More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1951 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1951  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
325 aa  653    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.497916  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7099  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.9 
 
 
327 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.52 
 
 
328 aa  369  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10217  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.13 
 
 
326 aa  366  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.501197  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.91 
 
 
325 aa  341  1e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.161114  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3928  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.99 
 
 
325 aa  339  4e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4002  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.99 
 
 
325 aa  339  4e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3943  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.99 
 
 
325 aa  339  5e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.104136 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.91 
 
 
325 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.982552  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11309  oligopeptide-transport integral membrane protein ABC transporter oppB  51.07 
 
 
325 aa  323  3e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.87 
 
 
327 aa  307  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08480  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  47.38 
 
 
344 aa  306  3e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3278  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.96 
 
 
325 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000912922  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0817  ABC peptide/nickel transport system permease protein  48.71 
 
 
336 aa  278  7e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.65 
 
 
327 aa  263  3e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1254  ABC transporter, permease protein  39.76 
 
 
327 aa  242  7e-63  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000126232 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.99 
 
 
328 aa  227  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.72 
 
 
327 aa  225  8e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0920  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.69 
 
 
330 aa  218  1e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.311537 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1117  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.63 
 
 
327 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.559973  normal  0.0105879 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31130  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  35.82 
 
 
338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7778  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.06 
 
 
322 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.413078 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4534  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.43 
 
 
336 aa  187  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.463935 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1834  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.74 
 
 
326 aa  186  5e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.17 
 
 
319 aa  183  4.0000000000000006e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.23 
 
 
332 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1632  putative ABC transporter permease  33.33 
 
 
336 aa  175  8e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214794  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.22 
 
 
331 aa  173  3.9999999999999995e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0759  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.11 
 
 
306 aa  168  1e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000961636  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0873  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.94 
 
 
320 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0307537  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  31.88 
 
 
339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.93 
 
 
322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.82 
 
 
321 aa  162  8.000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1184  dipeptide ABC transporter, permease protein  35.38 
 
 
333 aa  162  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0134333  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.32 
 
 
309 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.24 
 
 
334 aa  161  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6954  oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  33.64 
 
 
319 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 
331 aa  160  3e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00166089  hitchhiker  0.0087818 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1434  peptide ABC transporter, permease protein  31.9 
 
 
326 aa  160  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393954  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.86 
 
 
335 aa  159  5e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0351  peptide ABC transporter, permease protein  31.61 
 
 
319 aa  159  6e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1620  peptide ABC transporter, permease protein  31.21 
 
 
321 aa  159  7e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.911317 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2257  oligopeptide ABC transporter, permease component  33.33 
 
 
321 aa  159  9e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0408  peptide ABC transporter, permease protein  31.61 
 
 
319 aa  158  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.599742  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.1 
 
 
308 aa  158  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.452226  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1323  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.88 
 
 
341 aa  157  2e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0238996  normal  0.501572 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.18 
 
 
321 aa  157  2e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000859188  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.18 
 
 
318 aa  157  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0267  oligopeptide ABC transporter, permease protein  29.79 
 
 
318 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0004  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.54 
 
 
320 aa  156  6e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.101832  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0405  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.99 
 
 
321 aa  155  7e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2554  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  33 
 
 
321 aa  155  7e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.99 
 
 
321 aa  155  7e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.42 
 
 
324 aa  155  9e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.32 
 
 
321 aa  155  9e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.94 
 
 
319 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.540957  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0206  oligopeptide ABC transporter, permease  29.57 
 
 
318 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0139  dipeptide transporter permease DppB  35.56 
 
 
351 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.19 
 
 
321 aa  155  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.69 
 
 
319 aa  155  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4291  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
338 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4598  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.89 
 
 
319 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.930375  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0779  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.41 
 
 
313 aa  154  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.38 
 
 
315 aa  154  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000049983  normal  0.670386 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.88 
 
 
318 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.22 
 
 
321 aa  154  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5079  oligopeptide ABC transporter, permease protein  29.88 
 
 
318 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823719  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  35.48 
 
 
339 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0246  oligopeptide ABC transporter, permease protein  30.82 
 
 
307 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0542782  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1411  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.66 
 
 
319 aa  152  7e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.52 
 
 
321 aa  152  7e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181911  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0089  dipeptide transporter permease DppB  34.15 
 
 
339 aa  152  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297234  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.94 
 
 
333 aa  152  8e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391976  normal  0.26803 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.39 
 
 
321 aa  152  8e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0692911 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0434  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.13 
 
 
358 aa  152  8e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0891876 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4074  dipeptide transporter permease DppB  34.15 
 
 
339 aa  152  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.13 
 
 
312 aa  152  8.999999999999999e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.16 
 
 
332 aa  152  8.999999999999999e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.739242 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13695  dipeptide-transport integral membrane protein ABC transporter dppB  33.63 
 
 
308 aa  151  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0848221 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.29 
 
 
307 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal  0.353351 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0045  dipeptide transporter permease DppB  34.41 
 
 
339 aa  151  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0384  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.58 
 
 
319 aa  151  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.512992 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6675  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.69 
 
 
306 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432582  normal  0.593084 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4683  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.28 
 
 
305 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  35.71 
 
 
336 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4097  dipeptide transporter permease DppB  34.77 
 
 
339 aa  151  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.94 
 
 
334 aa  150  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.33 
 
 
308 aa  150  2e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5642  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  34.56 
 
 
316 aa  150  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0251003  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0131  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.92 
 
 
326 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2835  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.29 
 
 
307 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.301492 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1905  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.41 
 
 
365 aa  150  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.074595  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0210  oligopeptide ABC transporter, permease  30.4 
 
 
318 aa  150  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0232  oligopeptide ABC transporter permease protein  30.4 
 
 
318 aa  150  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.23 
 
 
320 aa  149  5e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000461837  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.4 
 
 
306 aa  149  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0655426  normal  0.0792402 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0050  dipeptide transporter permease DppB  34.05 
 
 
339 aa  149  5e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0249  oligopeptide ABC transporter, permease protein  30.4 
 
 
318 aa  149  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1996  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.61 
 
 
305 aa  149  6e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00478237  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  34.49 
 
 
336 aa  149  6e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>