More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0022 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0022  alkaline phosphatase  100 
 
 
306 aa  608  1e-173  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2700  oligopeptide transporter permease  77.12 
 
 
306 aa  483  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0475614  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1400  oligopeptide transporter permease  74.51 
 
 
306 aa  474  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1873  oligopeptide transporter permease  74.51 
 
 
306 aa  474  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.741835  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1936  oligopeptide transporter permease  74.51 
 
 
306 aa  474  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.164891 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1582  oligopeptide transporter permease  74.51 
 
 
306 aa  474  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.733786  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1879  oligopeptide transporter permease  74.18 
 
 
306 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.675854 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2301  oligopeptide transporter permease  74.84 
 
 
306 aa  471  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1953  oligopeptide transporter permease  74.51 
 
 
306 aa  471  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01218  oligopeptide permease ABC transporter membrane protein  74.18 
 
 
306 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.232187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2404  Alkaline phosphatase  74.18 
 
 
306 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000374689  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01228  hypothetical protein  74.18 
 
 
306 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.227767  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1959  oligopeptide transporter permease  74.51 
 
 
306 aa  467  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.162478  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1353  oligopeptide transporter permease  74.18 
 
 
306 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00072076  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1413  oligopeptide transporter permease  73.86 
 
 
306 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.933952  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2194  oligopeptide transporter permease  74.18 
 
 
306 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0464785  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1730  oligopeptide transporter permease  74.18 
 
 
306 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  normal  0.0825578 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2384  oligopeptide transporter permease  74.18 
 
 
306 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.423477  hitchhiker  0.00000144694 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1896  oligopeptide transporter permease  74.18 
 
 
306 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.22801  normal  0.152903 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1392  oligopeptide transporter permease  74.18 
 
 
306 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.897764  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2162  oligopeptide transporter permease  74.51 
 
 
306 aa  467  1.0000000000000001e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0136059  normal  0.0309495 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2287  oligopeptide transporter permease  74.51 
 
 
306 aa  466  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0289151  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2069  oligopeptide transporter permease  74.18 
 
 
306 aa  465  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.186457  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1986  oligopeptide transporter permease  74.18 
 
 
306 aa  466  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.879407  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4405  alkaline phosphatase  64.38 
 
 
306 aa  407  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0610  oligopeptide transporter permease  64.05 
 
 
306 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02948  oligopeptide transporter permease  63.4 
 
 
306 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002960  oligopeptide transport system permease protein OppB  62.89 
 
 
291 aa  382  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4686  alkaline phosphatase  53.27 
 
 
307 aa  351  7e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0426131  normal  0.374964 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.88 
 
 
308 aa  351  8.999999999999999e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.203407  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7029  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  53.42 
 
 
307 aa  337  9.999999999999999e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1480  ABC oligopeptide transporter, inner membrane subunit OppB  50 
 
 
307 aa  335  5e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.526899  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
307 aa  335  7e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.591349  normal  0.87569 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.75 
 
 
307 aa  333  3e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.366148 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2889  alkaline phosphatase  49.67 
 
 
307 aa  333  3e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.92 
 
 
307 aa  332  4e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1404  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  54.58 
 
 
307 aa  330  1e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.756785  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4437  Nickel-transporting ATPase  49.36 
 
 
312 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.856404 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0756  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, inner membrane subunit  49.36 
 
 
312 aa  326  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2218  oligopeptide ABC transporter, permease protein  49.36 
 
 
312 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1252  oligopeptide ABC transporter, permease protein  49.36 
 
 
312 aa  324  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2902  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppB  49.36 
 
 
312 aa  324  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0918369  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3018  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppB  49.36 
 
 
312 aa  324  1e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0352  oligopeptide ABC transporter, permease protein  49.36 
 
 
312 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1725  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppB  49.36 
 
 
312 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0386  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppB  49.36 
 
 
312 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49589  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1535  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppB  49.36 
 
 
312 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2420  nickel-transporting ATPase  48.69 
 
 
305 aa  320  1.9999999999999998e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.827843  normal  0.256782 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.72 
 
 
312 aa  318  9e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0105181 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4731  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.04 
 
 
312 aa  318  9e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.04 
 
 
312 aa  318  9e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.04 
 
 
312 aa  318  9e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0116  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  48.4 
 
 
312 aa  316  3e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4504  alkaline phosphatase  48.08 
 
 
312 aa  315  5e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.293278 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5412  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.72 
 
 
312 aa  315  5e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.72 
 
 
312 aa  315  5e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.16 
 
 
307 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal  0.353351 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3600  alkaline phosphatase  49.35 
 
 
307 aa  311  5.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0536  oligopeptide ABC transporter, permease protein  49.67 
 
 
307 aa  311  6.999999999999999e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178861  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0466  oligopeptide ABC transporter, permease protein  49.35 
 
 
307 aa  311  9e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2835  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.51 
 
 
307 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.301492 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2029  phosphoglycerate mutase 1  47.39 
 
 
311 aa  305  7e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.664114  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0591  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  51.48 
 
 
308 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.101579  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003658  oligopeptide ABC transporter permease protein  52.87 
 
 
266 aa  294  1e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.9 
 
 
311 aa  289  4e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.679809  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.67 
 
 
306 aa  286  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4273  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.49 
 
 
307 aa  286  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.685752 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2886  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.52 
 
 
307 aa  285  7e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.89818  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5344  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.54 
 
 
306 aa  285  8e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.046819 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4640  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.49 
 
 
307 aa  285  9e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3463  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.06 
 
 
306 aa  280  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0952742  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.34 
 
 
313 aa  276  3e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.636778 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1327  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.14 
 
 
305 aa  276  3e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1570  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.14 
 
 
305 aa  276  3e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.721041  normal  0.0225106 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.18 
 
 
307 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.983667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3781  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.21 
 
 
306 aa  265  5.999999999999999e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.373556 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.26 
 
 
308 aa  263  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.46607  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1004  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.26 
 
 
308 aa  263  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.243628  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0336  ABC transporter, permease protein  43.79 
 
 
306 aa  262  6e-69  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0225977  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0759  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.98 
 
 
306 aa  260  2e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000961636  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0942  nickel-transporting ATPase  43.14 
 
 
305 aa  259  4e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.541988  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.95 
 
 
307 aa  259  4e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.61 
 
 
306 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000653909  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0547  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.61 
 
 
306 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.472252  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_931  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  42.81 
 
 
305 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.541229  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.26 
 
 
307 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3020  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.64 
 
 
305 aa  252  7e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121257  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2965  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.62 
 
 
307 aa  249  3e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.681707  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1917  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.64 
 
 
306 aa  246  2e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000794188  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.31 
 
 
309 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.81 
 
 
321 aa  246  4.9999999999999997e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1078  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.12 
 
 
320 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0170  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.73 
 
 
305 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.72 
 
 
308 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.32 
 
 
325 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0570  oligopeptide ABC transporter, permease protein  43.93 
 
 
308 aa  242  5e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0186  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.06 
 
 
305 aa  242  6e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1996  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.67 
 
 
305 aa  241  1e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00478237  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1620  peptide ABC transporter, permease protein  40.62 
 
 
321 aa  241  1e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.911317 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1613  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.98 
 
 
339 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>