More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1059 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1059  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
400 aa  791    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.543295  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  94.49 
 
 
400 aa  760    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71017  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2363  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.75 
 
 
397 aa  531  1e-150  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.476785  normal  0.026678 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3500  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.85 
 
 
355 aa  297  2e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0791674  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.33 
 
 
331 aa  233  5e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5300  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  43.89 
 
 
316 aa  209  7e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340844  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0997  oligopeptide ABC transporter, permease protein  42.21 
 
 
316 aa  202  9e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.28482e-62 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0808  oligopeptide ABC transporter, permease  41.83 
 
 
316 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282065  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1001  oligopeptide ABC transporter, permease protein  42.21 
 
 
316 aa  201  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0823  oligopeptide ABC transporter, permease  41.83 
 
 
316 aa  201  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.164685  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.55 
 
 
321 aa  199  7e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.83 
 
 
316 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00583871  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0859  oligopeptide ABC transporter permease  41.83 
 
 
316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0909  oligopeptide ABC transporter permease protein  41.83 
 
 
316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0836804  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2257  oligopeptide ABC transporter, permease component  38.39 
 
 
321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4385  oligopeptide ABC transporter, permease protein  40.68 
 
 
316 aa  197  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.02052e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0946  oligopeptide ABC transporter, permease protein  40.68 
 
 
316 aa  197  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2554  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  38.39 
 
 
321 aa  197  3e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0873  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.57 
 
 
320 aa  192  6e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0307537  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.75 
 
 
322 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.66 
 
 
332 aa  190  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.739242 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.12 
 
 
335 aa  190  5e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.238126  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3876  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  41.8 
 
 
336 aa  189  5.999999999999999e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0004  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.01 
 
 
320 aa  189  8e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.101832  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5079  oligopeptide ABC transporter, permease protein  39.53 
 
 
318 aa  187  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823719  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4598  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.19 
 
 
319 aa  187  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.930375  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0384  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.41 
 
 
319 aa  187  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.512992 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.41 
 
 
319 aa  187  3e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.28 
 
 
321 aa  187  4e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0246  oligopeptide ABC transporter, permease protein  39.53 
 
 
307 aa  187  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0542782  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.84 
 
 
321 aa  186  5e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0206  oligopeptide ABC transporter, permease  39.15 
 
 
318 aa  186  6e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1411  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.11 
 
 
319 aa  186  8e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0714  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.16 
 
 
335 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299286  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.4 
 
 
336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000111157 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0267  oligopeptide ABC transporter, permease protein  39.53 
 
 
318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3297  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.09 
 
 
335 aa  184  3e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.204315  normal  0.181035 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.31 
 
 
318 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
321 aa  182  8.000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.58 
 
 
320 aa  182  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.766968 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.58 
 
 
320 aa  182  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6954  oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  40.77 
 
 
319 aa  182  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.37 
 
 
334 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.31 
 
 
319 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1355  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.75 
 
 
319 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1620  peptide ABC transporter, permease protein  37.24 
 
 
321 aa  181  2e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.911317 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.92 
 
 
322 aa  181  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.205475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4779  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.93 
 
 
319 aa  181  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000244558 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.76 
 
 
318 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0131  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.25 
 
 
326 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1142  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.23 
 
 
315 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.301395  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4337  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
319 aa  180  4e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.692549  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.98 
 
 
319 aa  180  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2849  ABC transporter permease protein  40.46 
 
 
313 aa  180  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.585703  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2593  oligopeptide ABC transporter, permease protein  41.86 
 
 
343 aa  179  9e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.45 
 
 
326 aa  178  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.75386 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39 
 
 
333 aa  179  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391976  normal  0.26803 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0219  oligopeptide ABC transporter permease  40 
 
 
307 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0242  oligopeptide ABC transporter, permease protein  40 
 
 
307 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1766  peptide ABC transporter, permease protein  38.64 
 
 
321 aa  177  2e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.42 
 
 
331 aa  178  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00166089  hitchhiker  0.0087818 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0249  oligopeptide ABC transporter, permease protein  40 
 
 
318 aa  177  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0210  oligopeptide ABC transporter, permease  40 
 
 
318 aa  177  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0232  oligopeptide ABC transporter permease protein  40 
 
 
318 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1434  peptide ABC transporter, permease protein  38.22 
 
 
326 aa  176  5e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393954  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.86 
 
 
308 aa  176  5e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311261  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  38.43 
 
 
336 aa  176  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.67 
 
 
326 aa  176  5e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.52 
 
 
324 aa  176  6e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0183  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  38.43 
 
 
336 aa  176  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.86 
 
 
321 aa  175  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0692911 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  39.26 
 
 
337 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4683  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.24 
 
 
305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2469  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.92 
 
 
345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1444  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.41 
 
 
314 aa  175  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.935308  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.6 
 
 
319 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.540957  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0920  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.47 
 
 
343 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.416644 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.98 
 
 
334 aa  173  5e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0185  dipeptide transporter permease DppB  38.52 
 
 
339 aa  173  5e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.446355  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.92 
 
 
328 aa  172  6.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00108438  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0066  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.03 
 
 
334 aa  172  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1214  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.16 
 
 
344 aa  171  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.67 
 
 
325 aa  171  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  36.86 
 
 
339 aa  171  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  38.81 
 
 
336 aa  171  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4097  dipeptide transporter permease DppB  36.86 
 
 
339 aa  171  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3964  hypothetical protein  39.78 
 
 
335 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.1929 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.69 
 
 
326 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.109225  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
336 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
336 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  38.43 
 
 
336 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3841  dipeptide transporter permease DppB  37.78 
 
 
339 aa  170  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3905  dipeptide transporter permease DppB  37.78 
 
 
339 aa  170  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4009  dipeptide transporter permease DppB  37.78 
 
 
339 aa  170  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3827  dipeptide transporter permease DppB  37.78 
 
 
339 aa  170  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7557  putative dipeptide ABC transporter (permease protein)  39.41 
 
 
323 aa  170  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3949  dipeptide transporter permease DppB  37.78 
 
 
339 aa  170  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0408  peptide ABC transporter, permease protein  40.15 
 
 
319 aa  170  5e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.599742  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3232  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  39.62 
 
 
335 aa  170  5e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.624237  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.62 
 
 
335 aa  170  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>