More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3500 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3500  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
355 aa  707    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0791674  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.36 
 
 
400 aa  297  2e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71017  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1059  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.85 
 
 
400 aa  297  2e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.543295  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2363  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.68 
 
 
397 aa  287  2e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.476785  normal  0.026678 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.98 
 
 
331 aa  238  2e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.3 
 
 
336 aa  229  4e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000111157 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1411  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.87 
 
 
319 aa  229  5e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2257  oligopeptide ABC transporter, permease component  37.02 
 
 
321 aa  229  6e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2554  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  37.02 
 
 
321 aa  229  7e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.84 
 
 
332 aa  226  4e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.739242 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5300  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  39.44 
 
 
316 aa  226  5.0000000000000005e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340844  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.91 
 
 
335 aa  225  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.238126  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4598  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.46 
 
 
319 aa  224  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.930375  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.17 
 
 
321 aa  224  2e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0384  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.03 
 
 
319 aa  223  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.512992 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3876  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  38.4 
 
 
336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.11 
 
 
321 aa  220  3e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0714  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.77 
 
 
335 aa  220  3e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299286  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0823  oligopeptide ABC transporter, permease  36.29 
 
 
316 aa  218  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.164685  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0808  oligopeptide ABC transporter, permease  35.8 
 
 
316 aa  218  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282065  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.29 
 
 
316 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00583871  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.82 
 
 
320 aa  216  4e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.82 
 
 
320 aa  216  4e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.766968 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0946  oligopeptide ABC transporter, permease protein  36 
 
 
316 aa  216  5e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0997  oligopeptide ABC transporter, permease protein  36 
 
 
316 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.28482e-62 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.98 
 
 
326 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.75386 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4385  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.71 
 
 
316 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.02052e-22 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.76 
 
 
321 aa  214  9.999999999999999e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1434  peptide ABC transporter, permease protein  36.29 
 
 
326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393954  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1869  ABC-type transport system protein  36.83 
 
 
324 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.46 
 
 
333 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391976  normal  0.26803 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.67 
 
 
334 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1001  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.71 
 
 
316 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3297  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.2 
 
 
335 aa  213  5.999999999999999e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.204315  normal  0.181035 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.08 
 
 
322 aa  212  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1620  peptide ABC transporter, permease protein  38.76 
 
 
321 aa  212  7.999999999999999e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.911317 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.06 
 
 
331 aa  212  9e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00166089  hitchhiker  0.0087818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.41 
 
 
326 aa  212  9e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
324 aa  212  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0004  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.14 
 
 
320 aa  211  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.101832  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1766  peptide ABC transporter, permease protein  38.76 
 
 
321 aa  211  1e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0859  oligopeptide ABC transporter permease  35.71 
 
 
316 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0909  oligopeptide ABC transporter permease protein  35.71 
 
 
316 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0836804  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.26 
 
 
325 aa  210  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0873  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.72 
 
 
320 aa  210  4e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0307537  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0210  oligopeptide ABC transporter, permease  34.81 
 
 
318 aa  209  7e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0232  oligopeptide ABC transporter permease protein  34.81 
 
 
318 aa  209  7e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0249  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.81 
 
 
318 aa  209  8e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5079  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.52 
 
 
318 aa  209  8e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823719  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0267  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.81 
 
 
318 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.64 
 
 
318 aa  208  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.27 
 
 
321 aa  208  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0692911 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.11 
 
 
319 aa  207  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2322  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  36.62 
 
 
348 aa  207  3e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0206  oligopeptide ABC transporter, permease  35.25 
 
 
318 aa  206  4e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.26 
 
 
325 aa  206  5e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.52 
 
 
318 aa  206  6e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.24 
 
 
306 aa  204  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.76 
 
 
321 aa  202  6e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.7 
 
 
347 aa  202  6e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.699223  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1142  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.28 
 
 
315 aa  202  7e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.301395  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.13 
 
 
313 aa  200  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.03 
 
 
321 aa  198  9e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.793124  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1355  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.54 
 
 
319 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.26 
 
 
328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00108438  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4534  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.08 
 
 
336 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.463935 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.43 
 
 
321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181911  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.55 
 
 
315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.951594  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.71 
 
 
320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000461837  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6954  oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  36.16 
 
 
319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0219  oligopeptide ABC transporter permease  34.01 
 
 
307 aa  197  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0242  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.01 
 
 
307 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2469  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.13 
 
 
345 aa  196  6e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0245  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.98 
 
 
339 aa  196  7e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.76239  normal  0.869294 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0246  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.04 
 
 
307 aa  195  9e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0542782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4233  oligopeptide transport, system permease  34.65 
 
 
306 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4245  oligopeptide ABC transporter, permease  34.65 
 
 
306 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2593  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.16 
 
 
343 aa  194  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.8 
 
 
313 aa  194  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.18227  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4392  oligopeptide ABC transporter permease  34.65 
 
 
306 aa  193  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4732  oligopeptide ABC transporter permease protein  34.65 
 
 
306 aa  193  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4610  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.37 
 
 
306 aa  193  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.65 
 
 
349 aa  193  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176103  hitchhiker  0.0000268959 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0434  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.03 
 
 
358 aa  193  5e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0891876 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4332  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.65 
 
 
349 aa  193  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.68 
 
 
320 aa  191  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000183272  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2789  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.24 
 
 
306 aa  191  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.84 
 
 
319 aa  191  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0405  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.06 
 
 
321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.57 
 
 
319 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.540957  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.06 
 
 
321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
351 aa  188  9e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.61865 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0408  peptide ABC transporter, permease protein  33.52 
 
 
319 aa  188  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.599742  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.35 
 
 
345 aa  187  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.16813  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.18 
 
 
321 aa  187  3e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000859188  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.26 
 
 
334 aa  187  3e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.65 
 
 
319 aa  187  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0351  peptide ABC transporter, permease protein  33.52 
 
 
319 aa  186  4e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1214  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.63 
 
 
344 aa  186  4e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3142  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.74 
 
 
326 aa  186  5e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.115178  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>