More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0144 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 304 aa  607  9.999999999999999e-173  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.950379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2420  nickel-transporting ATPase  49.17 
 
 		 305 aa  297  2e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.827843  normal  0.256782 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1917  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.89 
 
 		 306 aa  262  4.999999999999999e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000794188  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2029  phosphoglycerate mutase 1  44.88 
 
 		 311 aa  261  8e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.664114  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0759  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.56 
 
 		 306 aa  261  1e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000961636  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02948  oligopeptide transporter permease  42.72 
 
 		 306 aa  255  6e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2287  oligopeptide transporter permease  44.04 
 
 		 306 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0289151  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1986  oligopeptide transporter permease  43.71 
 
 		 306 aa  253  3e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.879407  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.41 
 
 		 308 aa  252  4.0000000000000004e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.203407  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1953  oligopeptide transporter permease  42.72 
 
 		 306 aa  250  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2194  oligopeptide transporter permease  42.05 
 
 		 306 aa  249  4e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0464785  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2700  oligopeptide transporter permease  43.05 
 
 		 306 aa  249  4e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0475614  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2069  oligopeptide transporter permease  43.56 
 
 		 306 aa  249  5e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.186457  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1873  oligopeptide transporter permease  42.38 
 
 		 306 aa  248  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.741835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1582  oligopeptide transporter permease  42.38 
 
 		 306 aa  248  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.733786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1936  oligopeptide transporter permease  42.38 
 
 		 306 aa  248  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.164891 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1400  oligopeptide transporter permease  42.38 
 
 		 306 aa  248  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2162  oligopeptide transporter permease  43.56 
 
 		 306 aa  248  8e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0136059  normal  0.0309495 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1959  oligopeptide transporter permease  43.56 
 
 		 306 aa  248  8e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.162478  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1879  oligopeptide transporter permease  42.38 
 
 		 306 aa  248  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.675854 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1413  oligopeptide transporter permease  42.72 
 
 		 306 aa  248  1e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.933952  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2301  oligopeptide transporter permease  42.38 
 
 		 306 aa  248  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01218  oligopeptide permease ABC transporter membrane protein  42.38 
 
 		 306 aa  246  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.232187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2404  Alkaline phosphatase  42.38 
 
 		 306 aa  246  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000374689  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1353  oligopeptide transporter permease  42.38 
 
 		 306 aa  246  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00072076  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1392  oligopeptide transporter permease  42.38 
 
 		 306 aa  246  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.897764  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2384  oligopeptide transporter permease  42.38 
 
 		 306 aa  246  2e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.423477  hitchhiker  0.00000144694 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1730  oligopeptide transporter permease  42.38 
 
 		 306 aa  246  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  normal  0.0825578 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01228  hypothetical protein  42.38 
 
 		 306 aa  246  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.227767  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1896  oligopeptide transporter permease  42.38 
 
 		 306 aa  246  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.22801  normal  0.152903 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.53 
 
 		 311 aa  246  3e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.679809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0591  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  45.87 
 
 		 308 aa  245  9e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.101579  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0610  oligopeptide transporter permease  40.4 
 
 		 306 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 		 307 aa  243  3e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0547  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39 
 
 		 306 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.472252  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39 
 
 		 306 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000653909  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2965  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.53 
 
 		 307 aa  238  8e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.681707  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002960  oligopeptide transport system permease protein OppB  41.58 
 
 		 291 aa  238  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2835  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.58 
 
 		 307 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.301492 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.25 
 
 		 307 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal  0.353351 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3020  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.67 
 
 		 305 aa  235  5.0000000000000005e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121257  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0465  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 		 309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000243016  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0022  alkaline phosphatase  39.93 
 
 		 306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.19 
 
 		 325 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0063  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.54 
 
 		 324 aa  231  1e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2889  alkaline phosphatase  41.58 
 
 		 307 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4686  alkaline phosphatase  40.13 
 
 		 307 aa  226  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0426131  normal  0.374964 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1480  ABC oligopeptide transporter, inner membrane subunit OppB  40.92 
 
 		 307 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.526899  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4405  alkaline phosphatase  39.27 
 
 		 306 aa  224  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.92 
 
 		 307 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.591349  normal  0.87569 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 		 308 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0942  nickel-transporting ATPase  40.4 
 
 		 305 aa  221  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.541988  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_931  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  40.07 
 
 		 305 aa  220  3e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.541229  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0639  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  36.09 
 
 		 313 aa  219  3.9999999999999997e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0170  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.09 
 
 		 305 aa  219  5e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3600  alkaline phosphatase  41.25 
 
 		 307 aa  219  5e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1996  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38 
 
 		 305 aa  218  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00478237  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0536  oligopeptide ABC transporter, permease protein  41.25 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178861  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0336  ABC transporter, permease protein  42.14 
 
 		 306 aa  216  4e-55  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0225977  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0466  oligopeptide ABC transporter, permease protein  41.25 
 
 		 307 aa  216  5e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.11 
 
 		 307 aa  216  5e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0186  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.29 
 
 		 305 aa  215  7e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0210  oligopeptide ABC transporter, permease protein  38.08 
 
 		 305 aa  215  7e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5114  oligopeptide ABC transporter, permease protein  38.08 
 
 		 305 aa  215  9e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7029  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  38.74 
 
 		 307 aa  214  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.93 
 
 		 307 aa  213  2.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.366148 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4640  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.57 
 
 		 307 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5344  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.57 
 
 		 306 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.046819 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0205  oligopeptide ABC transporter, permease protein  37.42 
 
 		 305 aa  212  7e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0186  oligopeptide ABC transporter permease  37.42 
 
 		 307 aa  212  7e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0229  oligopeptide ABC transporter, permease protein  37.42 
 
 		 305 aa  212  7e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0185  oligopeptide ABC transporter permease protein  37.42 
 
 		 307 aa  212  7e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0205  oligopeptide ABC transporter, permease protein  37.42 
 
 		 307 aa  212  7e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4273  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.24 
 
 		 307 aa  211  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.685752 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.12 
 
 		 335 aa  209  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.81 
 
 		 307 aa  209  5e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0173  oligopeptide ABC transporter, permease  37.09 
 
 		 305 aa  209  5e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00506447  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0176  oligopeptide ABC transporter, permease  36.75 
 
 		 305 aa  208  9e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.67 
 
 		 309 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.33 
 
 		 309 aa  206  4e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.57 
 
 		 307 aa  205  6e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.983667 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.9 
 
 		 306 aa  203  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003658  oligopeptide ABC transporter permease protein  40.98 
 
 		 266 aa  202  8e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1931  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease component  37.62 
 
 		 305 aa  201  9e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1404  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  40.13 
 
 		 307 aa  201  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.756785  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1092  peptide ABC transporter, permease protein, putative  38.73 
 
 		 314 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.76 
 
 		 311 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3781  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.12 
 
 		 306 aa  199  7e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.373556 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2886  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.05 
 
 		 307 aa  198  7e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.89818  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0149  oligopeptide ABC transporter, permease protein  36.75 
 
 		 304 aa  196  4.0000000000000005e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.160386  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1613  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.46 
 
 		 339 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1004  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.77 
 
 		 308 aa  195  9e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.243628  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.77 
 
 		 308 aa  195  9e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.46607  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5256  putative ABC transporter (permease protein)  35.37 
 
 		 313 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.173409  normal  0.132635 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3533  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  40.57 
 
 		 305 aa  194  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3463  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.14 
 
 		 306 aa  192  6e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0952742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2218  oligopeptide ABC transporter, permease protein  38.11 
 
 		 312 aa  192  7e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0352  oligopeptide ABC transporter, permease protein  38.96 
 
 		 312 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0386  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppB  38.96 
 
 		 312 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49589  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1535  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppB  38.96 
 
 		 312 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>