More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7099 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7099  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 327 aa  648    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1951  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.9 
 
 		 325 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.497916  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.67 
 
 		 328 aa  375  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.52 
 
 		 326 aa  350  2e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.501197  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3928  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.37 
 
 		 325 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4002  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.37 
 
 		 325 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3943  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.37 
 
 		 325 aa  332  4e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.104136 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.53 
 
 		 325 aa  320  3e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.161114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.45 
 
 		 325 aa  317  1e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.982552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3278  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.73 
 
 		 325 aa  309  2.9999999999999997e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000912922  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11309  oligopeptide-transport integral membrane protein ABC transporter oppB  53.37 
 
 		 325 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.65 
 
 		 327 aa  290  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0817  ABC peptide/nickel transport system permease protein  49.04 
 
 		 336 aa  286  4e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08480  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  41.43 
 
 		 344 aa  257  2e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.9 
 
 		 327 aa  249  3e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0920  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.77 
 
 		 330 aa  223  3e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.311537 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1254  ABC transporter, permease protein  37.39 
 
 		 327 aa  223  4e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000126232 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1117  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.43 
 
 		 327 aa  217  2e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.559973  normal  0.0105879 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.87 
 
 		 327 aa  202  8e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.95 
 
 		 328 aa  199  7e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7778  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.08 
 
 		 322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.413078 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.42 
 
 		 332 aa  193  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1632  putative ABC transporter permease  37.2 
 
 		 336 aa  187  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214794  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31130  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  34.52 
 
 		 338 aa  187  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4534  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.93 
 
 		 336 aa  186  5e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.463935 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0873  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.5 
 
 		 320 aa  172  6.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0307537  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1834  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.91 
 
 		 326 aa  169  5e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.54 
 
 		 319 aa  164  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.63 
 
 		 331 aa  157  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1434  peptide ABC transporter, permease protein  33.24 
 
 		 326 aa  153  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393954  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2854  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.9 
 
 		 308 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.87491 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5079  oligopeptide ABC transporter, permease protein  31.21 
 
 		 318 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.12 
 
 		 318 aa  151  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0408  peptide ABC transporter, permease protein  33.53 
 
 		 319 aa  149  6e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.599742  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0206  oligopeptide ABC transporter, permease  30.91 
 
 		 318 aa  149  6e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2257  oligopeptide ABC transporter, permease component  34.46 
 
 		 321 aa  149  8e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3500  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.69 
 
 		 355 aa  148  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0791674  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.21 
 
 		 321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0692911 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0351  peptide ABC transporter, permease protein  33.53 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0246  oligopeptide ABC transporter, permease protein  31.86 
 
 		 307 aa  147  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0542782  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.39 
 
 		 309 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.93 
 
 		 318 aa  147  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.823001  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2554  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  34.46 
 
 		 321 aa  147  3e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0267  oligopeptide ABC transporter, permease protein  30.3 
 
 		 318 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4291  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.47 
 
 		 338 aa  146  5e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.09 
 
 		 319 aa  145  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.981811  normal  0.0447006 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.91 
 
 		 318 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8933  ABC transporter permease protein  33.33 
 
 		 307 aa  145  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.63 
 
 		 312 aa  145  9e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0131  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.57 
 
 		 326 aa  145  9e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0139  dipeptide transporter permease DppB  33.92 
 
 		 351 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0249  oligopeptide ABC transporter, permease protein  29.48 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0210  oligopeptide ABC transporter, permease  29.48 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0232  oligopeptide ABC transporter permease protein  29.48 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.45 
 
 		 324 aa  144  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1075  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.5 
 
 		 302 aa  144  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.473932  normal  0.177469 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0384  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.91 
 
 		 319 aa  143  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.512992 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0808  oligopeptide ABC transporter, permease  29.39 
 
 		 316 aa  142  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282065  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0997  oligopeptide ABC transporter, permease protein  29.39 
 
 		 316 aa  143  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.28482e-62 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.52 
 
 		 328 aa  142  6e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1059  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 		 400 aa  142  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.543295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.12 
 
 		 322 aa  142  6e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.8 
 
 		 321 aa  142  8e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0405  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.8 
 
 		 321 aa  142  8e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.11 
 
 		 322 aa  142  8e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.205475 
 
 
-
 
NC_004310  BR1585  dipeptide ABC transporter, permease protein  34.28 
 
 		 335 aa  142  9e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.280526  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0823  oligopeptide ABC transporter, permease  29.09 
 
 		 316 aa  142  9e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.164685  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.09 
 
 		 316 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00583871  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0219  oligopeptide ABC transporter permease  30.27 
 
 		 307 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0242  oligopeptide ABC transporter, permease protein  30.27 
 
 		 307 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.12 
 
 		 400 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5256  putative ABC transporter (permease protein)  32.73 
 
 		 313 aa  141  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.173409  normal  0.132635 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4598  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.48 
 
 		 319 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.930375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.87 
 
 		 335 aa  142  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1001  oligopeptide ABC transporter, permease protein  28.79 
 
 		 316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0185  dipeptide transporter permease DppB  32.76 
 
 		 339 aa  140  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.446355  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0449  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.49 
 
 		 316 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.143195 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0350  nickel ABC transporter, permease subunit NikB  30.15 
 
 		 310 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.92 
 
 		 334 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.96 
 
 		 320 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000461837  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.34 
 
 		 320 aa  140  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0617346  normal  0.17443 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.84 
 
 		 315 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03394  dipeptide transporter  30.06 
 
 		 339 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0169  Alkaline phosphatase  30.06 
 
 		 339 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03345  hypothetical protein  30.06 
 
 		 339 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3988  dipeptide transporter permease DppB  30.06 
 
 		 339 aa  139  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3862  dipeptide transporter permease DppB  30.06 
 
 		 339 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3742  dipeptide transporter permease DppB  30.06 
 
 		 339 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4035  dipeptide transporter permease DppB  30.06 
 
 		 339 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1080  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.01 
 
 		 307 aa  139  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.810626  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0172  dipeptide transporter permease DppB  30.06 
 
 		 339 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1411  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.03 
 
 		 319 aa  139  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4911  dipeptide transporter permease DppB  32.76 
 
 		 381 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1530  dipeptide ABC transporter, permease protein  33.92 
 
 		 335 aa  139  4.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.755182  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.18 
 
 		 332 aa  139  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.739242 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.52 
 
 		 306 aa  139  4.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.52 
 
 		 306 aa  139  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.022065  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1978  oligopeptide ABC transporter, permease protein  32.43 
 
 		 314 aa  139  6e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  33.57 
 
 		 339 aa  139  6e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>