More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3856 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
325 aa  655    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0063  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.36 
 
 
324 aa  450  1e-125  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0547  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.48 
 
 
306 aa  316  3e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.472252  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.48 
 
 
306 aa  316  3e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000653909  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1917  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.32 
 
 
306 aa  302  5.000000000000001e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000794188  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.45 
 
 
308 aa  289  4e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3020  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.15 
 
 
305 aa  282  7.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121257  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0759  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.52 
 
 
306 aa  280  3e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000961636  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0170  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.38 
 
 
305 aa  278  7e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1996  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.62 
 
 
305 aa  277  2e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00478237  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0186  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.05 
 
 
305 aa  276  4e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0205  oligopeptide ABC transporter, permease protein  47.04 
 
 
305 aa  272  6e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0229  oligopeptide ABC transporter, permease protein  47.04 
 
 
305 aa  272  6e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0186  oligopeptide ABC transporter permease  46.71 
 
 
307 aa  270  2e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0176  oligopeptide ABC transporter, permease  44.73 
 
 
305 aa  270  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0185  oligopeptide ABC transporter permease protein  46.71 
 
 
307 aa  270  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0205  oligopeptide ABC transporter, permease protein  46.71 
 
 
307 aa  270  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.53 
 
 
309 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0173  oligopeptide ABC transporter, permease  46.05 
 
 
305 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00506447  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0210  oligopeptide ABC transporter, permease protein  46.05 
 
 
305 aa  268  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2420  nickel-transporting ATPase  42.86 
 
 
305 aa  268  1e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.827843  normal  0.256782 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2301  oligopeptide transporter permease  42.59 
 
 
306 aa  268  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1613  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.53 
 
 
339 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5114  oligopeptide ABC transporter, permease protein  47.04 
 
 
305 aa  265  7e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0639  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  43.4 
 
 
313 aa  265  8e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.22 
 
 
309 aa  265  8e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.27 
 
 
307 aa  262  8e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2069  oligopeptide transporter permease  41.32 
 
 
306 aa  261  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.186457  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1959  oligopeptide transporter permease  41.01 
 
 
306 aa  259  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.162478  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2162  oligopeptide transporter permease  41.01 
 
 
306 aa  259  3e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0136059  normal  0.0309495 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2965  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.83 
 
 
307 aa  259  3e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.681707  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1873  oligopeptide transporter permease  40.69 
 
 
306 aa  258  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.741835  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1936  oligopeptide transporter permease  40.69 
 
 
306 aa  258  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.164891 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1582  oligopeptide transporter permease  40.69 
 
 
306 aa  258  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.733786  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1400  oligopeptide transporter permease  40.69 
 
 
306 aa  258  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1879  oligopeptide transporter permease  40.38 
 
 
306 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.675854 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1413  oligopeptide transporter permease  40.38 
 
 
306 aa  256  5e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.933952  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01218  oligopeptide permease ABC transporter membrane protein  40.06 
 
 
306 aa  255  7e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.232187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2404  Alkaline phosphatase  40.06 
 
 
306 aa  255  7e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000374689  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2384  oligopeptide transporter permease  40.06 
 
 
306 aa  255  7e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.423477  hitchhiker  0.00000144694 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1896  oligopeptide transporter permease  40.06 
 
 
306 aa  255  7e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.22801  normal  0.152903 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1392  oligopeptide transporter permease  40.06 
 
 
306 aa  255  7e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.897764  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1730  oligopeptide transporter permease  40.06 
 
 
306 aa  255  7e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  normal  0.0825578 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01228  hypothetical protein  40.06 
 
 
306 aa  255  7e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.227767  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1353  oligopeptide transporter permease  40.06 
 
 
306 aa  255  7e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00072076  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.79 
 
 
308 aa  252  5.000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.203407  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2700  oligopeptide transporter permease  39.43 
 
 
306 aa  250  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0475614  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.94 
 
 
311 aa  250  2e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.679809  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02948  oligopeptide transporter permease  40.38 
 
 
306 aa  248  7e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0465  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.19 
 
 
309 aa  248  9e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000243016  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1090  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.34 
 
 
340 aa  248  9e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0218658  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1301  oligopeptide ABC transporter, permease protein  43.34 
 
 
309 aa  248  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1102  oligopeptide ABC transporter permease  43.34 
 
 
309 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1084  oligopeptide ABC transporter, permease  43.34 
 
 
309 aa  248  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1078  oligopeptide ABC transporter, permease  43.34 
 
 
309 aa  248  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1953  oligopeptide transporter permease  39.43 
 
 
306 aa  248  1e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1192  oligopeptide ABC transporter permease protein  43.34 
 
 
309 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1339  oligopeptide ABC transporter, permease protein  43.34 
 
 
309 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000511987  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1262  oligopeptide ABC transporter, permease protein  43.34 
 
 
309 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1235  oligopeptide ABC transporter, permease protein  43.34 
 
 
309 aa  246  3e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4107  oligopeptide ABC transporter, permease protein  43.34 
 
 
309 aa  246  3e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1986  oligopeptide transporter permease  38.8 
 
 
306 aa  246  4e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.879407  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1931  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease component  39.12 
 
 
305 aa  246  4e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2287  oligopeptide transporter permease  39.12 
 
 
306 aa  245  6e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0289151  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2194  oligopeptide transporter permease  39.75 
 
 
306 aa  245  9.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0464785  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0591  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.25 
 
 
308 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.101579  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0022  alkaline phosphatase  41.32 
 
 
306 aa  243  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0610  oligopeptide transporter permease  39.43 
 
 
306 aa  243  3e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4405  alkaline phosphatase  41.96 
 
 
306 aa  243  3e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2889  alkaline phosphatase  40.06 
 
 
307 aa  242  6e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.51 
 
 
307 aa  240  2e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.43 
 
 
307 aa  239  5e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.591349  normal  0.87569 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1480  ABC oligopeptide transporter, inner membrane subunit OppB  39.43 
 
 
307 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.526899  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4686  alkaline phosphatase  40.06 
 
 
307 aa  237  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0426131  normal  0.374964 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0336  ABC transporter, permease protein  41.19 
 
 
306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0225977  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002960  oligopeptide transport system permease protein OppB  40.47 
 
 
291 aa  233  3e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0149  oligopeptide ABC transporter, permease protein  37.97 
 
 
304 aa  231  1e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.160386  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_931  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  38.98 
 
 
305 aa  231  1e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.541229  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2029  phosphoglycerate mutase 1  38.01 
 
 
311 aa  231  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.664114  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.75 
 
 
311 aa  230  3e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0159834  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.85 
 
 
304 aa  229  6e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.950379  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.38 
 
 
307 aa  227  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0942  nickel-transporting ATPase  38.98 
 
 
305 aa  226  3e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.541988  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2835  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.65 
 
 
307 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.301492 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1004  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.54 
 
 
308 aa  224  1e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.243628  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.54 
 
 
308 aa  224  1e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.46607  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0536  oligopeptide ABC transporter, permease protein  39.75 
 
 
307 aa  224  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178861  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.33 
 
 
307 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal  0.353351 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0466  oligopeptide ABC transporter, permease protein  39.43 
 
 
307 aa  224  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0756  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, inner membrane subunit  35.96 
 
 
312 aa  223  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3600  alkaline phosphatase  39.75 
 
 
307 aa  223  4e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
307 aa  220  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4437  Nickel-transporting ATPase  35.96 
 
 
312 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.856404 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0867  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.49 
 
 
308 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1404  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  40.38 
 
 
307 aa  218  7.999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.756785  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.1 
 
 
307 aa  218  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.366148 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5412  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.83 
 
 
312 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.83 
 
 
312 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2218  oligopeptide ABC transporter, permease protein  37.46 
 
 
312 aa  218  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.19 
 
 
312 aa  218  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0105181 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>