 
 
 
305 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00506447  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0176  oligopeptide ABC transporter, permease  50 
 
 
305 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0210  oligopeptide ABC transporter, permease protein  49.67 
 
 
305 aa  288  6e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0639  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  46.08 
 
 
313 aa  285  9e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0391  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  48.03 
 
 
303 aa  285  1.0000000000000001e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.920936  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1917  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.36 
 
 
306 aa  280  2e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000794188  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0759  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.07 
 
 
306 aa  269  5e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000961636  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.79 
 
 
307 aa  266  5e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.22 
 
 
325 aa  265  8e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2162  oligopeptide transporter permease  44.26 
 
 
306 aa  261  1e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0136059  normal  0.0309495 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1959  oligopeptide transporter permease  44.26 
 
 
306 aa  261  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.162478  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2069  oligopeptide transporter permease  44.26 
 
 
306 aa  259  4e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.186457  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2301  oligopeptide transporter permease  41.97 
 
 
306 aa  256  4e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1936  oligopeptide transporter permease  43.28 
 
 
306 aa  255  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.164891 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1582  oligopeptide transporter permease  43.28 
 
 
306 aa  255  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.733786  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1873  oligopeptide transporter permease  43.28 
 
 
306 aa  255  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.741835  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1400  oligopeptide transporter permease  43.28 
 
 
306 aa  255  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_931  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  42.24 
 
 
305 aa  255  8e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.541229  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0942  nickel-transporting ATPase  42.57 
 
 
305 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.541988  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1879  oligopeptide transporter permease  43.28 
 
 
306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.675854 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0610  oligopeptide transporter permease  41.97 
 
 
306 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2965  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.12 
 
 
307 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.681707  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1413  oligopeptide transporter permease  42.95 
 
 
306 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.933952  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1986  oligopeptide transporter permease  42.62 
 
 
306 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.879407  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.25 
 
 
308 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.203407  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01218  oligopeptide permease ABC transporter membrane protein  42.62 
 
 
306 aa  253  3e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.232187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2404  Alkaline phosphatase  42.62 
 
 
306 aa  253  3e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000374689  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1392  oligopeptide transporter permease  42.62 
 
 
306 aa  253  3e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.897764  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1896  oligopeptide transporter permease  42.62 
 
 
306 aa  253  3e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.22801  normal  0.152903 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1730  oligopeptide transporter permease  42.62 
 
 
306 aa  253  3e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  normal  0.0825578 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01228  hypothetical protein  42.62 
 
 
306 aa  253  3e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.227767  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1353  oligopeptide transporter permease  42.62 
 
 
306 aa  253  3e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00072076  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2384  oligopeptide transporter permease  42.62 
 
 
306 aa  253  3e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.423477  hitchhiker  0.00000144694 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2287  oligopeptide transporter permease  42.3 
 
 
306 aa  252  5.000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0289151  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1953  oligopeptide transporter permease  43.28 
 
 
306 aa  251  1e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.26 
 
 
307 aa  251  1e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3020  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.09 
 
 
305 aa  250  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121257  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2194  oligopeptide transporter permease  42.62 
 
 
306 aa  249  5e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0464785  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0063  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.87 
 
 
324 aa  249  5e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2700  oligopeptide transporter permease  41.97 
 
 
306 aa  248  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0475614  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0842  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  43.39 
 
 
297 aa  247  2e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00690225  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0465  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.78 
 
 
309 aa  246  4e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000243016  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02948  oligopeptide transporter permease  41.64 
 
 
306 aa  246  4e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0022  alkaline phosphatase  41.31 
 
 
306 aa  246  4.9999999999999997e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.83 
 
 
307 aa  245  6e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1996  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.67 
 
 
305 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00478237  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.5 
 
 
307 aa  241  1e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.298513  hitchhiker  0.00733729 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2420  nickel-transporting ATPase  38.61 
 
 
305 aa  240  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.827843  normal  0.256782 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1434  peptide ABC transporter, permease protein  38.96 
 
 
326 aa  236  4e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393954  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002960  oligopeptide transport system permease protein OppB  41.38 
 
 
291 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0591  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.69 
 
 
308 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.101579  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4686  alkaline phosphatase  37.38 
 
 
307 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0426131  normal  0.374964 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2889  alkaline phosphatase  40 
 
 
307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.13 
 
 
324 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.31 
 
 
311 aa  232  6e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.679809  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.38 
 
 
321 aa  231  8.000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.67 
 
 
307 aa  231  9e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.591349  normal  0.87569 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1480  ABC oligopeptide transporter, inner membrane subunit OppB  39.67 
 
 
307 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.526899  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.69 
 
 
306 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14841  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.73 
 
 
315 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2029  phosphoglycerate mutase 1  39.1 
 
 
311 aa  229  4e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.664114  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.07 
 
 
308 aa  228  8e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.02 
 
 
307 aa  226  3e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.237541  normal  0.589028 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.91 
 
 
311 aa  226  3e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.65 
 
 
333 aa  226  4e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391976  normal  0.26803 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1001  glutathione ABC transporter permease  38.69 
 
 
306 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.69 
 
 
307 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.525141  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0891  glutathione ABC transporter, permease protein  38.69 
 
 
306 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.976092  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5358  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  38.98 
 
 
315 aa  225  6e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>