More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1613 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1613  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
339 aa  683    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  88.03 
 
 
309 aa  558  1e-158  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.87 
 
 
309 aa  475  1e-133  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4107  oligopeptide ABC transporter, permease protein  72.82 
 
 
309 aa  457  1e-127  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1235  oligopeptide ABC transporter, permease protein  72.49 
 
 
309 aa  456  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1339  oligopeptide ABC transporter, permease protein  71.84 
 
 
309 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000511987  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1262  oligopeptide ABC transporter, permease protein  71.84 
 
 
309 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1301  oligopeptide ABC transporter, permease protein  71.84 
 
 
309 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1102  oligopeptide ABC transporter permease  71.84 
 
 
309 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1084  oligopeptide ABC transporter, permease  71.84 
 
 
309 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1078  oligopeptide ABC transporter, permease  71.84 
 
 
309 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1192  oligopeptide ABC transporter permease protein  71.84 
 
 
309 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1090  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.35 
 
 
340 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0218658  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.58 
 
 
308 aa  381  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.46607  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1004  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.58 
 
 
308 aa  381  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.243628  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.39 
 
 
311 aa  363  2e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0159834  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0570  oligopeptide ABC transporter, permease protein  56.96 
 
 
308 aa  357  1.9999999999999998e-97  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0867  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.34 
 
 
308 aa  332  6e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0547  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.61 
 
 
306 aa  330  2e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.472252  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.61 
 
 
306 aa  330  2e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000653909  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0149  oligopeptide ABC transporter, permease protein  48.68 
 
 
304 aa  303  3.0000000000000004e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.160386  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1931  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease component  48.52 
 
 
305 aa  300  2e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.68 
 
 
308 aa  295  8e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0170  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.68 
 
 
305 aa  288  8e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0639  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  47.06 
 
 
313 aa  287  1e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0186  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.02 
 
 
305 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0391  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  47.69 
 
 
303 aa  284  1.0000000000000001e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.920936  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0205  oligopeptide ABC transporter, permease protein  47.54 
 
 
307 aa  279  6e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0186  oligopeptide ABC transporter permease  47.54 
 
 
307 aa  279  6e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0185  oligopeptide ABC transporter permease protein  47.54 
 
 
307 aa  279  6e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0210  oligopeptide ABC transporter, permease protein  48.01 
 
 
305 aa  276  3e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5114  oligopeptide ABC transporter, permease protein  47.68 
 
 
305 aa  276  4e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0176  oligopeptide ABC transporter, permease  47.35 
 
 
305 aa  276  5e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0173  oligopeptide ABC transporter, permease  47.02 
 
 
305 aa  275  6e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00506447  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0205  oligopeptide ABC transporter, permease protein  47.35 
 
 
305 aa  275  8e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0229  oligopeptide ABC transporter, permease protein  47.35 
 
 
305 aa  275  8e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.42 
 
 
307 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1917  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.54 
 
 
306 aa  268  8e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000794188  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.53 
 
 
325 aa  268  1e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0759  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.75 
 
 
306 aa  263  4e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000961636  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1959  oligopeptide transporter permease  44.59 
 
 
306 aa  256  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.162478  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2162  oligopeptide transporter permease  44.59 
 
 
306 aa  256  3e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0136059  normal  0.0309495 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2965  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.44 
 
 
307 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.681707  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2069  oligopeptide transporter permease  44.59 
 
 
306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.186457  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0942  nickel-transporting ATPase  42.24 
 
 
305 aa  253  3e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.541988  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_931  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  41.91 
 
 
305 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.541229  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0842  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  44.41 
 
 
297 aa  252  5.000000000000001e-66  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00690225  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0610  oligopeptide transporter permease  41.31 
 
 
306 aa  253  5.000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.25 
 
 
308 aa  252  7e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.203407  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0063  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.5 
 
 
324 aa  252  8.000000000000001e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2301  oligopeptide transporter permease  41.97 
 
 
306 aa  250  3e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1873  oligopeptide transporter permease  42.95 
 
 
306 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.741835  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1582  oligopeptide transporter permease  42.95 
 
 
306 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.733786  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1400  oligopeptide transporter permease  42.95 
 
 
306 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1936  oligopeptide transporter permease  42.95 
 
 
306 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.164891 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1879  oligopeptide transporter permease  42.95 
 
 
306 aa  248  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.675854 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01218  oligopeptide permease ABC transporter membrane protein  42.62 
 
 
306 aa  248  1e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.232187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2404  Alkaline phosphatase  42.62 
 
 
306 aa  248  1e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000374689  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1353  oligopeptide transporter permease  42.62 
 
 
306 aa  248  1e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00072076  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1896  oligopeptide transporter permease  42.62 
 
 
306 aa  248  1e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.22801  normal  0.152903 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1986  oligopeptide transporter permease  42.62 
 
 
306 aa  248  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.879407  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01228  hypothetical protein  42.62 
 
 
306 aa  248  1e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.227767  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1392  oligopeptide transporter permease  42.62 
 
 
306 aa  248  1e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.897764  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02948  oligopeptide transporter permease  41.97 
 
 
306 aa  248  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2384  oligopeptide transporter permease  42.62 
 
 
306 aa  248  1e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.423477  hitchhiker  0.00000144694 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1730  oligopeptide transporter permease  42.62 
 
 
306 aa  248  1e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  normal  0.0825578 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2287  oligopeptide transporter permease  42.3 
 
 
306 aa  247  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0289151  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1953  oligopeptide transporter permease  43.93 
 
 
306 aa  247  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1413  oligopeptide transporter permease  42.62 
 
 
306 aa  247  2e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.933952  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3020  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.45 
 
 
305 aa  246  3e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121257  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2194  oligopeptide transporter permease  42.62 
 
 
306 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0464785  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.3 
 
 
307 aa  243  3e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2700  oligopeptide transporter permease  41.97 
 
 
306 aa  242  7.999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0475614  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0022  alkaline phosphatase  40.98 
 
 
306 aa  241  2e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.98 
 
 
306 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14841  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2420  nickel-transporting ATPase  39.6 
 
 
305 aa  241  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.827843  normal  0.256782 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1996  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
305 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00478237  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0465  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.81 
 
 
309 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000243016  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002960  oligopeptide transport system permease protein OppB  41.72 
 
 
291 aa  238  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.52 
 
 
307 aa  236  3e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1381  transmembrane ABC transporter protein  40.07 
 
 
307 aa  235  7e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.796345  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.65 
 
 
311 aa  235  7e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.52 
 
 
307 aa  235  8e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.298513  hitchhiker  0.00733729 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0951  glutathione ABC transporter permease  40 
 
 
306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.258662  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0980  glutathione ABC transporter permease  40 
 
 
306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1001  glutathione ABC transporter permease  40 
 
 
306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0891  glutathione ABC transporter, permease protein  40 
 
 
306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.976092  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2889  alkaline phosphatase  39.34 
 
 
307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0918  inner membrane ABC transporter permease protein YddR  40 
 
 
306 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3004  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.67 
 
 
306 aa  232  6e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00798  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  40.39 
 
 
306 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.39 
 
 
306 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00815  hypothetical protein  40.39 
 
 
306 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.558182  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0856  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  40.39 
 
 
306 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0902  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  40.39 
 
 
306 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0889  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  40.39 
 
 
306 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.952014  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.39 
 
 
306 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.34 
 
 
307 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.591349  normal  0.87569 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1480  ABC oligopeptide transporter, inner membrane subunit OppB  39.34 
 
 
307 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.526899  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0982  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  40.39 
 
 
306 aa  231  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>