More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2965 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2965  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 307 aa  605  9.999999999999999e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.681707  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  77.7 
 
 		 307 aa  478  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0759  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.67 
 
 		 306 aa  374  1e-102  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000961636  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3020  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.44 
 
 		 305 aa  338  7e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121257  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1917  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.43 
 
 		 306 aa  324  9e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000794188  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1996  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.63 
 
 		 305 aa  317  2e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00478237  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.65 
 
 		 306 aa  311  1e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000653909  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0547  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.65 
 
 		 306 aa  311  1e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.472252  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0465  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.7 
 
 		 309 aa  308  5e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000243016  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.21 
 
 		 308 aa  289  3e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.28 
 
 		 307 aa  285  7e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0170  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.69 
 
 		 305 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2420  nickel-transporting ATPase  46.71 
 
 		 305 aa  282  6.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.827843  normal  0.256782 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0063  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.65 
 
 		 324 aa  280  2e-74  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0186  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.7 
 
 		 305 aa  280  2e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1931  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease component  43.93 
 
 		 305 aa  276  2e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0176  oligopeptide ABC transporter, permease  46.36 
 
 		 305 aa  275  6e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0173  oligopeptide ABC transporter, permease  46.03 
 
 		 305 aa  275  8e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00506447  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0186  oligopeptide ABC transporter permease  46.23 
 
 		 307 aa  275  9e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0185  oligopeptide ABC transporter permease protein  46.23 
 
 		 307 aa  275  9e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0205  oligopeptide ABC transporter, permease protein  46.23 
 
 		 307 aa  275  9e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0205  oligopeptide ABC transporter, permease protein  46.36 
 
 		 305 aa  273  3e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0229  oligopeptide ABC transporter, permease protein  46.36 
 
 		 305 aa  273  3e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0210  oligopeptide ABC transporter, permease protein  46.03 
 
 		 305 aa  273  3e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5114  oligopeptide ABC transporter, permease protein  46.03 
 
 		 305 aa  271  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.83 
 
 		 325 aa  270  2e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.54 
 
 		 308 aa  270  2e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.203407  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02948  oligopeptide transporter permease  44.26 
 
 		 306 aa  270  2.9999999999999997e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0942  nickel-transporting ATPase  44.08 
 
 		 305 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.541988  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_931  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  44.41 
 
 		 305 aa  267  1e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.541229  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0610  oligopeptide transporter permease  43.93 
 
 		 306 aa  267  2e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0149  oligopeptide ABC transporter, permease protein  43.61 
 
 		 304 aa  264  2e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.160386  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.12 
 
 		 309 aa  261  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0022  alkaline phosphatase  42.62 
 
 		 306 aa  261  1e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1613  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.44 
 
 		 339 aa  260  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1953  oligopeptide transporter permease  42.62 
 
 		 306 aa  258  1e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1582  oligopeptide transporter permease  43.28 
 
 		 306 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.733786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1400  oligopeptide transporter permease  43.28 
 
 		 306 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1873  oligopeptide transporter permease  43.28 
 
 		 306 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.741835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1879  oligopeptide transporter permease  43.28 
 
 		 306 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.675854 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1936  oligopeptide transporter permease  43.28 
 
 		 306 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.164891 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1413  oligopeptide transporter permease  42.95 
 
 		 306 aa  256  3e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.933952  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.53 
 
 		 311 aa  256  3e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.679809  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01218  oligopeptide permease ABC transporter membrane protein  42.62 
 
 		 306 aa  256  4e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.232187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2404  Alkaline phosphatase  42.62 
 
 		 306 aa  256  4e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000374689  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1353  oligopeptide transporter permease  42.62 
 
 		 306 aa  256  4e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00072076  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1392  oligopeptide transporter permease  42.62 
 
 		 306 aa  256  4e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.897764  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1986  oligopeptide transporter permease  41.64 
 
 		 306 aa  256  4e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.879407  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1896  oligopeptide transporter permease  42.62 
 
 		 306 aa  256  4e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.22801  normal  0.152903 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2384  oligopeptide transporter permease  42.62 
 
 		 306 aa  256  4e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.423477  hitchhiker  0.00000144694 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01228  hypothetical protein  42.62 
 
 		 306 aa  256  4e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.227767  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1730  oligopeptide transporter permease  42.62 
 
 		 306 aa  256  4e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  normal  0.0825578 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.12 
 
 		 309 aa  255  8e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2194  oligopeptide transporter permease  41.31 
 
 		 306 aa  255  8e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0464785  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.95 
 
 		 311 aa  254  9e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0159834  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1959  oligopeptide transporter permease  42.62 
 
 		 306 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.162478  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2162  oligopeptide transporter permease  42.62 
 
 		 306 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0136059  normal  0.0309495 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0591  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.21 
 
 		 308 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.101579  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2287  oligopeptide transporter permease  41.31 
 
 		 306 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0289151  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2069  oligopeptide transporter permease  42.62 
 
 		 306 aa  253  4.0000000000000004e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.186457  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2700  oligopeptide transporter permease  41.31 
 
 		 306 aa  252  5.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0475614  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002960  oligopeptide transport system permease protein OppB  44.44 
 
 		 291 aa  252  7e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2301  oligopeptide transporter permease  41.64 
 
 		 306 aa  251  1e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.62 
 
 		 308 aa  246  4.9999999999999997e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.46607  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1004  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.62 
 
 		 308 aa  246  4.9999999999999997e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.243628  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0639  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  43.83 
 
 		 313 aa  244  1.9999999999999999e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2835  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.66 
 
 		 307 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.301492 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 		 307 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal  0.353351 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.53 
 
 		 304 aa  240  2e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.950379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0391  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  45.25 
 
 		 303 aa  238  6.999999999999999e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.920936  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.5 
 
 		 307 aa  237  2e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.366148 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.34 
 
 		 335 aa  234  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2029  phosphoglycerate mutase 1  37.83 
 
 		 311 aa  233  4.0000000000000004e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.664114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0867  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.5 
 
 		 308 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0570  oligopeptide ABC transporter, permease protein  42.95 
 
 		 308 aa  232  5e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.81 
 
 		 307 aa  233  5e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4405  alkaline phosphatase  40.66 
 
 		 306 aa  232  7.000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4686  alkaline phosphatase  40 
 
 		 307 aa  232  7.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0426131  normal  0.374964 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.09 
 
 		 307 aa  231  9e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.298513  hitchhiker  0.00733729 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1090  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.46 
 
 		 340 aa  230  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0218658  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3600  alkaline phosphatase  40.98 
 
 		 307 aa  230  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1301  oligopeptide ABC transporter, permease protein  43.46 
 
 		 309 aa  230  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1102  oligopeptide ABC transporter permease  43.46 
 
 		 309 aa  230  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1339  oligopeptide ABC transporter, permease protein  43.46 
 
 		 309 aa  230  3e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000511987  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1084  oligopeptide ABC transporter, permease  43.46 
 
 		 309 aa  230  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1078  oligopeptide ABC transporter, permease  43.46 
 
 		 309 aa  230  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1192  oligopeptide ABC transporter permease protein  43.46 
 
 		 309 aa  230  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1262  oligopeptide ABC transporter, permease protein  43.46 
 
 		 309 aa  230  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0536  oligopeptide ABC transporter, permease protein  40.98 
 
 		 307 aa  229  5e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178861  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0466  oligopeptide ABC transporter, permease protein  40.98 
 
 		 307 aa  228  7e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1404  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  40 
 
 		 307 aa  228  9e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.756785  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2889  alkaline phosphatase  39.02 
 
 		 307 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1480  ABC oligopeptide transporter, inner membrane subunit OppB  38.69 
 
 		 307 aa  226  3e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.526899  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.69 
 
 		 307 aa  226  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.591349  normal  0.87569 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1235  oligopeptide ABC transporter, permease protein  42.81 
 
 		 309 aa  226  4e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4107  oligopeptide ABC transporter, permease protein  42.81 
 
 		 309 aa  226  4e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0472  peptide ABC transporter, permease protein  40.2 
 
 		 314 aa  225  9e-58  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.132809  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7029  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  42.35 
 
 		 307 aa  225  9e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1766  peptide ABC transporter, permease protein  38.63 
 
 		 321 aa  223  3e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.07 
 
 		 321 aa  222  4.9999999999999996e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>