More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1996 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1996  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 305 aa  615  1e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00478237  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3020  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.8 
 
 		 305 aa  450  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121257  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1917  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.41 
 
 		 306 aa  335  7e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000794188  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0759  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.48 
 
 		 306 aa  322  7e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000961636  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0465  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.96 
 
 		 309 aa  317  1e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000243016  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.84 
 
 		 307 aa  311  9e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2965  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.63 
 
 		 307 aa  306  3e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.681707  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0063  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.78 
 
 		 324 aa  288  6e-77  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_931  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  46.53 
 
 		 305 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.541229  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0942  nickel-transporting ATPase  45.87 
 
 		 305 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.541988  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.62 
 
 		 325 aa  277  1e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.41 
 
 		 308 aa  276  4e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0170  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.05 
 
 		 305 aa  275  5e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0547  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.59 
 
 		 306 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.472252  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.59 
 
 		 306 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000653909  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2420  nickel-transporting ATPase  44.92 
 
 		 305 aa  273  3e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.827843  normal  0.256782 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0186  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.05 
 
 		 305 aa  271  1e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.18 
 
 		 307 aa  268  1e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0205  oligopeptide ABC transporter, permease protein  42.95 
 
 		 307 aa  264  1e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0205  oligopeptide ABC transporter, permease protein  43.05 
 
 		 305 aa  264  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0186  oligopeptide ABC transporter permease  42.95 
 
 		 307 aa  264  1e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0185  oligopeptide ABC transporter permease protein  42.95 
 
 		 307 aa  264  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0229  oligopeptide ABC transporter, permease protein  43.05 
 
 		 305 aa  264  1e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0173  oligopeptide ABC transporter, permease  42.52 
 
 		 305 aa  262  4e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00506447  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0176  oligopeptide ABC transporter, permease  42.52 
 
 		 305 aa  262  6e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0210  oligopeptide ABC transporter, permease protein  42.72 
 
 		 305 aa  261  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5114  oligopeptide ABC transporter, permease protein  42.38 
 
 		 305 aa  258  6e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0639  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  44.16 
 
 		 313 aa  258  9e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.21 
 
 		 308 aa  255  7e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.203407  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1873  oligopeptide transporter permease  39.67 
 
 		 306 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.741835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1936  oligopeptide transporter permease  39.67 
 
 		 306 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.164891 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1582  oligopeptide transporter permease  39.67 
 
 		 306 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.733786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1400  oligopeptide transporter permease  39.67 
 
 		 306 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1879  oligopeptide transporter permease  39.34 
 
 		 306 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.675854 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1931  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease component  40.52 
 
 		 305 aa  246  3e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0610  oligopeptide transporter permease  40 
 
 		 306 aa  246  4e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02948  oligopeptide transporter permease  40.66 
 
 		 306 aa  246  4e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.58 
 
 		 311 aa  245  6.999999999999999e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.679809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4437  Nickel-transporting ATPase  39.23 
 
 		 312 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.856404 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1480  ABC oligopeptide transporter, inner membrane subunit OppB  40.98 
 
 		 307 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.526899  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0756  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, inner membrane subunit  38.91 
 
 		 312 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.67 
 
 		 309 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.98 
 
 		 307 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.591349  normal  0.87569 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2889  alkaline phosphatase  40.98 
 
 		 307 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1413  oligopeptide transporter permease  38.69 
 
 		 306 aa  242  5e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.933952  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01218  oligopeptide permease ABC transporter membrane protein  38.36 
 
 		 306 aa  241  7e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.232187  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2384  oligopeptide transporter permease  38.36 
 
 		 306 aa  241  7e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.423477  hitchhiker  0.00000144694 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2404  Alkaline phosphatase  38.36 
 
 		 306 aa  241  7e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000374689  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1392  oligopeptide transporter permease  38.36 
 
 		 306 aa  241  7e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.897764  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1353  oligopeptide transporter permease  38.36 
 
 		 306 aa  241  7e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00072076  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01228  hypothetical protein  38.36 
 
 		 306 aa  241  7e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.227767  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1730  oligopeptide transporter permease  38.36 
 
 		 306 aa  241  7e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  normal  0.0825578 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1896  oligopeptide transporter permease  38.36 
 
 		 306 aa  241  7e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.22801  normal  0.152903 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7029  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  43.46 
 
 		 307 aa  241  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0022  alkaline phosphatase  39.67 
 
 		 306 aa  241  1e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1613  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 		 339 aa  240  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2301  oligopeptide transporter permease  37.38 
 
 		 306 aa  239  2.9999999999999997e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4504  alkaline phosphatase  38.26 
 
 		 312 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.293278 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1959  oligopeptide transporter permease  38.03 
 
 		 306 aa  238  9e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.162478  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2162  oligopeptide transporter permease  38.03 
 
 		 306 aa  238  9e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0136059  normal  0.0309495 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2218  oligopeptide ABC transporter, permease protein  39.23 
 
 		 312 aa  238  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2700  oligopeptide transporter permease  37.7 
 
 		 306 aa  237  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0475614  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002960  oligopeptide transport system permease protein OppB  40.7 
 
 		 291 aa  237  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2069  oligopeptide transporter permease  38.03 
 
 		 306 aa  237  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.186457  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.95 
 
 		 307 aa  236  4e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.33 
 
 		 309 aa  235  5.0000000000000005e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5412  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.23 
 
 		 312 aa  235  6e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0149  oligopeptide ABC transporter, permease protein  39.02 
 
 		 304 aa  235  6e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.160386  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.23 
 
 		 312 aa  235  6e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1252  oligopeptide ABC transporter, permease protein  38.91 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0116  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  38.59 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3018  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppB  38.91 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2902  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppB  38.91 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0918369  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.21 
 
 		 311 aa  233  3e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4686  alkaline phosphatase  40.98 
 
 		 307 aa  233  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0426131  normal  0.374964 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4405  alkaline phosphatase  40.33 
 
 		 306 aa  233  4.0000000000000004e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2287  oligopeptide transporter permease  37.38 
 
 		 306 aa  232  6e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0289151  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2194  oligopeptide transporter permease  37.38 
 
 		 306 aa  232  6e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0464785  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0352  oligopeptide ABC transporter, permease protein  38.59 
 
 		 312 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1986  oligopeptide transporter permease  37.38 
 
 		 306 aa  232  7.000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.879407  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1535  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppB  38.59 
 
 		 312 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1725  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppB  38.59 
 
 		 312 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0386  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppB  38.59 
 
 		 312 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49589  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.26 
 
 		 312 aa  231  9e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0105181 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1404  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  41.97 
 
 		 307 aa  231  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.756785  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1953  oligopeptide transporter permease  37.05 
 
 		 306 aa  231  1e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4731  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.26 
 
 		 312 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.26 
 
 		 312 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.26 
 
 		 312 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0591  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.69 
 
 		 308 aa  231  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.101579  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2029  phosphoglycerate mutase 1  40.46 
 
 		 311 aa  230  3e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.664114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.51 
 
 		 335 aa  229  4e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0466  oligopeptide ABC transporter, permease protein  40 
 
 		 307 aa  229  5e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.4 
 
 		 311 aa  229  6e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0159834  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0536  oligopeptide ABC transporter, permease protein  40 
 
 		 307 aa  228  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178861  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3600  alkaline phosphatase  39.67 
 
 		 307 aa  228  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.51 
 
 		 321 aa  226  4e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2554  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  39.75 
 
 		 321 aa  226  5.0000000000000005e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.14 
 
 		 320 aa  225  9e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2835  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 		 307 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.301492 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>